北京黑猪GREB1L和MIB1基因多态性与肋骨数及胴体性状的关联分析

旨在开展GREB 1L和MIB 1基因多态性与肋骨数和胴体性状(胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重)关联分析,筛选关键功能位点。本研究选取屠宰日龄为215天的317头健康北京黑猪,并提取耳组织DNA,对GREB 1L和MIB 1基因进行引物设计、并利用聚合酶链式反应(PCR)技术和Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型,计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布,并与肋骨数和胴体性状进行关联分析。试验共筛选到6个SNPs,包括GREB 1L基因的3个同义突变、MIB 1基因的2个同义突变和1个内含子区的可变剪切突变。将6个SNPs分别对肋骨数和胴体性状使用Duncan’s多重检验统计分析发现,GREB 1L基因上的3个同义突变6:106574972 G>A、6:106648540 C>T、6:106648558 A>G与性状关联均不显著(P>0.05);MIB 1基因上的1个同义突变6:106936590 C>T与胴体长显著相关(P<0.05);而内含子15~16的6:107016475 A>G可变剪切突变与肋骨数显著相关(P<0.05);第三个同义突变6:107028660 G>A与肋骨数和胴体性状均无显著差异(P>0.05)。结果显示,显著的2个位点可作为北京黑猪肋骨数及胴体长变异的候选基因功能位点。

北京黑猪LPL和NUDT3基因多态性及其与肉质性状的关联分析

【目的】研究脂蛋白脂酶(lipoprteinlipase,LPL)和Nudix水解酶3(Nudix hydrolase homolog 3,NUDT3)基因多态性与北京黑猪肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量和背膘厚的关联性,从而在分子水平上指导北京黑猪的育种工作。【方法】利用347头北京黑猪背最长肌样本进行IMF含量和背膘厚数据测定,按照IMF含量进行高、低分组。根据猪NUDT3和LPL基因序列设计引物并进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件中SeqMan分析测序结果,使用Duncan’s多重检验对2个基因不同基因型与北京黑猪IMF含量和背膘厚进行关联分析,并运用实时荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析。【结果】LPL基因存在1个错义突变、3个同义突变和3个3′-UTR突变;NUDT3基因存在6个3′-UTR突变。LPL基因CDS区c.431 G>C位点与北京黑猪第6~7肋背膘厚显著相关,c.647 G>C位点与胸腰结合处背膘厚显著相关,c.637 A>G位点与第6~7肋背膘厚、胸腰结合处背膘厚和腰荐结合处背膘厚均显著相关(P<0.05);3′-UTR区c.1683 A>G位点与胸腰结合处背膘厚显著相关,c.1689 C>A位点与IMF含量显著相关(P<0.05)。NUDT3基因上的突变位点均发生在3′-UTR区,其中c.7204 G>T位点与北京黑猪IMF含量和腰荐结合处背膘厚显著相关,c.6068 C>G位点与IMF含量和第6~7肋背膘厚显著相关,c.5729 G>A位点与IMF含量显著相关(P<0.05)。实时荧光定量PCR分析发现,北京黑猪NUDT3基因c.7204 G>T位点IMF含量高、低组间表达量无显著差异,LPL基因c.1689 C>A位点CC与AA基因型间表达量无显著差异(P>0.05)。【结论】北京黑猪群体中LPL和NUDT3基因的突变位点与IMF含量显著关联,为北京黑猪肉品质选育提供了新的分子标记。

干酪乳杆菌对北京黑猪保育阶段生长性能及肠道菌群的影响

本试验旨在探讨饲粮中添加干酪乳杆菌对北京黑猪保育阶段生长性能及肠道菌群的影响。选择(35±2)日龄、体重(7.53±0.21)kg的北京黑猪仔猪120头,随机分成3组,分别为对照组、干酪乳杆菌组和金霉素组,每组4个重复,每个重复10头。对照组试验猪饲喂基础饲粮(不添加干酪乳杆菌和金霉素);干酪乳杆菌组试验猪饲喂在基础饲粮中添加干酪乳杆菌活菌冻干制剂的饲料,每千克饲料中有效活菌数在4.0×109CFU;金霉素组试验猪饲喂在基础饲粮中添加金霉素预混剂的饲料,每千克饲料含金霉素75 mg。试验期30 d,在试验第28天时采集新鲜粪样,用于16S rRNA的V3~V4区测序。结果显示:1)与对照组相比,干酪乳杆菌组和金霉素组的平均日增重分别提高12.71%(P<0.05)和8.58%(P<0.05),料重比分别降低7.34%(P<0.05)和4.52%(P>0.05)。2)通过对粪样菌群ACE指数、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数进行分析,发现干酪乳杆菌组肠道菌群丰富度和多样性均高于对照组和金霉素组。3)3组粪样中共含有17个菌门,206个菌属,对照组、干酪乳杆菌组和金霉素组粪样中分别含有198、200和197个菌属。由此可见,在北京黑猪保育阶段饲粮中添加干酪乳杆菌可改善仔猪肠道内菌群结构,进而提高生长性能。

