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利用SNP标记鉴定荔枝杂种后代
被引量:
6
1
作者
刘伟
肖志丹
+5 位作者
蒋侬辉
杨晓燕
袁沛元
邱燕萍
凡超
向旭
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期647-654,共8页
本研究利用SNP标记对‘白糖罂’ב禾虾串’、‘禾虾串’ב白糖罂’及‘白糖罂’ב无核荔’3个荔枝杂交组合F_1代共131个单株的真实性进行了鉴定。利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,从155个均匀分布在荔枝基...
本研究利用SNP标记对‘白糖罂’ב禾虾串’、‘禾虾串’ב白糖罂’及‘白糖罂’ב无核荔’3个荔枝杂交组合F_1代共131个单株的真实性进行了鉴定。利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,从155个均匀分布在荔枝基因组的SNP标记中筛选出在上述杂交亲本中表现为不同纯合基因型的SNP位点;结合高分辨率熔解曲线技术,利用上述SNP位点对各个组合的杂交苗F_1代进行了SNP分型。SNP分型结果显示,杂种F1代的基因型呈现杂合基因型、父本纯合基因型和母本纯合基因型3类。针对‘白糖罂’ב禾虾串’、‘禾虾串’ב白糖罂’及‘白糖罂’ב无核荔’3个杂交组合,均只利用一对纯合共显性SNP标记即成功完成所有F_1代单株的鉴定,真杂种率分别为93.6%、96.8%和72.5%。SNP标记首次成功应用于荔枝3个F_1杂交群体的鉴定,为今后荔枝杂交育种中的真假杂种鉴定提供了可借鉴手段。
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关键词
荔枝
杂种鉴定
SNP
原文传递
利用SNP分子标记分析化橘红种质资源
被引量:
15
2
作者
赵俊生
杨晓燕
+5 位作者
曾祥有
钟声
方静
罗剑斌
曾运友
向旭
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1203-1211,共9页
本研究利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型。结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的...
本研究利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型。结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的多态性,共呈现出11种基因型,其中化橘红基因型有9种,SNP位点平均杂合度为0.363 1,多样性信息含量(PIC)平均值为0.266 3;21个SNP位点可将24份样本分为3类,化州橘红种质单独聚为一类,表明SNP分子标记将成为化州橘红种质资源评价及品种鉴定的一项重要工具。另外,化橘红种质资源可能存在更多的品系,而不止是当前认为的"正毛"、"密叶正毛"、"副毛"、"光青"、"假西洋"、"黄龙"6个品系,且化橘红种质资源存在着同名异物和同物异名的现象。本研究为化橘红种质资源鉴定提供了有效的方法和依据,应用前景广阔。
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关键词
化州橘红
单核苷酸多态性
高分辨率熔解曲线
聚类分析
原文传递
KClO3处理对龙眼花芽形成关键基因CONSTANS表达的影响
被引量:
4
3
作者
翟世博
苏良辰
+2 位作者
方妍妮
李玲
郭栋梁
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1429-1437,共9页
龙眼是重要的热带、亚热带水果,成花不稳定是生产上亟待解决的关键问题。用KClO_3诱导龙眼成花已在生产中得到广泛应用,但其机理尚不清楚。前期研究分析了KClO_3诱导龙眼成花的差异表达基因库,筛选并获得17个CONSTANS(CO)家族基因,通过...
龙眼是重要的热带、亚热带水果,成花不稳定是生产上亟待解决的关键问题。用KClO_3诱导龙眼成花已在生产中得到广泛应用,但其机理尚不清楚。前期研究分析了KClO_3诱导龙眼成花的差异表达基因库,筛选并获得17个CONSTANS(CO)家族基因,通过对基因序列的分析以及与已知的拟南芥CO家族基因比对发现该17个基因可分成五类。分析KClO_3处理诱导龙眼花芽形成过程中CO家族基因表达变化,与对照组比,在KClO_3处理后10 d,Lon48093和Lon69124基因的表达量上调;处理后20 d时,Lon47354、Lon64693、Lon65155、Lon82398和Lon85671基因的表达量上调;Lon64611和Lon88911基因的表达量在处理后10 d和20 d都比对照组高;与对照组相比,Lon20604、Lon77442、Lon73542、Lon68235、Lon81334、Lon62117、Lon71926和Lon87048基因的表达量在KClO_3处理后的各个时期始终下调。推测在KClO_3处理龙眼植株诱导提前成花过程中的不同阶段,Lon82398、Lon48093、Lon47354、Lon64693、Lon65155、Lon85671、Lon88911、Lon64611和Lon69124基因起正调控作用;Lon20604、Lon77442和Lon73542基因起负调控作用;Lon68235、Lon81334、Lon62117、Lon71926和Lon87048基因对该过程的影响很小。
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关键词
龙眼
CONSTANS基因
KClO3处理
基因表达
花芽形成
原文传递
题名
利用SNP标记鉴定荔枝杂种后代
被引量:
6
1
作者
刘伟
肖志丹
蒋侬辉
杨晓燕
袁沛元
邱燕萍
凡超
向旭
机构
广东省
热带
亚热带
果树
研究
重点
实验室
农业部
南
亚热带
果树
生物学
与遗传
资源
利用
重点
实验室
广东省
农业
科学院
果树
研究所
华
南
师范大学生命
科学
学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期647-654,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31272135
31401829)
+1 种基金
广东省自然科学基金项目(2014A030310467)
广东省省属科研机构竞争性支持类项目(2014B070706018)共同资助
文摘
