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基于系统中药学的丹参活血化瘀功效标志物研究 被引量:54
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作者 马婧 陈茜 +3 位作者 边亚倩 陈紫军 乔延江 张燕玲 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第14期3259-3265,共7页
活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系... 活血化瘀中药在临床上应用广泛,然而由于中药成分的多样性与人体相互作用的复杂性,难以应用传统质控成分表征其整体功效。系统中药学是研究中药功效的有效手段,体现了整体论与还原论的辨证统一。丹参为活血化瘀的常用中药,该研究基于系统中药学的理论,构建了"功效-药理药效-靶点-成分"多维网络,探讨了丹参活血化瘀功效标志物的发现。首先,对活血化瘀功效系统进行研究,基于中药功效-药理数据库获得了活血化瘀功效(功能)相关性最大的药理药效(边界),然后应用DrugBank数据库获得相应药理作用的药物靶标集(结构),运用STRING数据库构建活血化瘀相关靶标的蛋白-蛋白互作网络(关系),通过评价靶点拓扑参数筛选网络中的关键靶点(元素)。最后基于分子对接进行丹参酚酸类及丹参酮类成分辨识,预测丹参活血化瘀功效标志物。该研究结果表明丹参活血化瘀功效的潜在标志物为丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A、丹参酮Ⅰ,其中,丹酚酸B、丹酚酸A、丹参酮Ⅱ_A已有文献报道其具有活血化瘀功效相关的抗血小板聚集、抗血栓、保护心脑血管等药理药效。该研究基于系统中药学,初步探讨了丹参活血化瘀功效标志物,为功效标志物的发现提供了研究方法,为中药整体质量控制提供了参考。 展开更多
关键词 系统中药学 功效标志物 活血化瘀 丹参
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基于系统中药学的金银花清热解毒功效标志物研究 被引量:35
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作者 彭莎 霍晓乾 +3 位作者 霍梦琪 刘亚楠 张燕玲 乔延江 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第14期3275-3281,共7页
金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信... 金银花的清热解毒功效历史悠久,历版《中国药典》对其功效的描述较为稳定,是研究功效标志物的优良载体。该文以系统中药学理论为指导,以金银花清热解毒功效系统为研究示例,明确了金银花清热解毒功效系统的元素(活性成分),划定了边界(信号通路),建立了结构(系统动力学模型),辨识了其药理、药效和功效相应的系统功能(清热解毒功效),探讨系统动力学模型在发现中药功效标志物中的应用。通过建立生物体内白细胞介素-1(interleukin 1,IL-1)、白细胞介素-6(interleukin 6,IL-6)相关动力学模型,通过动态网络预测金银花中不同成分及成分组合在IL-1,IL-6信号通路中相关因子的表达,以期发现金银花清热解毒功效标志物。研究结果表明在IL-1通路中,绿原酸较低浓度下,与芳樟醇组合对IL-1下游Jun氨基末端激酶(Jun N-terminal kinase,JNK)抑制率更高;在IL-6通路中,绿原酸浓度越大,与木犀草素组合对IL-6下游C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)抑制率更高;提示基于IL-1信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和芳樟醇,基于IL-6信号通路的金银花清热解毒功效的潜在功效标志物为绿原酸和木犀草素。该研究为中药功效标志物的发现提供了方法学指导。 展开更多
关键词 系统中药学 金银花 清热解毒 IL-1 IL-6 功效标志物
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基于系统中药学的丹参组分功效研究 被引量:25
