SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用

目的评估用SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用。方法收集北京市结核病胸部肿瘤研究所2007年1～12月的分枝杆菌118株，通过PNB培养基初筛，其中结核分枝杆菌复合群25株，非结核分枝杆菌93株。同时用测序方法和SMIS分析分枝菌酸方法鉴定118株分枝杆菌，以16SrDNA和16-23S rDNAITS测定作为菌种鉴定的标准，评估利用SMIS分离分枝菌酸鉴定分枝杆菌菌种的符合率及一致性；并验证以上两种方法鉴定结果分别与PNB初筛分结核分枝杆菌复合群和非结核分枝杆菌结果的符合率及一致性。结果SMIS与测序鉴定分枝杆菌相比的符合率为92％（108／118），其中结核分枝杆菌复合群鉴定的符合率为95％（35／37），非结核分枝杆菌为90％（73／81），Kappa分析显示两种方法鉴定结果的一致性很好（Kappa=0．96）。回顾验证初筛结果显示，SMIS与PNB培养基方法鉴定结果符合率90％（106／118），一致性较好（Kappa=0．73）：测序方法与PNB培养基方法鉴定结果符合率也为90％（106／118），一致性较好（Kappa=0．74），但有11株测序和分枝菌酸菌种鉴定方法结果相同的结核分枝杆菌复合群与PNB实验结果不一致。结论利用分枝菌酸对临床分离的分枝杆菌进行菌种鉴定是一种快速、简便和准确的方法，对处置应急和突发公共卫生事件中的分枝杆菌菌种鉴定具有一定的参考价值，是分枝杆菌菌种多相鉴定策略的重要组成部分。

SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用

目的 评估用SMIS检测分枝菌酸在分枝杆菌菌种鉴定中的作用。方法 收集北京市结核病胸部肿瘤研究所2007年1—12月的分枝杆菌118株，通过PNB培养基初筛，其中结核分枝杆菌复合群25株，非结核分枝杆菌93株。同时用测序方法和SMIS分析分枝菌酸方法鉴定118株分枝杆菌，以16SrDNA和16—23SrDNAITS测定作为菌种鉴定的标准，评估利用SMIS分离分枝菌酸鉴定分枝杆菌菌种的符合率及一致性；并验证以上两种方法鉴定结果分别与PNB初筛分结核分枝杆菌复合群和非结核分枝杆菌结果的符合率及一致性。结果 SMIS与测序鉴定分枝杆菌相比的符合率为92％（108／118），其中结核分枝杆菌复合群鉴定的符合率为95％（35／37），非结核分枝杆菌为90％（73／81），Kappa分析显示两种方法鉴定结果的一致性很好（Kappa=0．96）。回顾验证初筛结果显示，SMIS与PNB培养基方法鉴定结果符合率90％（106／118），一致性较好（Kappa=0．73）；测序方法与PNB培养基方法鉴定结果符合率也为90％（106／118），一致性较好（Kappa=0．74），但有11株测序和分枝菌酸菌种鉴定方法结果相同的结核分枝杆菌复合群与PNB实验结果不一致。结论 利用分枝菌酸对临床分离的分枝杆菌进行菌种鉴定是一种快速、简便和准确的方法，对处置应急和突发公共卫生事件中的分枝杆菌菌种鉴定具有一定的参考价值，是分枝杆菌菌种多相鉴定策略的重要组成部分。