本研究利用SNP标记对‘白糖罂’ב禾虾串’、‘禾虾串’ב白糖罂’及‘白糖罂’ב无核荔’3个荔枝杂交组合F_1代共131个单株的真实性进行了鉴定。利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,从155个均匀分布在荔枝基因组的SNP标记中筛选出在上述杂交亲本中表现为不同纯合基因型的SNP位点;结合高分辨率熔解曲线技术,利用上述SNP位点对各个组合的杂交苗F_1代进行了SNP分型。SNP分型结果显示,杂种F1代的基因型呈现杂合基因型、父本纯合基因型和母本纯合基因型3类。针对‘白糖罂’ב禾虾串’、‘禾虾串’ב白糖罂’及‘白糖罂’ב无核荔’3个杂交组合,均只利用一对纯合共显性SNP标记即成功完成所有F_1代单株的鉴定,真杂种率分别为93.6%、96.8%和72.5%。SNP标记首次成功应用于荔枝3个F_1杂交群体的鉴定,为今后荔枝杂交育种中的真假杂种鉴定提供了可借鉴手段。
关键词
荔枝
杂种鉴定
SNP
Keywords
Litchi(Litchi chinensis Sonn
)
Hybrid identification
Single nucleotide polymorphism
分类号
S667.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
利用SNP分子标记分析化橘红种质资源
被引量:
15
2
作者
赵俊生
杨晓燕
曾祥有
钟声
方静
罗剑斌
曾运友
向旭
机构
茂名市水果
科学
研究所
农业部
南
亚热带
果树
生物学
与遗传
资源
利用
重点
实验室
广东省
农业
科学院
果树
研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1203-1211,共9页
基金
广东省省属科研机构竞争性支持类项目(2014B070706018)
广东省科技计划项目(2014A020208008)
广东省农业标准化项目共同资助
文摘
本研究利用高分辨率熔解曲线(high resolution melting,HRM)方法对21份化橘红及3份近缘种质蜜柚和黄皮的25个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点进行了基因分型。结果表明,所有样品在其中21个SNP位点表现出较好的多态性,共呈现出11种基因型,其中化橘红基因型有9种,SNP位点平均杂合度为0.363 1,多样性信息含量(PIC)平均值为0.266 3;21个SNP位点可将24份样本分为3类,化州橘红种质单独聚为一类,表明SNP分子标记将成为化州橘红种质资源评价及品种鉴定的一项重要工具。另外,化橘红种质资源可能存在更多的品系,而不止是当前认为的"正毛"、"密叶正毛"、"副毛"、"光青"、"假西洋"、"黄龙"6个品系,且化橘红种质资源存在着同名异物和同物异名的现象。本研究为化橘红种质资源鉴定提供了有效的方法和依据,应用前景广阔。
关键词
化州橘红
单核苷酸多态性
高分辨率熔解曲线
聚类分析
Keywords
Exocarpium Citri Grandis, Single nucleotide polymorphism, High resolution melting, Hierarchicalclustering
分类号
S666 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
KClO3处理对龙眼花芽形成关键基因CONSTANS表达的影响
被引量:
4
3
作者
翟世博
苏良辰
方妍妮
李玲
郭栋梁
机构
广东省
植物发育
生物
工程
重点
实验室
华
南
师范大学生命
科学
学院
遵义医
学院
珠海校区
生物
工程系
农业部南亚热带果树生物学与遗传利用重点实验室广东省农业科学院果树研究所
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1429-1437,共9页
基金
国家自然科学基金青年科学基金(31301741)
国家荔枝龙眼产业技术体系荔枝龙眼树管理岗位(CARS-33-12)
广东省农业科学院院长基金(201309)~~
文摘
龙眼是重要的热带、亚热带水果,成花不稳定是生产上亟待解决的关键问题。用KClO_3诱导龙眼成花已在生产中得到广泛应用,但其机理尚不清楚。前期研究分析了KClO_3诱导龙眼成花的差异表达基因库,筛选并获得17个CONSTANS(CO)家族基因,通过对基因序列的分析以及与已知的拟南芥CO家族基因比对发现该17个基因可分成五类。分析KClO_3处理诱导龙眼花芽形成过程中CO家族基因表达变化,与对照组比,在KClO_3处理后10 d,Lon48093和Lon69124基因的表达量上调;处理后20 d时,Lon47354、Lon64693、Lon65155、Lon82398和Lon85671基因的表达量上调;Lon64611和Lon88911基因的表达量在处理后10 d和20 d都比对照组高;与对照组相比,Lon20604、Lon77442、Lon73542、Lon68235、Lon81334、Lon62117、Lon71926和Lon87048基因的表达量在KClO_3处理后的各个时期始终下调。推测在KClO_3处理龙眼植株诱导提前成花过程中的不同阶段,Lon82398、Lon48093、Lon47354、Lon64693、Lon65155、Lon85671、Lon88911、Lon64611和Lon69124基因起正调控作用;Lon20604、Lon77442和Lon73542基因起负调控作用;Lon68235、Lon81334、Lon62117、Lon71926和Lon87048基因对该过程的影响很小。
关键词
龙眼
CONSTANS基因
KClO3处理
基因表达
花芽形成
Keywords
longan
CONSTANS gene
KClO3 treatment
gene expression
flower bud formation
分类号
S667.2 [农业科学—果树学]
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用SNP标记鉴定荔枝杂种后代
刘伟
肖志丹
蒋侬辉
杨晓燕
袁沛元
邱燕萍
凡超
向旭
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016
6
原文传递
2
利用SNP分子标记分析化橘红种质资源
赵俊生
杨晓燕
曾祥有
钟声
方静
罗剑斌
曾运友
向旭
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2016
15
原文传递
3
KClO3处理对龙眼花芽形成关键基因CONSTANS表达的影响
翟世博
苏良辰
方妍妮
李玲
郭栋梁
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
4
原文传递
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