不同分娩方式和喂养方式下婴儿肠道菌群的分布特征

目的探讨不同分娩方式和喂养方式下婴儿生后6周肠道菌群的分布特征。方法选取2017年6月至9月于我院妇产科出生的60例新生儿为研究对象，根据分娩方式分为阴道分娩组42例，剖宫产组18例；根据喂养方式分为纯母乳喂养组40例，混合喂养组20例。收集婴儿生后6周粪便标本，利用Illumina Hiseq 2500平台针对细菌16S rRNA的V3-V4可变区进行DNA测序，将所测得的序列与SILVA数据库比对分析后，对物种分类信息进行注释，最后利用QIIME软件对样本进行生物信息学分析。统计学方法采用独立样本t检验或Mann-Whitney U检验。结果（1）60例粪便标本中共发现8个菌门，146个菌属，门水平上以厚壁菌门、变形菌门、放线菌门和拟杆菌门为优势菌；平均相对丰度前8位的属分别是双歧杆菌属（Bifidobacterium）、梭菌属（Clostridium）、克雷伯杆菌属（Klebsiella）、拟杆菌属（Bacteroides）、链球菌属（Streptococcus）、志贺杆菌属（Escherichia-Shigella）、韦荣菌属（Veillonella）、普拉梭菌属（Faecalibacterium）。（2）在门水平上，剖宫产组厚壁菌门的相对丰度阴道分娩组较明显升高（0.56±0.10与0.42±0.20，t=2.94），而放线菌门和拟杆菌门的相对丰度明显降低[分别为0.04 （0.01-0.11）与0.20 （0.05-0.36），U=223；0.05 （0.01-0.23）与0.09 （0.02-0.29），U=315，P值均〈0.05]；纯母乳喂养组和混合喂养组4个优势菌门的相对丰度比较差异均无统计学意义（P值均〉0.05）。在属水平上，剖宫产组双歧杆菌属的相对丰度较阴道分娩组明显降低[0.01（0.00-0.07）与0.19（0.02-0.36），U=210，P〈0.01]；同样，纯母乳喂养组和混合喂养组8个优势菌属的相对丰度比较差异均无统计学意义（P值均〉0.05）。（3）剖宫产组婴儿肠道菌群多样性分析中的Shannon指数和Simpson指数显著高于阴道分娩组婴儿[分别为5.48±1.19与4.26 （3.61-5.52），U=227；0.94（0.92-0.97）与0.86±0.08，U=194，P值均〈0.05]；而2组操作分类单位（operational taxonomic unit，OTU）数目和Chao1指数比较差异均无统计学意义（P值均〉0.05）。纯母乳喂养组和混合喂养组的OTU数目、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数比较差异均无统计学意义（P值均〉0.05）。结论生命早期是婴儿肠道菌群建立的关键时期。不同分娩方式下的婴儿生后6周肠道菌群的构成和多样性存在显著差异，而不同喂养方式下的婴儿肠道菌群差异不显著。