新型冠状病毒肺炎领域本体构建及应用

目的 构建一个开放、全面、语义表达良好的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)领域本体,用于支持COVID-19相关知识的共享和有效利用。方法 在生物医学顶层本体基本形式化本体(BFO)框架下,使用斯坦福大学七步法,利用Protégé和Ontofox工具,通过抽取国内外现有本体、知识库和诊疗指南中的COVID-19相关知识并加以重新组织,构建COVID-19领域本体,并使用推理机和文献抽样调查法对本体进行质量评价。结果 在冠状病毒传染性疾病本体(CIDO)的基础上,扩展了症状、预防、临床诊疗和药物等方面内容,构建了一个覆盖疾病、诊断、病因、病毒、传播、症状、治疗、药物、预防等方面知识的COVID-19领域本体(CIDO-COVID-19)。推理机验证结果表明,该本体具有较好的一致性,文献抽样显示其具有较高的术语覆盖率,并利用该本体指导开发了一个COVID-19知识图谱原型。结论 CIDO-COVID-19实现了COVID-19领域知识的整合与复用,具有较好的一致性和术语覆盖率,可用于支持本领域的知识库构建和知识服务。