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古树基因组数据库开发与应用
1
作者
张辉
冯一健
+7 位作者
韦上校
李华
彭海旭
吴邵元
马晓燕
李玮瑜
王森
郑轶
《北京农学院学报》
2024年第3期109-115,共7页
【目的】建立古树基因组数据库存储古树名木及相关物种的基因组遗传信息数据,实现基因组数据的浏览、查询、在线分析。【方法】依据《古树名木普查技术规范》的相关规定,树龄在100年以上的树木为古树。参照记录在册的古树品种,从相关数...
【目的】建立古树基因组数据库存储古树名木及相关物种的基因组遗传信息数据,实现基因组数据的浏览、查询、在线分析。【方法】依据《古树名木普查技术规范》的相关规定,树龄在100年以上的树木为古树。参照记录在册的古树品种,从相关数据库收集国内外已公开发表的同种古树基因组等遗传信息,同时对收集的古树基因组进行整理与校正、基因功能注释,遗传数据进行整理与分析,将其标准化的数据上传到开发的古树基因组数据库。【结果】开发了古树基因组数据库并完成上线,实现了对古树基因组等遗传数据存储、查询、浏览。目前共收录了等89种古树名木及相关物种的基因组及比较基因组数据,为研究古树在复杂环境胁迫下长寿的分子机制提供数据支持。开发了在线数据挖掘工具,实现了遗传信息基于BLAST的序列比对、序列批量提取、GO和KEGG的富集分析、共线性分析等功能,为研究古树优良基因提供数据分析平台。【结论】古树及相关物种基因组遗传信息的整理归纳,古树基因组数据库的开发应用为古树科研用户提供了极大的便利,为有效地保护古树资源提供新的见解。
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关键词
古树
基因组
数据库
数据挖掘
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职称材料
加入WTO对中国大豆产业的影响
2
作者
崔宇星
王靖萱
+3 位作者
郝娜
胡嘉琪
李玮瑜
路平
《安徽农业科学》
CAS
2022年第6期211-214,共4页
加入世界贸易组织(WTO)后,我国经济迅速全球化,对我国大豆产业发展及贸易均产生了不可忽视的影响。为应对加入WTO产生的影响,我国对大豆产业政策进行了一系列的变革,并取得了较为显著的成效。以2001年为时间界点,整理、归纳了我国加入WT...
加入世界贸易组织(WTO)后,我国经济迅速全球化,对我国大豆产业发展及贸易均产生了不可忽视的影响。为应对加入WTO产生的影响,我国对大豆产业政策进行了一系列的变革,并取得了较为显著的成效。以2001年为时间界点,整理、归纳了我国加入WTO前后与大豆生产相关的年度数据(1991—2019年),对我国加入WTO后大豆产业、贸易的变化趋势进行了详细的探讨,同时对我国加入WTO前后采取的大豆产业政策进行分析,并针对我国大豆产业发展的不足提出了可行性的建议,以期为我国大豆产业的再度崛起提供理论性参考。
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关键词
大豆
WTO
政策
变化趋势
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职称材料
植物CNGC功能研究进展
3
作者
任俊达
王靖萱
+3 位作者
崔宇星
王春
李玮瑜
杜亮
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2021年第6期895-903,共9页
从结构上看,环状核苷酸门控离子通道(CNGC)是孔-环阳离子通道的超家族,广泛存在于动植物中。根据系统亲缘关系,拟南芥CNGC家族可分为5个亚家族群,它们在抗病、花粉管生长、抗冷热胁迫、抵抗重金属离子毒害和抗盐抗旱等多种信号途径中发...
