基于分子对接及网络药理学探讨加减当归六黄汤治疗肺炎的作用机制

目的利用网络药理学和分子对接方法,探讨加减当归六黄汤治疗肺炎的有效成分、作用靶点及信号通路。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)收集加减当归六黄汤的活性成分及靶点,通过蛋白数据库(Uniprot)筛选基因名称。使用GeneCards、OMIM、PharmGKB、Drugbank数据库筛选肺炎相关基因并与加减当归六黄汤靶基因取交集。将交集基因上传到String数据库,构建蛋白质相互作用网络图(PPI),采用CytoNCA对PPI进行网络拓扑分析筛选核心靶基因。使用Cytoscape(3.7.2)软件构建加减当归六黄汤治疗肺炎的网络图(药物-有效成分-靶点)。最后利用R语言及Bioconductor平台对交集靶基因进行基因本体(GO)富集分析和基因相互作用(KEGG)通路分析;并借助AutoDock、Pymol软件对核心成分和核心靶点进行分子对接及可视化分析。结果通过筛选,预测出加减当归六黄汤治疗肺炎的有效活性成分共有81个,作用于疾病的有效基因有73个,主要通过调控丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、JUN激酶(JUN)等核心靶基因及调控细胞凋亡、人巨细胞病毒、肿瘤坏死因子(TNF)、低氧诱导因子1(HIF-1)、IL-17(白细胞介素-17)、Toll样受体信号通路等而发挥对肺炎的治疗作用。结论通过分子对接及网络药理学论证了加减当归六黄汤治疗肺炎具有多成分、多靶点、多途径的特点,未来我们可以从MAPK、AKT1、IL-6、CASP3、PTGS2、JUN等靶点及相关信号通路来探究加减当归六黄汤治疗肺炎的作用机制,为后续药物研发、分子生物学实验及相关临床研究奠定理论基础。