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作者 任越 霍梦琪 +3 位作者 马婧 凤雯晴 乔延江 张燕玲 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第14期3251-3258,共8页
该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,... 该研究旨在基于系统中药学的理论,利用文献挖掘、生物网络构建的技术,探讨建立丹参中2类代表性物质丹参酮类与丹酚酸类的功效系统,从中药功效系统的基本单元、基本单元间结构、关系、研究对象的边界、系统的功能展开中药功效系统研究,从而在分子层面阐释2类成分表征的整体功效。该研究运用文献挖掘收集了2类成分功效系统的元素,依据生物过程划定了功效系统的边界,依据KEGG中元素之间的相互作用(关系)构建了功效系统的结构,并从药理、药效和功效3个层次分析了功效系统的功能,揭示中药功效系统的科学内涵。丹参组分功效研究结果显示,丹酚酸类功效系统中作用靶点(元素)201个,靶点集(边界)划分为12类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)12个;丹参酮类功效系统中作用靶点(元素)189个,靶点集(边界)划分为11类,依据元素之间的相互作用(关系)构建的通路网络(结构)11个。基于丹酚酸类与丹参酮类功效系统中元素、边界、关系、结构,对功效系统的功能辨识研究发现,二者在药理、药效层次上功能不同,但在功效层次上功能相同,均产生活血祛瘀、清心除烦、安神的功效。该研究基于系统中药学构建了丹参中2类组分的功效系统,建立了中药还原论与整体论的桥梁,从本质上阐释2类组分表征的整体功效。 展开更多
关键词 系统中药学 丹参 丹参酮类 丹酚酸类 功效系统
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基于Mpro和PLP筛选潜在抗新型冠状病毒中药研究 被引量:36
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作者 马婧 霍晓乾 +4 位作者 陈茜 朱卫星 姚美村 乔延江 张燕玲 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1219-1224,共6页
新型冠状病毒感染疫情发展迅速,中药在这场防治疫情的战争中发挥着积极作用,已有大量确有疗效的方剂应用于临床。然而由于中药具有多成分、多靶点、多途径协同作用的特点,传统的抗病毒中药筛选研究受限于实验室条件和实验周期,极大地限... 新型冠状病毒感染疫情发展迅速,中药在这场防治疫情的战争中发挥着积极作用,已有大量确有疗效的方剂应用于临床。然而由于中药具有多成分、多靶点、多途径协同作用的特点,传统的抗病毒中药筛选研究受限于实验室条件和实验周期,极大地限制了筛选速度。该文基于分子对接进行潜在抗新型冠状病毒中药的筛选,通过获取2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶(3CL protease,Mpro)和冠状病毒木瓜样蛋白酶(papain-like protease,PLP)的晶体结构,对中药化学成分数据库(traditional Chinese medicine database,TCMD 2009)进行基于分子对接的虚拟筛选,选择打分值排名前100的成分作为潜在抗新型冠状病毒活性的中药成分,并对成分来源中药进行频数统计,挑选命中成分数目较多的中药作为潜在抗新型冠状病毒活性的中药。研究结果显示,基于Mpro靶点筛选获得潜在抗新型冠状病毒活性成分12322个,代表性活性成分有紫菀五肽A、川芎嗪、丹酚酸B等,筛选得到的中药为生姜、紫菀、三七、川芎、丹参、干姜、瞿麦、大黄、肉苁蓉等;基于PLP靶点筛选获得潜在抗新型冠状病毒活性成分11294个,代表性活性成分有姜酮酚、白果醇、阿魏酸等,筛选得到的中药为党参、羌活、生姜、白果、川芎、瓜蒌、白芍、补骨脂、苦参、三七、当归等。结合文献报道的基于分子对接筛选的血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)靶点抑制活性候选中药,该文在湖南省新型冠状病毒肺炎中医药诊疗方案的基础上,将Mpro抑制、PLP抑制和ACE2抑制候选中药针对该疫情的合理应用进行了探讨,分析结果表明,PLP抑制活性筛选获得的瓜蒌及ACE2筛选获得的贝母包含于桑贝止嗽散、小陷胸汤之中,有清化热痰之功效,主治痰热壅肺所致的痰多咳喘或燥痰犯肺、干咳少痰、咯痰不爽,可应用于病毒作用初期外邪闭肺所致的咳嗽微喘等证型;Mpro抑制活性筛选获得的中药大黄佐以PLP筛选获得的瓜蒌,清泻腑气,二者包含于麻杏石甘汤、宣白承气汤中,可应用于疾病重症期邪热壅肺、疫毒闭肺以致腑实里结等证型;ACE2抑制活性筛选获得的中药桑叶、金银花及连翘包含于桑菊饮和银翘散中,轻清宣透,可应用于疾病初期温邪犯肺及咳嗽微喘等证型。研究结果旨在为进一步开展中医药应对新型冠状病毒疫情的治疗方案提供参考。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 分子对接 2019-nCoV冠状病毒3CL水解酶 冠状病毒木瓜样蛋白酶 血管紧张素转换酶2 中药