从结构上看,环状核苷酸门控离子通道(CNGC)是孔-环阳离子通道的超家族,广泛存在于动植物中。根据系统亲缘关系,拟南芥CNGC家族可分为5个亚家族群,它们在抗病、花粉管生长、抗冷热胁迫、抵抗重金属离子毒害和抗盐抗旱等多种信号途径中发挥重要作用,协助植物细胞应对各种生物与非生物胁迫。主要对CNGC基因家族的结构和生物学功能进行综述性介绍,并对近年来关于该基因家族的最新研究进展进行系统阐述,为深入理解CNGC基因家族在植物生长和发育过程中的重要作用提供帮助。
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关键词
环状核苷酸门控离子通道
植物
生物学功能
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职称材料
题名
古树基因组数据库开发与应用
1
作者
张辉
冯一健
韦上校
李华
彭海旭
吴邵元
马晓燕
李玮瑜
王森
郑轶
机构
北京农学院
北京农学院生物信息中心
北京农学院
出处
《北京农学院学报》
2024年第3期109-115,共7页
基金
2023年北京农学院揭榜挂帅项目
北京农学院青年教师科研创新能力提升计划(QJKC2022044)。
文摘
【目的】建立古树基因组数据库存储古树名木及相关物种的基因组遗传信息数据,实现基因组数据的浏览、查询、在线分析。【方法】依据《古树名木普查技术规范》的相关规定,树龄在100年以上的树木为古树。参照记录在册的古树品种,从相关数据库收集国内外已公开发表的同种古树基因组等遗传信息,同时对收集的古树基因组进行整理与校正、基因功能注释,遗传数据进行整理与分析,将其标准化的数据上传到开发的古树基因组数据库。【结果】开发了古树基因组数据库并完成上线,实现了对古树基因组等遗传数据存储、查询、浏览。目前共收录了等89种古树名木及相关物种的基因组及比较基因组数据,为研究古树在复杂环境胁迫下长寿的分子机制提供数据支持。开发了在线数据挖掘工具,实现了遗传信息基于BLAST的序列比对、序列批量提取、GO和KEGG的富集分析、共线性分析等功能,为研究古树优良基因提供数据分析平台。【结论】古树及相关物种基因组遗传信息的整理归纳,古树基因组数据库的开发应用为古树科研用户提供了极大的便利,为有效地保护古树资源提供新的见解。
关键词
古树
基因组
数据库
数据挖掘
Keywords
ancient trees
genome
database
data mining
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
加入WTO对中国大豆产业的影响
2
作者
崔宇星
王靖萱
郝娜
胡嘉琪
李玮瑜
路平
机构
农业应用新技术
北京
市重点实验室
北京农学院
科学技术处
出处
《安徽农业科学》
CAS
2022年第6期211-214,共4页
基金
北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目(2021YJS046)
2021年北京农学院本科生科研训练项目(KX2021006)
服务乡村振兴的农业双创平台建设与成果示范应用(Z181100002418002)。
文摘
加入世界贸易组织(WTO)后,我国经济迅速全球化,对我国大豆产业发展及贸易均产生了不可忽视的影响。为应对加入WTO产生的影响,我国对大豆产业政策进行了一系列的变革,并取得了较为显著的成效。以2001年为时间界点,整理、归纳了我国加入WTO前后与大豆生产相关的年度数据(1991—2019年),对我国加入WTO后大豆产业、贸易的变化趋势进行了详细的探讨,同时对我国加入WTO前后采取的大豆产业政策进行分析,并针对我国大豆产业发展的不足提出了可行性的建议,以期为我国大豆产业的再度崛起提供理论性参考。
关键词
大豆
WTO
政策
变化趋势
Keywords
Soybean
World Trade Organization
Policy
Trends
分类号
S-9 [农业科学]
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职称材料
题名
植物CNGC功能研究进展
3
作者
任俊达
王靖萱
崔宇星
王春
李玮瑜
杜亮
机构
北京农学院
农业农村部华北都市农业重点实验室
北京农学院
农业应用新技术
北京
市重点实验室
北京
林业大学
北京
林木分子设计育种高精尖创新
中心
北京
林业大学
生物
科学与技术
学院
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2021年第6期895-903,共9页
基金
北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目,北京农学院青年教师科研基金(QNKJ202001)
2021年度北京市教委科技计划一般项目(KM202110020010)共同资助。
文摘
从结构上看,环状核苷酸门控离子通道(CNGC)是孔-环阳离子通道的超家族,广泛存在于动植物中。根据系统亲缘关系,拟南芥CNGC家族可分为5个亚家族群,它们在抗病、花粉管生长、抗冷热胁迫、抵抗重金属离子毒害和抗盐抗旱等多种信号途径中发挥重要作用,协助植物细胞应对各种生物与非生物胁迫。主要对CNGC基因家族的结构和生物学功能进行综述性介绍,并对近年来关于该基因家族的最新研究进展进行系统阐述,为深入理解CNGC基因家族在植物生长和发育过程中的重要作用提供帮助。
关键词
环状核苷酸门控离子通道
植物
生物学功能
Keywords
cyclic nucleotide gated ion channel
plant
biological function
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
古树基因组数据库开发与应用
张辉
冯一健
韦上校
李华
彭海旭
吴邵元
马晓燕
李玮瑜
王森
郑轶
《北京农学院学报》
2024
0
下载PDF
职称材料
2
加入WTO对中国大豆产业的影响
崔宇星
王靖萱
郝娜
胡嘉琪
李玮瑜
路平
《安徽农业科学》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
3
植物CNGC功能研究进展
任俊达
王靖萱
崔宇星
王春
李玮瑜
杜亮
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2021
0
下载PDF
职称材料
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