木瓜转录组数据SSR标记的开发及其遗传多样性分析

试验对木瓜属(Chaenomeles)58份种质进行遗传多样性研究,为木瓜种质资源鉴定与遗传改良提供了参考。基于皱皮木瓜‘长俊’和光皮木瓜‘豆青’转录组测序数据进行简单重复序列标记(SSR)位点检测,利用毛细管电泳法进行荧光SSR-PCR产物检测。结果表明:共筛选出22对EST-SSR多态性标记,在58份木瓜资源中扩增检测出平均多态性条带(NPB)6.95个、等位基因数(Na)为5.64、有效等位基因数(Ne)为3.76、Shannon’s信息指数(I)为1.3955、Nei’s基因多样性指数(H)为0.8404和多态性信息含量(PIC)为0.6327。群体结构、聚类及主成分分析表明,58份木瓜种质划分为5个亚群,遗传相似系数在0.58~0.95之间,光皮木瓜、日本木瓜显著区分,毛叶木瓜和西藏木瓜的亲缘关系最近,与皱皮木瓜的亲缘关系次之。