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基于微卫星标记的克氏原螯虾种群遗传多样性和遗传结构分析
被引量:
3
1
作者
高杨
田灿
+8 位作者
姜京京
唐永凯
张成锋
冯文荣
李冰
陈铭
卢泽宇
苏胜彦
朱健
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第5期191-199,共9页
为了解当前我国不同地区克氏原螯虾种群的遗传背景情况,以期为人工养殖、新品种选育和资源保护提供参考依据。选取江苏洪泽湖(HZH)、湖北洪湖(HH)、湖南洞庭湖(DTH)、山东微山湖(WSH)、安徽巢湖(CH)、江西鄱阳湖(PYH)6个典型区域的克氏...
为了解当前我国不同地区克氏原螯虾种群的遗传背景情况,以期为人工养殖、新品种选育和资源保护提供参考依据。选取江苏洪泽湖(HZH)、湖北洪湖(HH)、湖南洞庭湖(DTH)、山东微山湖(WSH)、安徽巢湖(CH)、江西鄱阳湖(PYH)6个典型区域的克氏原螯虾群体作为研究对象,采用14对微卫星引物对来自6个地区的168份样品进行遗传多样性检测。结果可知,各群体不同标记位点的等位基因数在3~14之间,平均期望杂合度为0.81,平均多态信息含量分布在0.42~0.59之间,各群体均处于中高度遗传多样性水平。6个群体均发生一定程度Hardy-Weinberg平衡偏离,仅有少数位点在单一群体满足Hardy-Weinberg平衡,同时连锁不平衡检测发现9个连锁座位对处于不平衡状态。遗传距离结果显示,6个克氏原螯虾群体的遗传一致度(I)处于0.1278~0.6439之间,各群体间遗传距离(D)处于0.4402~2.0573之间。群体间遗传分化指数(Fst)接近0.5,反映出群体间的基因交流水平较弱,存在高度的遗传分化。AMOVA分析发现,39.65%的遗传变异来源于群体间,97.99%的遗传变异来源于个体间。遗传结构数据显示,K=5时,6个群体间存在显著的结构差异。上叙结果可知,6个地区的克氏原螯虾群体具有丰富的遗传多样性,群体间出现了显著分化,可通过隔离保种、杂交、选择育种等方式保护利用克氏原螯虾的种质资源,为我国克氏原螯虾产业的持续健康发展提供良种支持。
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关键词
克氏原螯虾
遗传多样性
微卫星标记
遗传结构
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职称材料
题名
基于微卫星标记的克氏原螯虾种群遗传多样性和遗传结构分析
被引量:
3
1
作者
高杨
田灿
姜京京
唐永凯
张成锋
冯文荣
李冰
陈铭
卢泽宇
苏胜彦
朱健
机构
南京
农业
大学无锡
渔业
学院
农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室/农业农村部渔综合种养生态重点实验室
上海海洋大学水产科学国家级
实验
教学示范中心
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第5期191-199,共9页
基金
中国水产科学研究院基本科研业务费(编号:2022XT01)
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(编号:JBGS[2021]123)
中国水产科学研究院淡水渔业研究中心基本科研业务费项目(编号:2021JBFM21)。
文摘
为了解当前我国不同地区克氏原螯虾种群的遗传背景情况,以期为人工养殖、新品种选育和资源保护提供参考依据。选取江苏洪泽湖(HZH)、湖北洪湖(HH)、湖南洞庭湖(DTH)、山东微山湖(WSH)、安徽巢湖(CH)、江西鄱阳湖(PYH)6个典型区域的克氏原螯虾群体作为研究对象,采用14对微卫星引物对来自6个地区的168份样品进行遗传多样性检测。结果可知,各群体不同标记位点的等位基因数在3~14之间,平均期望杂合度为0.81,平均多态信息含量分布在0.42~0.59之间,各群体均处于中高度遗传多样性水平。6个群体均发生一定程度Hardy-Weinberg平衡偏离,仅有少数位点在单一群体满足Hardy-Weinberg平衡,同时连锁不平衡检测发现9个连锁座位对处于不平衡状态。遗传距离结果显示,6个克氏原螯虾群体的遗传一致度(I)处于0.1278~0.6439之间,各群体间遗传距离(D)处于0.4402~2.0573之间。群体间遗传分化指数(Fst)接近0.5,反映出群体间的基因交流水平较弱,存在高度的遗传分化。AMOVA分析发现,39.65%的遗传变异来源于群体间,97.99%的遗传变异来源于个体间。遗传结构数据显示,K=5时,6个群体间存在显著的结构差异。上叙结果可知,6个地区的克氏原螯虾群体具有丰富的遗传多样性,群体间出现了显著分化,可通过隔离保种、杂交、选择育种等方式保护利用克氏原螯虾的种质资源,为我国克氏原螯虾产业的持续健康发展提供良种支持。
关键词
克氏原螯虾
遗传多样性
微卫星标记
遗传结构
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
S966.12 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于微卫星标记的克氏原螯虾种群遗传多样性和遗传结构分析
高杨
田灿
姜京京
唐永凯
张成锋
冯文荣
李冰
陈铭
卢泽宇
苏胜彦
朱健
《江苏农业科学》
北大核心
2023
3
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