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基于系统中药学的中药功效标志物发现与应用 被引量:28
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作者 霍梦琪 彭莎 +3 位作者 任越 舒展 张燕玲 乔延江 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第14期3245-3250,共6页
中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面... 中药质量标志物是近年来提出的中药质量控制的新概念,是中药现代研究的热点问题。中药的功效是在中医药理论指导下对中药治疗作用的高度概括,在此基础上发掘中药的功效标志物对中药现代化发展具有重要意义。然而传统的基于中药宏观层面的单味药材和饮片研究,或者基于靶点生物学效应的药物研究策略与中药多种成分及对靶点的弱作用、低选择性的整体性作用特点存在较大差异,因此如何从分子层面选取代表性成分表征中药整体功效特点是建立中药功效标志物的研究难点。该研究将质量标志物的概念和方法引入中药功效研究中,以系统中药学的研究方法,以代表性的研究成果为例,论述了中药功效标志物的内涵及其发现和确定的原则、常用研究思路和方法,为中药功效标志物的研究和发现提供新的思路。 展开更多
关键词 系统中药学 网络药理学 功效标志物 数据挖掘 中药质量控制
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基于系统中药学的黄芪补气潜在功效标志物的发掘 被引量:39
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作者 边亚倩 李晶 +3 位作者 彭莎 吕恬仪 张燕玲 乔延江 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第14期3266-3274,共9页
黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有... 黄芪为补气之圣药,具有补气升阳,益卫固表的功效。随着黄芪化学成分研究的日益深入,其在临床上的应用也更加广泛。该研究基于系统中药学的理论,从分子层面表征黄芪补气功效,发掘黄芪补气功效标志物。通过TCMSP及ChEMBL数据库构建黄芪有效成分-靶点数据库,明确黄芪补气功效系统所涉及的靶点(元素)。根据靶点间的关系构建蛋白互作网络,并依据分子复合物检测算法(MCODE)划分网络模块(结构),以黄芪发挥补气功效(功能)的药理作用划定其补气功效系统的边界。从成分、靶点、药效层次上探讨表征黄芪补气功效成分。结果表明,黄芪中的常春藤皂苷元、槲皮素、毛蕊异黄酮、刺芒柄花素、华良姜素、异鼠李素、黄芪皂苷Ⅲ、黄芪异黄烷苷等8个关键成分可作用于17个关键靶点构成的8个功能模块,参与G蛋白偶联受体信号通路、脂质代谢过程、氮化合物代谢的正调控、细胞程序性死亡调控、脂肪酸代谢过程的调节等生命过程,产生调节机体免疫功能、强心、保护心肌细胞、改善物质代谢、抗氧化等药理作用,进而发挥补气的功效。该研究基于系统中药学的理论,从分子网络的水平发掘了黄芪补气的功效标志物,为中药药效物质基础阐释及中药质量控制研究提供了新思路。今后可聚焦于这些成分进行配伍研究,进而对黄芪补气功效展开更深入的研究,并加强相应疾病的药理机制及相关制剂的开发。 展开更多
关键词 系统中药学 黄芪 补气 功效标志物
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基于VEGFR,FGFR探讨中药方剂对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用 被引量:27