干酪乳杆菌对北京黑猪育肥阶段生长性能和肌肉营养成分含量的影响

本试验旨在探讨在饲粮中添加干酪乳杆菌对北京黑猪育肥阶段生长性能及背最长肌中粗蛋白质、肌内脂肪、氨基酸和脂肪酸等营养成分含量的影响。选择体重为(62.77±0.59) kg的育肥北京黑猪120头,随机分成2组,分别为对照组和干酪乳杆菌组,每组5个重复,每个重复12头(阉公猪与母猪各占1/2)。对照组试验猪饲喂基础饲粮(不添加抗生素和干酪乳杆菌);干酪乳杆菌组试验猪饲喂在基础饲粮中添加干酪乳杆菌冻干制剂的饲粮(每千克饲粮中干酪乳杆菌的有效活菌数为2.0×109CFU)。试验期42 d。结果显示:1)与对照组相比,干酪乳杆菌组的平均日增重提高了8.02%,料重比降低了7.20%,差异均达到显著水平(P<0.05)。2)干酪乳杆菌组背最长肌中粗蛋白质、肌内脂肪、鲜味氨基酸、必需氨基酸、总氨基酸和不饱和脂肪酸的含量高于对照组,而饱和脂肪酸含量低于对照组,但均差异不显著(P>0.05)。由此可见,在饲粮中添加干酪乳杆菌可以改善北京黑猪育肥阶段的生长性能和饲料利用率,而对其肌肉中营养成分含量无显著影响。

干酪乳杆菌对北京黑猪育肥阶段肠道消化物菌群组成及乳酸、短链脂肪酸和长链脂肪酸含量的影响

本试验探讨了在饲粮中添加干酪乳杆菌对北京黑猪育肥阶段肠道消化物菌群组成及乳酸、短链脂肪酸和长链脂肪酸含量的影响。选择体重为(62.77±0.59)kg的北京黑猪120头,随机分成2组,分别为对照组和干酪乳杆菌组,每组5个重复,每个重复12头(阉公猪与母猪各占1/2)。对照组饲喂基础饲粮(不添加抗生素和干酪乳杆菌),干酪乳杆菌组在基础饲粮中添加干酪乳杆菌冻干制剂(每千克饲粮中有效活菌数为2.0×10^9 CFU)。在试验猪平均体重为92 kg时,选择20头猪进行屠宰,采集空肠和结肠中的消化物,用于分析菌群组成及乳酸、短链脂肪酸和长链脂肪酸含量。结果表明:1)与对照组相比,饲粮中添加干酪乳杆菌显著提高了空肠中厚壁菌门和链球菌属的相对丰度(P<0.05),显著降低了变形菌门、Terrisporobacter和埃希氏菌属-志贺氏菌属的相对丰度(P<0.05);显著提高了结肠中拟杆菌门、乳杆菌属和未标记拟杆菌目_S24-7_群的相对丰度(P<0.05),显著降低了链球菌属的相对丰度(P<0.05)。2)与对照组相比,干酪乳杆菌组结肠中乳酸含量显著降低(P<0.05),丁酸含量显著升高(P<0.05)。3)与对照组相比,饲粮中添加干酪乳杆菌显著降低了空肠中山嵛酸和顺-15-二十四碳一烯酸含量(P<0.05),显著提高了二十二碳六烯酸和ω-3多不饱和脂肪酸含量(P<0.05);显著降低了结肠中棕榈油酸和花生四烯酸含量(P<0.05)。综上所述,在北京黑猪育肥阶段饲粮中添加干酪乳杆菌,减少了空肠中埃希氏菌属-志贺氏菌属的相对丰度,增加了结肠中乳杆菌属的相对丰度;降低了结肠中乳酸的含量,提高了丁酸的含量;提高了空肠中二十二碳六烯酸的含量,降低了结肠中花生四烯酸的含量。肠道内的这些变化有利于猪群健康和生长性能的提高。

