金黄色葡萄球菌及其甲氧苯青霉素耐药性的MALDI-TOF MS鉴定

用MALDI_TOFMS细菌指纹图谱鉴定细菌 ,建立区分金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株的MALDI_TOFMS分析方法,检测了76株从临床标本中分离得到的金黄色葡萄球菌 ,用软件进行聚类分析,以nuc(耐热核酸酶)基因和mecA(耐药)基因聚合酶链反应(PCR)检测结果为参照 ,74 %的菌株经MALDI_TOFMS给出了正确的鉴定结果;金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株的质谱图有很大差别 ,各自有其特征峰;经过软件聚类分析 ,76株实验菌株划分为敏感群和耐药群;与PCR检测结果对照 ,有7株菌PCR检测mecA基因为阴性 ,而经MALDI_TOFMS鉴定为耐药株 ,表型鉴定表明其中有5株为敏感株;利用细菌指纹图谱和数据库检索对大多数菌株实现了正确鉴定;MALDI_TOFMS分辨率高 ,甚至可以区分株间的差异 ,实现了区分金黄色葡萄球菌甲氧苯青霉素耐药株和敏感株;

新分离登革2型病毒福建株基因组全序列的测定

目的 对新近分离的导致 1999年福建省登革热流行的登革 2型病毒FJ 10株进行基因组全序列测定及系统发生树分析。方法 利用RT PCR和 5′、3′RACE法扩增FJ 10株cDNA ,并进行克隆测序。利用DNASTAR软件的Clustal方法绘制系统发生树。结果 FJ 10株基因组全长 10 72 3个核苷酸 ,有 1个单一开放读码框架 (ORF ,第 97～ 10 2 6 9nt) ,编码 3391个氨基酸 ,5′和 3′非编码区长度分别为 96和 45 4个核苷酸。通过与标准株NGC株和我国其他地区分离株DEN2 0 4、43、44株比较 ,核苷酸同源性分别为 94.0 %、92 .8%、93.9%和 93.9% ,氨基酸同源性分别为 97.9%、97.2 %、97.7%和97.9%。以 47株登革 2型病毒E/NS1连接区 2 40个核苷酸序列进行系统发生树分析 ,福建株与印度尼西亚和斯里兰卡分离株亲缘关系较近 ,同属于第Ⅳ基因型。结论 FJ 10株基因组全序列一级结构与其他登革 2型病毒类似 ,其基因型不同于我国其他地区分离株DEN2 0 4、43和 44株。