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作者 边亚倩 马婧 +2 位作者 任越 张燕玲 乔延江 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1481-1487,共7页
自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内... 自2020年2月以来,随着疫情防控力度的加强,大批新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者治愈出院。肺纤维化是冠状病毒肺炎的后遗症之一,其不仅引起呼吸困难和肺功能指标的恶化,还具有死亡率高、预后不良的特点,严重影响患者的生活质量。血管内皮生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)、成纤维生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR)通过介导参与肺纤维化进程的信号转导通路,抑制成纤维细胞增殖、活化与迁移,影响肺纤维的发生发展。基于中医整体观念指导下的中药方剂对肺纤维化具有良好的治疗效果,因此基于VEGFR和FGFR探讨中药对COVID-19后遗症肺纤维化的干预作用具有重要意义。该研究运用分子对接技术,通过构建VEGFR和FGFR靶点的对接模型,以原配体-CDCOKER ENERGY打分值的80%为阈值筛选方剂中的活性成分,并寻找其来源中药。通过检索成分命中率高于30%中药的性味归经及功效信息,构建中药-归经网络及中药-功效网络,结合《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第七版)》中2首、《中医疫病名方精选》中9首针对疫病恢复期的方剂,探讨了中药方剂治疗肺纤维化的规律。研究结果显示,基于VEGFR和FGFR靶点筛选获得潜在抗肺纤维化的活性成分分别为959,1 047个。VEGFR和FGFR靶点成分命中率达到30%以上的中药为黄芩、南沙参、半夏、薏苡仁、陈皮、白扁豆、白芍、桑叶、党参、玉竹、芦根、柴胡、黄芪、人参、西洋参、玄参、当归、丹参。分析上述中药性味归经及功效信息可知,治疗肺纤维化的中药主归肺(degree=14)、脾(degree=8)经,功效以补虚(degree=9)为主。结合恢复期推荐处方进行分析,上述中药在恢复期方剂中均有出现,其中以气阴两虚处方与补中益气汤命中中药数目最多。本次新型冠状病毒肺炎的主要证候为湿热蕴肺,内蕴邪热久羁,易于耗气伤津,临床观察显示,恢复期患者多处于余邪未尽、正气尚未恢复的阶段,主要表现为肺脾气虚,结合该研究分析,新型冠状病毒肺炎患者在此阶段,应当注重扶正祛邪,健脾益肺,进而缓解病毒导致的肺纤维化症状。研究结果旨在为中医药治疗COVID-19恢复期后遗症肺纤维化提供数据参考,并为临床用药提供指导。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 肺纤维化 分子对接 血管内皮细胞生长因子受体 成纤维生长因子受体 中药方剂
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抗新型冠状病毒方剂基于花生四烯酸代谢通路防治“细胞因子风暴”的研究 被引量:68
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作者 任越 姚美村 +4 位作者 霍晓乾 谷宇 朱卫星 乔延江 张燕玲 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1225-1231,共7页
新型冠状病毒(2019-nCoV)肺炎疫情暴发以来,发展迅速,形势严峻,受到国内外广泛关注。发表在《柳叶刀》杂志的研究指出新型冠状病毒的感染与"细胞因子风暴"(cytokine storm)存在密切联系。"细胞因子风暴"是机体对病... 新型冠状病毒(2019-nCoV)肺炎疫情暴发以来,发展迅速,形势严峻,受到国内外广泛关注。发表在《柳叶刀》杂志的研究指出新型冠状病毒的感染与"细胞因子风暴"(cytokine storm)存在密切联系。"细胞因子风暴"是机体对病毒、细菌等外界刺激产生的一种过度免疫反应。当病毒攻击机体时,刺激分泌产生大量的炎症因子,如白细胞介素(interleukin,IL)、干扰素(interferon,IFN)、趋化因子(C-X-C motif chemokine,CXCL)等,进而引发细胞因子级联反应。