大西洋鳕鱼肌红蛋白血管紧张素转化酶抑制肽的计算机模拟评估

本研究的主要目的是通过计算机模拟胃肠消化的方法推定大西洋鳕鱼的肌红蛋白中生物活性肽出现的概率及其丰度。从NCBI数据库中得到肌红蛋白的氨基酸序列并下载,将其导入Peptide Cutter中选用不同的酶模拟酶解,并在BIOPEP-UWM的“酶促工具”中对其短肽进行分析,在Toxin Pred中分析其理化性质、毒性特征。同时,将结果导入Peptide Ranker中对肽活性进行排序,并从中筛选出两种血管紧张素转化酶(Angiotensin Converting Enzyme,ACE)抑制肽CW和LFPK,将活性较高的肽与ACE进行分子对接,分析了CW和LFPK的ACE抑制机制,为从食品中寻找ACE抑制肽的研究提供参考。

基于In Silicon模拟消化的北极虾DPP-Ⅳ抑制肽活性分析

北极虾具有很高的营养价值,在食品领域已引起越来越多的关注。对北极虾蛋白进行In Silicon模拟消化获得寡肽,通过PeptideRanker活性评分及理化性质分析,从中筛选出具有潜在生物活性的寡肽。使用ToxinPred分析和BIOPEP-UWM生物活性预测,发现部分寡肽具有二肽基肽酶-Ⅳ(dipeptidyl peptidase-Ⅳ,DPP-Ⅳ)抑制活性,最终确定WFP(一种三肽,Trp-Phe-Pro)具有最优的DPP-Ⅳ抑制活性肽。分子对接表明,WFP和DPP-Ⅳ能够形成稳定的复合物,其结合能为-6.93 kcal/mol,进一步研究表明,WFP通过与DPP-Ⅳ S1、S2、S3三个活性口袋中的9个氨基酸残基发生相互作用而抑制其活性。本研究为阐释北极虾营养价值及生物活性肽的开发提供了理论依据。

基于网络药理学探究御丰膏对皮肤抗衰老的作用机制

目的:探讨御丰膏中葛根、人参、雪莲3种药用植物对女性皮肤抗衰老的作用机制。方法:利用TCMSP、UniProt数据库、GeneCards数据库及Cytoscape 3.9.1,过滤和收集葛根-人参-雪莲的活性成分和靶点以及与雌激素、内分泌和抗氧化相关靶点,并进行通路富集分析,建立可视化网络图。经AutoDock Tools 1.5.7软件将关键成分和核心靶点进行分子对接并可视化。结果:共获得有效成分33个,相关靶点100个;神经活性配体-受体相互作用等9个核心信号通路。分子对接结果显示,山奈酚、木犀草素、槲皮素与血管内皮生长因子(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)等核心靶点可以较好地结合。结论:通过网络药理学分析预测葛根-人参-雪莲抗皮肤衰老的作用机制,为探索药食同源方法延缓皮肤衰老提供参考。