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P53凋亡刺激蛋白2介导酒精性肝病脂代谢相关基因的转录组学分析
被引量:
2
1
作者
张莹
刘超楠
+3 位作者
时红林
刘芳
陈德喜
时红波
《首都医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第1期85-92,共8页
目的应用转录组学测序探讨P53凋亡刺激蛋白2(apoptosis stimulating protein 2,ASPP2)对酒精性肝病脂代谢相关基因表达的影响。方法首先用慢病毒转染人肝细胞HL-7702细胞系,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA细胞模型。然后,两...
目的应用转录组学测序探讨P53凋亡刺激蛋白2(apoptosis stimulating protein 2,ASPP2)对酒精性肝病脂代谢相关基因表达的影响。方法首先用慢病毒转染人肝细胞HL-7702细胞系,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA细胞模型。然后,两组细胞均用400 mmol/L乙醇处理24 h,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA酒精肝模型。Illumina测序平台筛选差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和互作分析。结果高通量测序以P<0.05且|log 2(foldchange)|>1的筛选标准获得150个差异表达的基因,其中上调的差异基因有58个,下调92个。其中,与脂代谢相关的上调差异基因有8个,下调差异基因有7个。GO富集分析发现4个脂代谢相关的细胞组分,包括高密度脂蛋白粒子,血浆脂蛋白粒子,脂蛋白粒子以及蛋白-脂质复合物。结论本研究发现15种脂代谢相关差异基因,这些基因可能参与ASPP2介导的酒精性肝病脂代谢,为进一步研究ASPP2在酒精性肝病脂代谢中的调控机制奠定了基础。
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关键词
凋亡刺激蛋白2
酒精性肝病
脂代谢
转录组学
生物信息学
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职称材料
题名
P53凋亡刺激蛋白2介导酒精性肝病脂代谢相关基因的转录组学分析
被引量:
2
1
作者
张莹
刘超楠
时红林
刘芳
陈德喜
时红波
机构
首都医科大学附属
北京
佑安医院
北京
肝病
研究
所
北京市肝炎、肝癌精准医学与转化工程技术研究中心
山西中医药大学第三临床学院
出处
《首都医科大学学报》
CAS
北大核心
2023年第1期85-92,共8页
基金
国家重点研发计划(2022YFC2305002)
北京市自然科学基金(M22030)
+1 种基金
北京市医院管理中心“登峰”计划专项经费资助(DFL20221501)
北京市属医学科研院所公益发展改革试点项目(京医研2021-10)。
文摘
目的应用转录组学测序探讨P53凋亡刺激蛋白2(apoptosis stimulating protein 2,ASPP2)对酒精性肝病脂代谢相关基因表达的影响。方法首先用慢病毒转染人肝细胞HL-7702细胞系,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA细胞模型。然后,两组细胞均用400 mmol/L乙醇处理24 h,构建7702 Control-shRNA和7702 ASPP2-shRNA酒精肝模型。Illumina测序平台筛选差异表达基因,并进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和互作分析。结果高通量测序以P<0.05且|log 2(foldchange)|>1的筛选标准获得150个差异表达的基因,其中上调的差异基因有58个,下调92个。其中,与脂代谢相关的上调差异基因有8个,下调差异基因有7个。GO富集分析发现4个脂代谢相关的细胞组分,包括高密度脂蛋白粒子,血浆脂蛋白粒子,脂蛋白粒子以及蛋白-脂质复合物。结论本研究发现15种脂代谢相关差异基因,这些基因可能参与ASPP2介导的酒精性肝病脂代谢,为进一步研究ASPP2在酒精性肝病脂代谢中的调控机制奠定了基础。
关键词
凋亡刺激蛋白2
酒精性肝病
脂代谢
转录组学
生物信息学
Keywords
apoptosis stimulating protein 2(ASPP2)
alcoholic liver disease
lipid metabolism
transcriptomics
bioinformatics
分类号
R64.4 [医药卫生—外科学]
R3 [医药卫生—基础医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
P53凋亡刺激蛋白2介导酒精性肝病脂代谢相关基因的转录组学分析
张莹
刘超楠
时红林
刘芳
陈德喜
时红波
《首都医科大学学报》
CAS
北大核心
2023
2
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职称材料
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参考文献
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