利用SNP分子标记分析鉴定不同形态的化橘红(Citrus grandis var.tomentosa)单株

【目的】在对比化橘红不同品种形态特征的基础上,利用SNP(Single nucleotide polymorphism)分子标记分析其遗传差异,以期获得能准确鉴定化橘红不同品种的有效方法。【方法】依据叶片及果实茸毛特征,从不同果园采集9个代表性的化橘红单株,分别对果实及叶片进行测定。采用14个SNP位点,结合高分辨率熔解曲线分型(High resolution melting analysis,HRMA)技术对供试材料进行遗传多样性分析。【结果】同一采样地‘光青’单株8和9,仅叶片宽度存在显著差异,果实及叶片的其他特性差异不明显;同一采样地单株样4(‘正毛’)与样7(‘副毛’)的叶形指数及果形指数差异不显著,但叶片及果实的其他特性差异显著;同一果园不同品种的单株叶片及果实部分特性差异不显著。不同果园的同一品种单株,因栽培条件及管理等方面的差异,叶片及果实的部分特征存在显著差异。采用14个SNP位点可将9个化橘红样本有效区分,平均PIC(Polymorphism information content)值为0.29,所有SNP位点的平均自交系数为-0.09。【结论】仅凭形态特征很难区分化橘红不同品种的单株,而采用14个SNP位点能有效鉴定化橘红不同品种的单株。