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可可毛色二孢菌全基因组非经典分泌蛋白的预测及致病相关性分析
1
作者
邢启凯
王欣芳
+3 位作者
彭军波
张玮
燕继晔
李永华
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期102-115,共14页
可可毛色二孢(Lasiodiplodia theobromae)是一种世界性分布的重要植物病原真菌,可侵染500余种木本植物,危害严重。分泌蛋白在病原菌的侵入、扩展、定殖以及病害发生过程中发挥着重要作用,目前有关经典分泌蛋白的研究较多,而对于非经典...
可可毛色二孢(Lasiodiplodia theobromae)是一种世界性分布的重要植物病原真菌,可侵染500余种木本植物,危害严重。分泌蛋白在病原菌的侵入、扩展、定殖以及病害发生过程中发挥着重要作用,目前有关经典分泌蛋白的研究较多,而对于非经典分泌蛋白在植物病原真菌致病过程中的作用研究较少。本研究基于L.theobromae全基因组序列,通过生物信息学预测,得到238个候选非经典分泌蛋白编码基因。基因功能预测及富集分析结果显示,这些基因在碳硫裂解酶活性(Car-bon-sulfur lyase activity)通路中被富集。基于PHI-base病原-宿主互作数据库的注释信息,其中有15个非经典分泌蛋白编码基因可能参与了L.theobromae的致病过程。ApoplastP软件预测结果显示,其中4个定位于植物细胞质外体,11个定位于植物细胞内。经反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)分析证实,这些候选关键非经典分泌蛋白编码基因的转录水平在葡萄枝条组织诱导条件下发生了显著的变化。根据本研究结果,非经典分泌蛋白在葡萄—L.theobromae互作体系中可能发挥着重要作用,这为深入解析非经典分泌蛋白对L.theobromae致病力影响的机制奠定了基础。
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关键词
可可毛色二孢菌
葡萄溃疡病
非经典分泌蛋白
生物信息学预测
功能分析
原文传递
题名
可可毛色二孢菌全基因组非经典分泌蛋白的预测及致病相关性分析
1
作者
邢启凯
王欣芳
彭军波
张玮
燕继晔
李永华
机构
北京市农林科学院
植物保护
研究所
/北方
果蔬
病虫害
绿色
防控
北京市
重点
实验室
/农业
农村部
北方
果蔬
有害生物
绿色
防控
重点
实验室
(
部
省
共建
)
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期102-115,共14页
基金
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20210435,KJCX20200434)
国家葡萄产业技术体系(CARS-29)。
文摘
可可毛色二孢(Lasiodiplodia theobromae)是一种世界性分布的重要植物病原真菌,可侵染500余种木本植物,危害严重。分泌蛋白在病原菌的侵入、扩展、定殖以及病害发生过程中发挥着重要作用,目前有关经典分泌蛋白的研究较多,而对于非经典分泌蛋白在植物病原真菌致病过程中的作用研究较少。本研究基于L.theobromae全基因组序列,通过生物信息学预测,得到238个候选非经典分泌蛋白编码基因。基因功能预测及富集分析结果显示,这些基因在碳硫裂解酶活性(Car-bon-sulfur lyase activity)通路中被富集。基于PHI-base病原-宿主互作数据库的注释信息,其中有15个非经典分泌蛋白编码基因可能参与了L.theobromae的致病过程。ApoplastP软件预测结果显示,其中4个定位于植物细胞质外体,11个定位于植物细胞内。经反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)分析证实,这些候选关键非经典分泌蛋白编码基因的转录水平在葡萄枝条组织诱导条件下发生了显著的变化。根据本研究结果,非经典分泌蛋白在葡萄—L.theobromae互作体系中可能发挥着重要作用,这为深入解析非经典分泌蛋白对L.theobromae致病力影响的机制奠定了基础。
关键词
可可毛色二孢菌
葡萄溃疡病
非经典分泌蛋白
生物信息学预测
功能分析
Keywords
Lasiodiplodia theobromae
Botryosphaeria dieback
non-classical secreted protein
bioinformatic prediction
functional analysis
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
可可毛色二孢菌全基因组非经典分泌蛋白的预测及致病相关性分析
邢启凯
王欣芳
彭军波
张玮
燕继晔
李永华
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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