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啤酒花矮化类病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
被引量:
11
1
作者
赵晓丽
周琦
+1 位作者
孙宁
邓丛良
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期309-314,共6页
为建立一种快速、灵敏、特异的定量检测啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)的实时荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)方法,设计了2对引物及特异探针,体外转录制备了RNA标准品,绘制标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏度和重复性进行评估。建...
为建立一种快速、灵敏、特异的定量检测啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)的实时荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)方法,设计了2对引物及特异探针,体外转录制备了RNA标准品,绘制标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏度和重复性进行评估。建立的定量标准曲线C t值与模板拷贝数对数之间呈良好的线性关系,相关系数R2为0.9988,扩增效率为95%;该方法的特异性好,与啤酒花潜隐类病毒(HLVd)、葡萄黄斑类病毒1(GYSVd-1)、葡萄黄斑类病毒2(GYSVd-2)和桃潜隐花叶类病毒(PLMVd)均无交叉反应;灵敏度为1.0×102拷贝/μL,比普通RT-PCR高10倍;试验内及试验间重复性试验的变异系数均小于3%。研究表明该方法适用于实际样品中HSVd的快速定量检测。
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关键词
啤酒花矮化类病毒
定量
检测
实时荧光定量RT—PCR
原文传递
应用纳米磁珠实时荧光定量PCR方法检测番茄黄化曲叶病毒
2
作者
赵晓丽
周琦
+1 位作者
孙宁
邓丛良
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期221-224,共4页
番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLcV)为双生病毒科(Geminiviridae)菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)成员,于1964年在以色列首次发现,目前我国已有15个省(自治区、直辖市)发现该病毒,TYLCV主要通过烟粉虱...
番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLcV)为双生病毒科(Geminiviridae)菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)成员,于1964年在以色列首次发现,目前我国已有15个省(自治区、直辖市)发现该病毒,TYLCV主要通过烟粉虱传播。
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关键词
黄化曲叶病毒
PCR方法
荧光定量
番茄
菜豆金色花叶病毒属
检测
实时
磁珠
原文传递
题名
啤酒花矮化类病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
被引量:
11
1
作者
赵晓丽
周琦
孙宁
邓丛良
机构
北京出入境检验检疫局植物实验室
东南大学
出处
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期309-314,共6页
基金
公益性行业(质检)科研专项(201110035)
文摘
为建立一种快速、灵敏、特异的定量检测啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)的实时荧光定量RT-PCR(RT-qPCR)方法,设计了2对引物及特异探针,体外转录制备了RNA标准品,绘制标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏度和重复性进行评估。建立的定量标准曲线C t值与模板拷贝数对数之间呈良好的线性关系,相关系数R2为0.9988,扩增效率为95%;该方法的特异性好,与啤酒花潜隐类病毒(HLVd)、葡萄黄斑类病毒1(GYSVd-1)、葡萄黄斑类病毒2(GYSVd-2)和桃潜隐花叶类病毒(PLMVd)均无交叉反应;灵敏度为1.0×102拷贝/μL,比普通RT-PCR高10倍;试验内及试验间重复性试验的变异系数均小于3%。研究表明该方法适用于实际样品中HSVd的快速定量检测。
关键词
啤酒花矮化类病毒
定量
检测
实时荧光定量RT—PCR
Keywords
Hop stunt viroid
quantification
detection
RT-qPCR
分类号
S412 [农业科学—植物保护]
原文传递
题名
应用纳米磁珠实时荧光定量PCR方法检测番茄黄化曲叶病毒
2
作者
赵晓丽
周琦
孙宁
邓丛良
机构
北京出入境检验检疫局植物实验室
东南大学
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期221-224,共4页
基金
公益性行业(质检)科研专项(201110035)
文摘
番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLcV)为双生病毒科(Geminiviridae)菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)成员,于1964年在以色列首次发现,目前我国已有15个省(自治区、直辖市)发现该病毒,TYLCV主要通过烟粉虱传播。
关键词
黄化曲叶病毒
PCR方法
荧光定量
番茄
菜豆金色花叶病毒属
检测
实时
磁珠
Keywords
Tomato yellow leaf curl virus
detection
MNP
qPCR
分类号
S436.412.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
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被引量
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1
啤酒花矮化类病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
赵晓丽
周琦
孙宁
邓丛良
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
11
原文传递
2
应用纳米磁珠实时荧光定量PCR方法检测番茄黄化曲叶病毒
赵晓丽
周琦
孙宁
邓丛良
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
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