融合生物学通路的变分自编码器在肺癌蛋白与代谢组学数据中的应用研究

目的本研究提出了融合生物学通路的变分自编码器(variational auto encoder,VAE),对蛋白质与代谢组学数据进行整合分析,并应用于肺腺癌患者探索可能的病理机制。方法为VAE的隐变量层节点赋予通路的实际意义,解码器按通路包含的生物学分子信息构建稀疏神经网络,使通路节点只与自身包含的分子连接,将隐变量作为提取的高级特征。对隐变量进行Kmeans聚类分析并使用调整兰德系数评估效果,引入基因差异表达分析方法limma探索差异表达通路,在北京大学人民医院胸外科肺腺癌患者的蛋白质与代谢组学数据中进行实例分析。结果融合生物学通路的VAE提取的高级特征不仅将聚类准确度提高了38%,还通过差异表达分析鉴别出了实性与亚实性结节肺腺癌间的差异通路。结论融合生物学通路的VAE可用于组学数据整合分析,其提取的高级特征具有通路表达活性的实际生物学意义。

肺混合密度磨玻璃结节中临床影像学信息对淋巴结转移的预测价值

背景与目的 部分胸部计算机断层扫描(computed tomography, CT)上表现为混合磨玻璃结节(mixed ground-glass nodules, mGGNs)的浸润性腺癌(invasive adenocarcinoma, IAC)会出现淋巴结转移,需由亚肺叶切除及纵隔淋巴结采样的术式改为肺叶切除及纵隔淋巴结清扫,故术前进行淋巴结转移的评估对指导手术切除范围及患者预后非常重要。本研究在病理为IAC的大样本mGGN队列中,探索能够预测淋巴结转移的临床和影像学指标,构建mGGN合并淋巴结转移的评估模型。方法 通过收集北京大学人民医院胸外科2014年1月-2019年10月收治的患者信息,筛选胸部CT病变表现为mGGN且术后病理证实为IAC的患者。统计入组患者的临床信息、影像学信息和淋巴结转移状态,并使用基于人工智能技术的肺结节辅助诊断系统(InferRead CT Lung)获取病例的平均密度、实性成分体积、实性成分百分比、质量等三维度量指标,构建CT密度直方图信息。通过应用R软件建立Lasso逻辑斯蒂回归模型分析评估临床影像学指标与淋巴结转移的相关性。结果 研究共纳入883例mGGN患者,其中12例(1.36%)出现淋巴结转移。mGGN中的临床影像信息与淋巴结转移的Lasso回归模型分析显示,既往恶性肿瘤病史、平均密度、实性成分平均密度、毛刺征和三维实性成分百分比具有参考意义。基于Lasso回归模型结果建立mGGN中淋巴结转移的评估模型,曲线下面积为0.899。结论 临床信息结合CT影像信息可以较准确评估mGGN的淋巴结转移情况。

手术切除小细胞肺癌生存预后分析及不同亚型生存比较

目的分析手术切除小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)的生存预后,并对比复合小细胞肺癌(combined small cell lung cancer,c-SCLC)与纯小细胞肺癌(pure small cell lung cancer,p-SCLC)的生存预后差异。方法纳入2000年10月~2022年10月我科行根治性手术切除的SCLC患者,收集临床、手术和病理资料,采用单因素和多因素Cox回归分析影响手术切除SCLC患者生存预后的因素。Kaplan-Meier法计算总生存率(overall survival,OS)和无病生存率(disease-free survival,DFS),log-rank检验进行生存曲线的对比。结果共纳入SCLC 138例,其中p-SCLC 108例,c-SCLC 30例。中位随访时间27.5月(4~164个月)。多因素Cox回归分析显示吸烟史和肿瘤TNM分期是手术切除SCLC的OS和DFS的独立预后因素(吸烟史OS HR=2.16,95%CI:1.17~4.01,P=0.014,DFS HR=2.08,95%CI:1.20~3.59,P=0.009;肿瘤TNM分期OS HR=3.59,95%CI:1.83~7.04,P<0.001,DFS HR=2.67,95%CI:1.47~4.88,P=0.001),年龄是OS的独立预后因素(HR=1.86,95%CI:1.01~3.44,P=0.046)。c-SCLC和p-SCLC的5年OS率(49.1%vs.55.8%,P=0.921)和5年DFS率(41.6%vs.46.2%,P=0.612)均未见显著差异。在N0患者中,c-SCLC和p-SCLC的5年OS率和DFS率也未见显著差异,但在N1-2患者中,c-SCLC的3年OS率和DFS率明显差于p-SCLC(OS率22.0%vs.50.4%,log-rankχ2=6.660,P=0.010;DFS率10.4%vs.39.9%,log-rankχ2=5.067,P=0.024)。结论手术切除SCLC的预后与吸烟史及肿瘤分期相关,手术切除的N0期c-SCLC生存预后与p-SCLC相似,但N1-2期c-SCLC生存预后明显差于p-SCLC。

《全球癌症统计数据2022》要点解读

2022年全球癌症数据统计于近期发布。该文立足于国际癌症研究机构(International Agency for Research on Cancer,IARC)最新的GLOBCAN数据,系统性分析全球185个国家36种癌症的发病和死亡情况。国际癌症负担在未来30年将继续加重,已成为包括中国等诸多国家面临的严峻公共卫生问题及社会问题。本文对全球最新癌症流行病学数据要点进行解读,关注癌症流行病学演变进程及未来发展趋势,旨在开阔肿瘤防治的国际视野,以期对我国肿瘤防治工作提供参考和指导。