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桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析
被引量:
4
1
作者
张杰伟
任飞
+2 位作者
张中保
谢华
魏建华
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第1期185-190,共6页
为了对桃(Prunus persica var.Lovell)中PI-PLC家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃中含有5个PI-PLC家...
为了对桃(Prunus persica var.Lovell)中PI-PLC家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃中含有5个PI-PLC家族基因,预测他们均含有9个外显子,分布于桃的2条染色体上。保守结构域分析结果显示,桃中PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。进化树分析结果表明桃PI-PLC家族基因可分为4个亚家族。
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关键词
磷酸肌醇特异性磷脂酶C
桃
进化分析
基因家族
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职称材料
题名
桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析
被引量:
4
1
作者
张杰伟
任飞
张中保
谢华
魏建华
机构
北京市农林科学院/农业基因资源与生物技术北京市重点实验室
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2017年第1期185-190,共6页
基金
北京市农林科学院青年科研基金项目(QNJJ201416)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202)
北京市科技计划项目(Z151100001015005)
文摘
为了对桃(Prunus persica var.Lovell)中PI-PLC家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃PI-PLC家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃中含有5个PI-PLC家族基因,预测他们均含有9个外显子,分布于桃的2条染色体上。保守结构域分析结果显示,桃中PI-PLC蛋白均含有4个保守的EF、X、Y和C2结构域。进化树分析结果表明桃PI-PLC家族基因可分为4个亚家族。
关键词
磷酸肌醇特异性磷脂酶C
桃
进化分析
基因家族
Keywords
PI-PLC
Prunus persica
phylogeny analysis
gene family
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
桃磷酸肌醇特异性磷脂酶C基因家族鉴定与分析
张杰伟
任飞
张中保
谢华
魏建华
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2017
4
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