北京市人类免疫缺陷病毒-1 B亚型分子的流行特征

目的分析北京市HIV-1B亚型的分子流行特征。方法采集北京市2006年至2010年新发现的HIV—1B亚型感染者抗凝血，反转录套式PCR扩增病毒gag基因，并进行系统进化和Entropy核苷酸多态性差异分析。结果成功扩增167份标本，其中欧美B亚型10份，B’亚型14份，中国B亚型101份。B’亚型进化簇内存存多条来自泰国和印度的序列，中国B亚型独立成簇，进化簇内无其他围家的序列。中国B亚型存在4个业簇，71．1％的病例为男男性传播。以欧美B进化簇为参照，B’亚型和中国B亚型进化簇分别存在55和94个有明显差异的核苷酸位点。结论北京市存在3种类型的HIV-1B亚型，其中1种为本土株。