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遗传病二代测序临床检测全流程规范化共识探讨(3)——数据分析流程
被引量:
25
1
作者
孙隽
黄颐
+16 位作者
王小冬
李文甫
安冬艳
高勇
熊慧
周在威
许雄
邓旭旭
王小清
黄辉
彭智宇
张巍
于世辉
汪亮
顾卫红
黄尚志
沈亦平
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2020年第3期345-351,共7页
基因组测序数据的生物信息学分析以及变异的临床相关性解读是基于二代测序的遗传病诊断全流程的核心内容。本文探讨了生物信息学分析、数据存储和数据解读环节的流程、功能、主要参数指标及建议等,经行业内临床医师、检测实验室等相关...
基因组测序数据的生物信息学分析以及变异的临床相关性解读是基于二代测序的遗传病诊断全流程的核心内容。本文探讨了生物信息学分析、数据存储和数据解读环节的流程、功能、主要参数指标及建议等,经行业内临床医师、检测实验室等相关专家讨论,对符合孟德尔遗传规律的胚系突变的遗传病规范化检测达成了共识,以期为提髙基于二代测序的遗传病诊断的同质性和可靠性提供指导。
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关键词
二代测序
生物信息学分析流程
数据储存
数据质量控制
变异解读
原文传递
临床基因检测报告规范与基因检测行业共识探讨
被引量:
50
2
作者
黄辉
沈亦平
+47 位作者
顾卫红
王伟
王一鸣
祁鸣
沈珺
邱正庆
于世辉
周在威
陈白雪
陈蕾
陈云弟
崔欢欢
杜娟
高勇
郭一然
胡婵娟
胡亮
黄颐
李培培
李厦戎
李秀蓉
刘雅萍
卢洁
马端
马永毅
彭嵋
宋昉
孙洪业
汪亮
王大伟
王静敏
王玲
王正远
王志农
吴继红
吴静
伍建
许怡民
姚宏
杨东声
杨旭
杨艳玲
张颖
周裕林
朱宝生
曾思聪
彭智宇
黄尚志
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2018年第1期1-8,共8页
二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准。首届“临床...
二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准。首届“临床基因检测标准与规范专题研讨会”于2017年10月28日在深圳召开,来自全国138家机构的250多位遗传学专家、临床专家及第三方检测机构的代表共同探讨了遗传病基因检测报告的标准和规范问题。本文根据此次研讨会专家的意见和建议,就遗传病基因检测报告的原则、规范以及基因检测行业的发展进行了讨论,并发布了临床基因检测报告规范共识,以促进检测报告的规范化和标准化,推进我国基因检测行业的健康有序地发展。
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关键词
基因检测
二代测序
报告规范
行业共识
原文传递
题名
遗传病二代测序临床检测全流程规范化共识探讨(3)——数据分析流程
被引量:
25
1
作者
孙隽
黄颐
王小冬
李文甫
安冬艳
高勇
熊慧
周在威
许雄
邓旭旭
王小清
黄辉
彭智宇
张巍
于世辉
汪亮
顾卫红
黄尚志
沈亦平
机构
天津华大医学检验所
有限公司
深圳华大基因股份
有限公司
上海集爱遗传与不育诊疗中心
赛福解码(
北京
)基因
科技
有限公司
北京聚道科技有限公司
北京
金准基因
科技
有限
责任
公司
北京
希望组生物
科技
有限公司
厦门基源医学检测
有限公司
上海寻因生物
科技
有限公司
湖南大地同年生物
科技
有限公司
北京
贝瑞和康生物技术
有限公司
上海瀚垚生物医学
科技
有限公司
广州嘉检医学检测
有限公司
广州金域医学检验中心
有限公司
深圳基因界
科技
咨询
有限公司
中文人类表型标准用语联盟/中日友好医院神经内科运动障碍与神经遗传病研究中心
北京
协和医学院、世界卫生组织遗传病社区控制合作中心
哈佛大学医学院波士顿儿童医院
广西妇幼保健院广西儿童医院
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2020年第3期345-351,共7页
文摘
基因组测序数据的生物信息学分析以及变异的临床相关性解读是基于二代测序的遗传病诊断全流程的核心内容。本文探讨了生物信息学分析、数据存储和数据解读环节的流程、功能、主要参数指标及建议等,经行业内临床医师、检测实验室等相关专家讨论,对符合孟德尔遗传规律的胚系突变的遗传病规范化检测达成了共识,以期为提髙基于二代测序的遗传病诊断的同质性和可靠性提供指导。
