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CRISPR-Cas13a检测在肺结核诊断中的价值 被引量:1
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作者 张治国 尚媛媛 +5 位作者 张旭霞 刘荣梅 马丽萍 秦林 孔忠顺 任卫聪 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第6期589-593,共5页
目的:评价应用CRISPR-Cas13a检测临床样本对肺结核的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法,收集首都医科大学附属北京胸科医院2022年9月至2022年12月收治住院的102例经GeneXpert MTB/RIF检测(简称“Xpert检测”)确诊的肺结核患者的支气管... 目的:评价应用CRISPR-Cas13a检测临床样本对肺结核的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法,收集首都医科大学附属北京胸科医院2022年9月至2022年12月收治住院的102例经GeneXpert MTB/RIF检测(简称“Xpert检测”)确诊的肺结核患者的支气管肺泡灌洗液标本,作为结核病组;收集同期收治入院的100例非结核病患者(包括肺癌,细菌性肺炎,支气管扩张,慢性阻塞性肺疾病)的支气管肺泡灌洗液标本,作为非结核病组。所有患者的支气管肺泡灌洗液标本均进行涂片抗酸杆菌染色镜检、培养、Xpert检测及CRISPR-Cas13a检测。以Xpert检测结果为参照,评价CRISPR-Cas13a检测支气管肺泡灌洗液对肺结核的诊断价值。结果:结核病组102份标本中,CRISPR-Cas13a检测阳性为99份(97.1%),涂片阳性40份(39.2%),培养阳性68份(66.7%)。CRISPR-Cas13a检测阳性率明显高于涂片和培养法,差异有统计学意义(涂片:χ^(2)=58.141,P<0.001;培养:χ^(2)=30.250,P<0.001)。与传统检测方法相比,CRISPR-Cas13a比涂片和培养法多检测出28份标本。Xpert检测结核病组阳性率为100.0%;Xpert检测非结核病组阴性率为100.0%。以Xpert检测结果作为参照,CRISPR-Cas13a检测肺结核的敏感度为97.1%(99/102)、特异度为96.0%(96/100),准确度为96.5%(195/202),阳性预测值为96.1%(99/103),阴性预测值为97.0%(96/99)。结论:CRISPR-Cas13a检测与传统方法相比简单、快捷,检测支气管肺泡灌洗液对肺结核的诊断具有较高敏感度及特异度,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 重复序列 核酸 结核 支气管肺泡灌洗液 CRISPR-Cas系统
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耻垢分枝杆菌原核类泛素蛋白对异柠檬酸裂解酶的动态调控 被引量:2
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作者 刘毅 薛玉 +1 位作者 张旭霞 李传友 《国际呼吸杂志》 2015年第24期1846-1849,共4页
目的通过验证异柠檬酸裂解酶(isocitratelyase,Icl)蛋白在缺氧和营养缺乏等应激条件下的原核类泛素蛋白(prokaryotic ubiquitin like protein,Pup)化状态的变化,进而说明Pup一蛋白酶体系统对其进行动态调控。方法构建耻垢分枝杆... 目的通过验证异柠檬酸裂解酶(isocitratelyase,Icl)蛋白在缺氧和营养缺乏等应激条件下的原核类泛素蛋白(prokaryotic ubiquitin like protein,Pup)化状态的变化,进而说明Pup一蛋白酶体系统对其进行动态调控。方法构建耻垢分枝杆菌Icl蛋白表达载体,纯化蛋白,制备Icl抗体;构建持续表达His6-Pup的穿梭载体,导人耻垢分枝杆菌中;分别在有氧,缺氧条件(2、4和6d)培养,营养缺乏条件(2、4、6和8d)培养,收集耻垢分枝杆菌菌体,超声破碎后获得总蛋白,通过Ni—NTA柱纯化,获得His6-Pup结合的蛋白;跑SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE),转膜后做免疫印迹(Western—blot)实验,分别用抗Pup抗体和抗Icl抗体检测,验证Icl蛋白的表达情况及其被Pup化的状况,所有实验均重复3次。结果发现在缺氧和营养缺乏条件下Icl蛋白的表达呈现增加的趋势,而Pup化的程度有下降的趋势,Pup化和蛋白浓度变化趋势是相反的。说明细胞在应激条件下需要Icl高表达,因而Pup蛋白酶体系统对其降解程度选择性的下降,相应提高了细胞内Icl蛋白的浓度,满足细胞在应激反应中的需要。结论Icl在分枝杆菌细胞的应激过程中发挥重要作用,其浓度随着细胞本身的状态而发生动态变化,这主要是Pup-蛋白酶体系统对它的降解调控发生变化,说明Pup可以动态调控Icl蛋白的浓度水平。 展开更多
关键词 原核类泛素蛋白 异柠檬酸裂解酶 应激条件 动态调控
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