最短α-螺旋的理论研究(英文)

在B3LYP/6-31+G**水平下的溶剂中优化得到4个残基长和5个残基长的α-螺旋.计算得到的骨架构象与蛋白质晶体结构的统计结果符合得很好.类似于一般的较长α-螺旋,观察到了C-端的散开.对很短的聚丙氨酸肽链,从焓上看310-螺旋明显比α-螺旋稳定,然而熵效应不利于310-螺旋结构.螺旋N2(N-端第二个残基)位上天冬氨酸侧链的加盖(Capping)效应明显使α-螺旋相对310-螺旋更加稳定.因而,在同样长度下α-螺旋比310-螺旋多的统计结果能够被理解.另外,最短的α-螺旋的C-端倾向于以β-转角结构结束.

天然海洋环酯肽Stereocalpin A中间体的合成

以D-苯丙氨酸为原料,经过硼氢化钠/碘还原后与三光气在碱性条件下环合得到Evans手性助剂(R)-4-苄基-2-噁唑烷酮(2),然后将其与丙酰氯缩合,经过LDA偶联、反式Aldol等反应,合成了天然环酯肽StereocalpinA中含有的独特结构片段,该片段对3种人实体瘤细胞系(HT-29,B16/F10,HepG2)具有中等细胞毒性,总收率为30.6%。结果表明,合成路线简便可行,反应产率高,立体选择性好。是制备该化合物的有效途径。

miRNA-210在胃癌转移细胞株中的表达及功能预测

目的:筛选胃癌(gastric cancer,GC)转移相关的差异表达微小RNA(micro RNA,miR NA),探讨miR NA-210与GC转移的可能机制.方法:应用mi RNA表达谱芯片筛选GC高转移细胞株RF48及低转移细胞株RF1的差异表达mi RNAs,RT-PCR检测mi RNA-210在7种GC细胞株中的表达情况,利用mi RWalk软件获得mi RNA-210的靶基因,通过David在线软件(包括GO分析及KEGG通路预测)分析mi R-210靶基因的可能生物学功能.结果:与RF1相比,mi RNA芯片在RF48细胞中共筛选出21个表达上调和15个表达下调的mi RNA,其中mi RNA-210在高转移细胞株RF48中的表达增高;RT-PCR结果显示m i R N A-210在高转移G C细胞株中表达增高(P<0.05);mi RWalk共获得155个mi RNA-210靶基因;GO分析及KEGG pathway分析得到miR NA-210靶基因功能,这些靶基因参与了肿瘤的发生、发展及转移.结论:利用mi RNA芯片技术获得了GC转移相关mi RNA表达谱;mi RNA-210的异常表达可能与GC的转移有关,为GC转移的早期诊断及发现新的治疗靶点奠定了基础.

GATA转录因子家族在细胞命运调控中的作用

在胚胎发育过程中,组织器官的形成依赖于干细胞在空间与时间上正确的定向分化、增殖,以及中间细胞的凋亡.这一细胞命运决定的过程必须被严格精确地调控,从而保证胚胎发育过程中组织器官形成得以顺利地进行.在此过程中,GATA转录因子家族扮演了不可或缺的角色,它们在胚层分化、造血系统和心脏形成、胸腺和肠道发育以及肿瘤发生中都起到了重要的作用.本文结合目前对GATA转录因子家族的研究和本课题组实验结果,介绍其在干细胞分化和维持,以及它们在细胞重编程中所起的作用.

S-2-(苄氧羰基)氨基-6-(三苯甲基)巯基-正己酸甲酯的简便合成

以L-赖氨酸为原料研究了新化合物S-2-(苄氧羰基)氨基-6-(三苯甲基)巯基-正己酸甲酯的合成,合成的总收率为27%.该方法简便高效,同时可作为半胱氨酸同系物的通用合成方法.

卤代噁唑的合成及其在Siphonazole合成中的应用

以二氯乙腈为起始原料,与苏氨酸甲酯在甲醇钠催化下形成噁唑啉中间体,经过消除、酸催化得到含有噁唑环的氯化物,碘化钾取代后与三苯基磷形成Wittg盐,后者与丁特基二甲基氯硅烷(TBS)保护的香兰素进行Wittig反应,得到只有潜在抗病毒活性的天然产物Siphonazole中的重要片段,总收率为44%。

胃癌转移相关miRNA的筛选及生物信息学分析

目的:筛选与胃癌转移相关的微小RNA(microRNA,miRNA,miR),并进行生物信息学分析。方法:应用miRNA芯片对胃癌低转移细胞株(RF-1和MKN28)和高转移细胞株(RF-48、NCI-N87和KATOⅢ)进行miRNA差异表达谱分析,筛选差异表达的miRNA;应用实时荧光定量-PCR法对差异表达的miR-192、miR-215和miR-194进行验证,应用miRfocus在线数据库对筛选获得的miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215进行靶基因预测及其信号转导通路进行分析。结果:与低转移细胞株比较,高转移细胞株中miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215的表达水平明显上调,miR-105、miR-767、miR-149、miR-205、miR-30a、miR-30d、miR-365、miR-193b、miR-326、miR-100、miR-30b、miR-125b和miR-584的表达水平明显下调。实时荧光定量-PCR法对miR-192、miR-215和miR-194的表达进行验证,结果显示与miRNA芯片检测结果一致;生物信息学分析结果显示,miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215及其靶基因参与肿瘤的发生、转移、细胞周期及范可尼贫血等通路。结论:胃癌高转移细胞中miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215的上调可能与胃癌的发生和转移等有关。