中国在翻译后修饰的生物信息学研究领域的进展与前瞻

翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰预测,能够提供准确、简便和快速的研究方案,并产生有价值的信息为进一步实验研究提供参考。文章主要综述了中国生物信息学者在翻译后修饰生物信息学领域所取得的研究进展,包括修饰底物与位点预测的计算方法学设计与完善、在线或本地化工具的设计与维护、修饰相关数据库及数据资源的构建及基于修饰蛋白质组学数据的生物信息学分析。通过比较国内外的同类研究,发现优势和不足,并对未来的研究作出前瞻。

基于网络药理学的miRNA和环境因子相互作用分析与建模

近年来，越多越多的研究表明，microRNA（miRNA）作为一类重要的小分子miRNA和包括药物在内的许多环境因子有功能相互作用。然而，这两者的相互作用目前仍缺乏系统的分析和建模，而相关研究对于理解miRNA和环境因子相互关系，对于疾病的预防、诊断、治疗和预后具有潜在价值。在本文中，我们系统整理和注释了具有实验证据支持的miRNA一环紧因子相互作用数据，并基于网络药理学方法对上述数据进行了系统分析和建模。

网络药理学与药物靶点研究

网络药理学是近年来发展起来的新兴交叉学科，改变了以往“单一基因，单一靶点，单一疾病”的新药发现模式。网络药理学的出现对于新药的发现和药物的多靶点研究具有重要的意义，主要应用于新药的毒性预测以及药物的重新调整适用症两方面。

北京诊断相关组的分组过程和方法

诊断相关组在多个国家和地区广泛应用。不同国家和地区使用的DRGs都是与本土具体环境相适应的版本。北京诊断相关组（BJ—DRGs）是中国首个根据本地信息和政策环境而独立开发的DRGs系统。本文从BJ—DRGs分组原则、逻辑、方法等方面简要地介绍了BJ—DRGs划分和组合病例的技术问题，并以“耳鼻咽喉类疾病”为例，展示了NDRGs的分组过程。

诊断选择和手术操作对DRGs分组影响的分析

目的了解主要诊断、其他诊断、主要手术、其他手术等因素对DRGs（诊断相关组）分组的影响，通过分析影响分组的主要因素，提高DRGs分组数据的质量。方法根据1940份存在问题病历修正后重新进行DRGs分组的结果，利用SPSS13．0分析存在问题对DRGs分组的影响。结果将影响分组的438份病历根据主要诊断、其他诊断、主要手术、其他手术存在问题对项目进行分组，4组对分组的影响总体上有差异，组间两两比较，主要手术与其他手术比较，P〉0．0071；其余组间两两比较P〈0．0071。结论有问题的主要诊断对分组的影响率明显高于其他诊断、主要手术和其他手术，这一结论与BJ—DRGs分组的步骤即先将病例按照主要诊断进行分类的基本逻辑一致。手术名称正确选择对DRGs分组有影响，但主要手术与其他手术名称的影响率相接近。

lncRNA在结核病患者外周血的差异性表达

目的比较活动性肺结核患者、潜伏感染者与健康对照者外周血结核分枝杆菌特异性抗原刺激前后lncRNA1和lncRNA2的差异性表达,探讨其作为诊断结核分枝杆菌感染生物标志物的可能性。方法收集活动性肺结核患者、潜伏感染者和健康对照者全血,分别在特异性抗原刺激前后提取RNA,利用实时荧光定量PCR方法检测lncRNA1和lncRNA2的mRNA表达水平。应用ELISA检测血浆中IFN-γ和IL-2含量。结果结核分枝杆菌特异性抗原刺激前,结核病组、潜伏感染组全血lncRNA1相对表达量较健康对照组分别下降32%和64%;lncRNA2结核病组相对表达量是健康对照组的6.10倍;抗原刺激后,结核病组、潜伏感染组lncRNA1相对表达量较健康对照组分别下降33%和77%,lncRNA2潜伏感染组相对表达量较健康对照组下降84%。与刺激前相比,抗原刺激后健康对照组、结核病组lncRNA1相对表达量分别提高1.80倍和2.80倍,lncRNA2健康对照组、潜伏感染组分别提高3.50倍和1.86倍(P<0.05)。健康组与潜伏感染组、结核病组与潜伏感染组、健康组与结核病组lncRNA1ROC曲线下面积(AUC)分别为0.700、0.752和0.400,lncRNA2的AUC分别为0.702、0.465和0.762。在结核特异性蛋白刺激前,结核病组IFN-γ、IL-2含量均高于健康组(P<0.05),刺激后,结核病组及潜伏感染组与健康组相比较、潜伏感染组与结核病组相比较IFN-γ均增高(P<0.05)。与刺激前相比,刺激后3组IFN-γ、IL-2诱导表达量均显著增高(P<0.05)。结论活动性结核病、潜伏感染和健康对照者全血结核特异性抗原刺激前后lncRNA1和lncRNA2均出现差异性表达,结核病及潜伏感染者血浆IFN-γ含量增高。lncRNA1和lncRNA2可能是诊断肺结核感染的潜在生物标志物。