关键词
二代测序
生物信息学分析流程
数据储存
数据质量控制
变异解读
Keywords
Next generation sequencing
Bioinformatic pipeline
Data storage
Data quality control
Variant interpretation
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
原文传递
题名
临床基因检测报告规范与基因检测行业共识探讨
被引量:
50
2
作者
黄辉
沈亦平
顾卫红
王伟
王一鸣
祁鸣
沈珺
邱正庆
于世辉
周在威
陈白雪
陈蕾
陈云弟
崔欢欢
杜娟
高勇
郭一然
胡婵娟
胡亮
黄颐
李培培
李厦戎
李秀蓉
刘雅萍
卢洁
马端
马永毅
彭嵋
宋昉
孙洪业
汪亮
王大伟
王静敏
王玲
王正远
王志农
吴继红
吴静
伍建
许怡民
姚宏
杨东声
杨旭
杨艳玲
张颖
周裕林
朱宝生
曾思聪
彭智宇
黄尚志
机构
深圳华大基因股份
有限公司
哈佛医学院波顿儿童医院
中日友好医院运动障碍与神经遗传病研究中心
上海市儿童医院
中山大学分子医学研究院疾病基因研究所
浙江大学医学院/浙江迪安诊断
哈佛医学院布列根和妇女医院
北京
协和医院儿科
广州金域医学检验中心
有限公司
上海寻因生物
科技
有限公司
上海阅尔基因技术
有限公司
中信湘雅生殖与遗传专科医院
北京
希望组生物
科技
有限公司
费城儿童医院
美年大健康产业(集团)
有限公司
明码(上海)生物
科技
有限公司
深圳市华大基因学院
北京聚道科技有限公司
北京
协和医学院基础学院
复旦大学出生缺陷研究中心
陆军军医大学附属第一医院妇产科产前诊断中心
杭州奕真生物
科技
有限公司
首都儿科研究所
深圳基因界
科技
咨询
有限公司
北京
诺禾致源
科技
股份
有限公司
北京
大学第一医院
上海康昱盛信息
科技
有限公司
云健康基因
科技
(上海)
有限公司
北京
金准基因
科技
有限
责任
公司
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
北京
迈基诺基因
科技
股份
有限公司
沃医妇产名医集团、
北京
和美妇儿医院妇产科
深圳瑞奥康晨生物
科技
有限公司
天津医科大学总医院产前诊断中心
福建省厦门市妇幼保健院
云南省第一人民医院妇产科遗传诊断中心
北京
协和医学院、世界卫生组织遗传病社区控制合作中心
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2018年第1期1-8,共8页
文摘
二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准。首届“临床基因检测标准与规范专题研讨会”于2017年10月28日在深圳召开,来自全国138家机构的250多位遗传学专家、临床专家及第三方检测机构的代表共同探讨了遗传病基因检测报告的标准和规范问题。本文根据此次研讨会专家的意见和建议,就遗传病基因检测报告的原则、规范以及基因检测行业的发展进行了讨论,并发布了临床基因检测报告规范共识,以促进检测报告的规范化和标准化,推进我国基因检测行业的健康有序地发展。
关键词
基因检测
二代测序
报告规范
行业共识
Keywords
Genetic testing
Next generation sequencing
Guideline
Standard
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
遗传病二代测序临床检测全流程规范化共识探讨(3)——数据分析流程
孙隽
黄颐
王小冬
李文甫
安冬艳
高勇
熊慧
周在威
许雄
邓旭旭
王小清
黄辉
彭智宇
张巍
于世辉
汪亮
顾卫红
黄尚志
沈亦平
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2020
25
原文传递
2
临床基因检测报告规范与基因检测行业共识探讨
黄辉
沈亦平
顾卫红
王伟
王一鸣
祁鸣
沈珺
邱正庆
于世辉
周在威
陈白雪
陈蕾
陈云弟
崔欢欢
杜娟
高勇
郭一然
胡婵娟
胡亮
黄颐
李培培
李厦戎
李秀蓉
刘雅萍
卢洁
马端
马永毅
彭嵋
宋昉
孙洪业
汪亮
王大伟
王静敏
王玲
王正远
王志农
吴继红
吴静
伍建
许怡民
姚宏
杨东声
杨旭
杨艳玲
张颖
周裕林
朱宝生
曾思聪
彭智宇
黄尚志
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2018
50
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