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肾性高血压大鼠粪便中miRNA的差异表达及富集分析
1
作者
陈张军
王占黎
+1 位作者
胡海
于慧
《国际老年医学杂志》
2023年第5期518-523,共6页
目的本研究旨在检测肾性高血压大鼠粪便中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路富集分析。方法将16只SD大鼠随机分为假手术组(Sham组,8只)、模型组(Model组,8只),Sham组分离左肾动脉不结扎,Model组分离左肾动脉并用0.2 mm...
目的本研究旨在检测肾性高血压大鼠粪便中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路富集分析。方法将16只SD大鼠随机分为假手术组(Sham组,8只)、模型组(Model组,8只),Sham组分离左肾动脉不结扎,Model组分离左肾动脉并用0.2 mm银夹结扎。收集粪便,并用miRNA测序筛选差异表达miRNA,对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集。结果术后血压比较,Model组收缩压水平高于Sham组,差异有统计学意义(P<0.05)。粪便miRNA差异分析中,Model组有6个差异表达的miRNA(P<0.001),其中4个上调miRNA(rno-miR-335-5p、rno-miR-466-3p、rno-miR-218a-5p、rno-miR-3557-3p)、2个下调miRNA(rno-let-7a-5p、rno-miR-200b-5p),共预测miRNA下游靶基因288个,GO富集主要集中在蛋白质定位、NK T细胞分化和酶活性等方面;KEGG通路富集主要集中在mTOR信号通路、MAPK信号通路等。结论在肾性高血压大鼠粪便中miRNA呈显著差异表达,其靶基因可能通过免疫细胞活化的生物学功能及mTOR和MAPK等信号通路参与高血压的发展。
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关键词
肾性高血压
MIRNA
靶基因
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题名
肾性高血压大鼠粪便中miRNA的差异表达及富集分析
1
作者
陈张军
王占黎
胡海
于慧
机构
包头医学院基础医学院与法医学院
内蒙古自治区疾病相关生物标志物重点实验室
出处
《国际老年医学杂志》
2023年第5期518-523,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(82060084,82260092)。
文摘
目的本研究旨在检测肾性高血压大鼠粪便中异常表达的miRNA,并对其靶基因进行生物学功能及通路富集分析。方法将16只SD大鼠随机分为假手术组(Sham组,8只)、模型组(Model组,8只),Sham组分离左肾动脉不结扎,Model组分离左肾动脉并用0.2 mm银夹结扎。收集粪便,并用miRNA测序筛选差异表达miRNA,对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能和KEGG通路富集。结果术后血压比较,Model组收缩压水平高于Sham组,差异有统计学意义(P<0.05)。粪便miRNA差异分析中,Model组有6个差异表达的miRNA(P<0.001),其中4个上调miRNA(rno-miR-335-5p、rno-miR-466-3p、rno-miR-218a-5p、rno-miR-3557-3p)、2个下调miRNA(rno-let-7a-5p、rno-miR-200b-5p),共预测miRNA下游靶基因288个,GO富集主要集中在蛋白质定位、NK T细胞分化和酶活性等方面;KEGG通路富集主要集中在mTOR信号通路、MAPK信号通路等。结论在肾性高血压大鼠粪便中miRNA呈显著差异表达,其靶基因可能通过免疫细胞活化的生物学功能及mTOR和MAPK等信号通路参与高血压的发展。
关键词
肾性高血压
MIRNA
靶基因
Keywords
Renal hypertension
miRNA
Target gene
分类号
R544.14 [医药卫生—心血管疾病]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肾性高血压大鼠粪便中miRNA的差异表达及富集分析
陈张军
王占黎
胡海
于慧
《国际老年医学杂志》
2023
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