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基于UPLC-Q-Exactive-MS的T1期甲状腺乳头状癌血清非靶向代谢组学研究
被引量:
2
1
作者
贾晨晖
薄少军
+2 位作者
王田田
徐唯哲
徐先发
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2023年第11期668-679,共12页
目的使用非靶向血清代谢组学方法,借助超高效液相色谱-四级杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive-MS)联用平台,探讨T1期甲状腺乳头状癌(PTC)的分子标志物。方法使用UPLC-Q-Exactive-MS平台,对比分析2021-09-01-2022-04-15民航总...
目的使用非靶向血清代谢组学方法,借助超高效液相色谱-四级杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive-MS)联用平台,探讨T1期甲状腺乳头状癌(PTC)的分子标志物。方法使用UPLC-Q-Exactive-MS平台,对比分析2021-09-01-2022-04-15民航总医院耳鼻咽喉头颈外科接受甲状腺切除术的30例PTC患者和30名健康体检者的血清代谢物,使用SIMCAP 14.1进行主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)建模,结合经FDR校正的Mann-Whitney-Wilcoxon检验结果和代谢物在2组中的差异倍数等筛选潜在的小分子代谢标志物,并通过二元逻辑回归分析建立联合诊断模型。结果PCA、PLS-DA、OPLS-DA模型显示T1期PTC患者与健康体检者的血清代谢物存在显著差异。经OPLS-Loading plot分析,结合差异权重贡献值(VIP)>1,|log2FC|>1,且P<0.05,筛选出50种潜在差异性代谢物。其中D-甘油醛3-磷酸、氨基乙二酸、乙酰肉碱等11种代谢物在PTC患者血清中表达上调;PC(18∶1(11Z)/24∶1(15Z))、氨基甲酸、亮氨酸等39种代谢物在PTC患者血清中表达下调。寻找到与差异性代谢物相关的7条异常代谢通路,分别为戊糖磷酸途径、色氨酸代谢、赖氨酸降解、甘油磷脂代谢、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢、初级胆汁酸生物合成,这些代谢通路可能参与PTC患者血清代谢的病理生理过程。受试者工作特征曲线下面积>0.9的差异性代谢物有5种,分别为PC(18∶1(11Z)/24∶1(15Z))、琥珀酰丙酮、色氨酸、亮氨酸和脱氧胆酸。结论在T1期PTC患者的血清代谢过程中,糖代谢、脂质代谢、氨基酸代谢以及胆汁酸代谢出现明显改变。磷脂PC(18∶1(11Z)/24∶1(15Z))、琥珀酰丙酮、色氨酸、亮氨酸以及脱氧胆酸5种差异性代谢物可以用来区分T1期PTC患者与健康人群。
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关键词
UPLC-Q-Exactive-MS
甲状腺乳头状癌
血清代谢组学
主成分分析
生物标志物
原文传递
题名
基于UPLC-Q-Exactive-MS的T1期甲状腺乳头状癌血清非靶向代谢组学研究
被引量:
2
1
作者
贾晨晖
薄少军
王田田
徐唯哲
徐先发
机构
北京大学民航临床医学院·民航总医院耳鼻咽喉头颈外科
中国民用航空局民用航空
医学
中心(
民航
总
医院
)
出处
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2023年第11期668-679,共12页
基金
民航总医院医学科学研究基金(201909)。
文摘
目的使用非靶向血清代谢组学方法,借助超高效液相色谱-四级杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UPLC-Q-Exactive-MS)联用平台,探讨T1期甲状腺乳头状癌(PTC)的分子标志物。方法使用UPLC-Q-Exactive-MS平台,对比分析2021-09-01-2022-04-15民航总医院耳鼻咽喉头颈外科接受甲状腺切除术的30例PTC患者和30名健康体检者的血清代谢物,使用SIMCAP 14.1进行主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)建模,结合经FDR校正的Mann-Whitney-Wilcoxon检验结果和代谢物在2组中的差异倍数等筛选潜在的小分子代谢标志物,并通过二元逻辑回归分析建立联合诊断模型。结果PCA、PLS-DA、OPLS-DA模型显示T1期PTC患者与健康体检者的血清代谢物存在显著差异。经OPLS-Loading plot分析,结合差异权重贡献值(VIP)>1,|log2FC|>1,且P<0.05,筛选出50种潜在差异性代谢物。其中D-甘油醛3-磷酸、氨基乙二酸、乙酰肉碱等11种代谢物在PTC患者血清中表达上调;PC(18∶1(11Z)/24∶1(15Z))、氨基甲酸、亮氨酸等39种代谢物在PTC患者血清中表达下调。寻找到与差异性代谢物相关的7条异常代谢通路,分别为戊糖磷酸途径、色氨酸代谢、赖氨酸降解、甘油磷脂代谢、糖酵解/糖异生、果糖和甘露糖代谢、初级胆汁酸生物合成,这些代谢通路可能参与PTC患者血清代谢的病理生理过程。受试者工作特征曲线下面积>0.9的差异性代谢物有5种,分别为PC(18∶1(11Z)/24∶1(15Z))、琥珀酰丙酮、色氨酸、亮氨酸和脱氧胆酸。结论在T1期PTC患者的血清代谢过程中,糖代谢、脂质代谢、氨基酸代谢以及胆汁酸代谢出现明显改变。磷脂PC(18∶1(11Z)/24∶1(15Z))、琥珀酰丙酮、色氨酸、亮氨酸以及脱氧胆酸5种差异性代谢物可以用来区分T1期PTC患者与健康人群。
关键词
UPLC-Q-Exactive-MS
甲状腺乳头状癌
血清代谢组学
主成分分析
生物标志物
Keywords
UPLC-Q-Exactive-MS
papillary thyroid cancer
serum metabolomics
principal component analysis
biomarker
分类号
R736.1 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于UPLC-Q-Exactive-MS的T1期甲状腺乳头状癌血清非靶向代谢组学研究
贾晨晖
薄少军
王田田
徐唯哲
徐先发
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
北大核心
2023
2
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