随着炎症因子渗出,多种细胞因子在组织、器官中异常升高,干扰免疫系统,造成机体过度免疫应答反应,引起肺部细胞的弥漫性损伤,肺部出现纤维化,且导致多器官损伤,严重则可能导致死亡。花生四烯酸(arachidonic acid,AA)代谢通路主要用于合成炎症介质,可介导多种炎症因子的产生,如单核细胞趋化蛋白-1(monocyte chemotactic protein 1,MCP-1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、IL、IFN等,与炎症的发生发展及消退均有密切联系。因此抑制花生四烯酸代谢通路,有助于抑制机体炎症因子的释放,缓解"细胞因子风暴"。该研究基于花生四烯酸代谢通路关键靶点抑制剂的药效团模型,筛选中药化学成分数据库(traditional Chinese medicine database,TCMD 2009)。选择匹配值(fit value)大于0.7的成分作为潜在活性成分,对活性成分来源中药进行频数统计,结合《国家新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第六版)》中的中药方剂进行分析,获取对"细胞因子风暴"具有潜在治疗作用的方剂。结果显示,对花生四烯酸代谢通路具有抑制作用的成分为厚朴木脂体Ⅰ、忍冬苦苷、大黄素甲醚-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷等,中药为厚朴、生姜、金银花、大黄、丹参、黄芩、栀子、人参、牛蒡子、绵马贯众、赤芍、山药。结合新型冠状病毒治疗方剂进行分析,发现藿香正气胶囊、金花清感颗粒、连花清瘟胶囊、清肺排毒汤、血必净注射液、热毒宁注射液、痰热清注射液对花生四烯酸通路具有潜在抑制作用,可能通过缓解"细胞因子风暴"抑制新型冠状病毒引起的肺炎。该研究旨在为新型冠状病毒临床用药提供指导,并为探索治疗新型冠状病毒中药及方剂的治疗机制和临床用药提供参考。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 “细胞因子风暴” 花生四烯酸代谢通路 虚拟筛选 中药
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基于活血功效靶标的血府逐瘀汤有效成分群辨识研究 被引量:16
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作者 马婧 任越 +2 位作者 赵博文 林力 张燕玲 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第23期6243-6250,共8页
血府逐瘀汤为活血化瘀的经典方剂,在临床上应用广泛且疗效显著,然而其发挥活血功效的物质基础尚不清晰,因此该研究基于活血功效关键靶点进行血府逐瘀汤有效成分群的辨识研究。研究通过检索中药化学成分数据库收集血府逐瘀汤化学成分,基... 血府逐瘀汤为活血化瘀的经典方剂,在临床上应用广泛且疗效显著,然而其发挥活血功效的物质基础尚不清晰,因此该研究基于活血功效关键靶点进行血府逐瘀汤有效成分群的辨识研究。研究通过检索中药化学成分数据库收集血府逐瘀汤化学成分,基于实验室前期获得的活血功效关键靶点构建其分子对接模型,与血府逐瘀汤成分进行对接,挑选每个靶点打分值前5且含量可测的活性成分作为方剂的潜在活血有效成分群。关键药效成分以及高含量成分为中药发挥药效的核心,中药整体活性在一定程度上可表征关键药效成分以及高含量成分的活性。研究以抗血小板聚集药效部分表征活血功效,通过寻找血府逐瘀汤潜在有效成分群的来源中药进行体内活性实验以验证有效成分群的准确性。结果显示,基于中药成分数据库筛选获得血府逐瘀汤210个化学成分,与活血功效关键靶点进行分子对接,挑选每个靶点打分值前5且含量可测的活性成分,最终选择川芎嗪、毛蕊花糖苷、柚皮苷、橙皮苷、甘草苷、新橙皮苷、羟基红花黄色素A、阿魏酸、梓醇、甘草酸作为血府逐瘀汤发挥活血功效的潜在有效成分群。将其来源中药川芎、地黄、枳壳、甘草及红花进行抗血小板聚集活性验证,血小板聚集率为9.82%±5.11%。与空白组相比,实验组可显著抑制二磷酸腺苷(adenosine diphosphate,ADP)诱导的血小板聚集(P<0.01),验证了有效成分群的准确性。该研究为血府逐瘀汤的物质基础研究提供了指导,同时也为经典名方的开发利用提供了研究思路。 展开更多
关键词 血府逐瘀汤 活血功效 分子对接 有效成分群
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