北京黑猪PPARD基因G32E多态位点与脂肪沉积相关性状的关联分析

试验旨在研究猪过氧化物酶体增殖物激活受体δ(PPARD)基因第1外显子上的错义突变位点G32E(g.61399G>A)多态性与北京黑猪脂肪沉积相关性状的关联。利用Sequenom质谱检测平台检测北京黑猪及多个中外猪种群体G32E位点的基因型,并分析该位点多态性与北京黑猪背膘厚及肌内脂肪的关联性。结果发现,在北京黑猪中,G32E位点GG基因型个体背膘厚性状极显著高于GA和AA基因型个体(P<0.01),与肌内脂肪含量的关联未达到显著水平(P>0.05)。在梅山猪和二花脸猪中,主要以A等位基因为主;而在中国地方猪种民猪、莱芜黑猪、丫杈猪及国外商品猪种杜洛克猪、长白猪和大白猪中,G等位基因频率高。初步认为PPARD基因G32E位点多态性对背膘厚性状有显著影响,对肌内脂肪含量性状没有影响。

北京黑猪公猪群饲管理模式的创新

文章通过对北京黑猪公猪传统饲养和现代饲养工艺的比较,聚焦于现代肉质育选大群体公猪饲养模式的挑战,对群饲创新的关键技术—群体规模、编组与育种的结合、投料方式、配种以及运动场围栏的设计进行了总结。

北京黑猪MYH3和MYH13基因多态性与肉质性状的关联分析

【目的】试验旨在研究肌球蛋白重链3(myosin heavy chain 3,MYH3)和肌球蛋白重链13(myosin heavy chain 13,MYH13)基因遗传变异对猪肉质性状的影响。【方法】利用北京黑猪背最长肌样本进行肉质性状(肌内脂肪(intramuscular fat, IMF)、水分、滴水损失、酸碱度(pH)、肉色L^(*)值、肉色a^(*)值和肉色b^(*)值)表型数据的测定。利用PCR和Sanger测序技术对MYH3和MYH13基因启动子区和CDS区进行基因分型。将性别、场、日龄作为协变量,采用协方差分析,确定与猪肉质性状相关的SNPs,利用实时荧光定量PCR检测基因表达水平。【结果】试验共筛选到9个SNPs,其中MYH3基因CDS区有1个错义突变(c.5782 G>C)与IMF显著相关(P<0.05),且MYH3基因表达水平与IMF呈正相关;MYH13基因CDS区有4个SNPs,其中2个(c.1923 G>A、c.1308 G>A)与肉色a^(*)值显著相关,1个(c.963 G>A)与滴水损失显著相关,1个(c.237 G>T)与肉色L^(*)值显著相关(P<0.05);MYH13基因启动子区有4个SNPs,其中2个(rs699287502、rs318639161)与肉色L^(*)值显著相关,2个(rs321315318、rs330770991)与滴水损失显著相关(P<0.05),且MYH13基因表达水平与滴水损失呈负相关。【结论】MYH3基因有1个SNP与IMF显著相关,且其基因表达水平与IMF呈正相关。MYH13基因中存在3个SNPs与滴水损失显著相关,且该基因启动子区2个SNPs基因表达水平与滴水损失呈负相关;3个SNPs与肉色L^(*)值显著相关;2个SNPs与肉色a^(*)值显著相关。以上SNPs均可作为影响北京黑猪肉质性状的候选基因功能位点。

北京黑猪肌内脂肪含量高、低组间脂质组差异分析

旨在揭示北京黑猪肌内脂肪含量与脂质组学间的关系。本试验主要是从400头210日龄的北京黑猪中按肌内脂肪含量高低筛选出高肌内脂肪组11个样品,其肌内脂肪含量的平均值为3.89%,低肌内脂肪组19个样品,其肌内脂肪含量的平均值为0.81%;对挑选出的高、低两组的个体取60 mg的肌肉样品进行脂质提取,最后进行非靶向脂质组学的检测;针对检测结果,对两组进行多元化分析,利用T检验、差异倍数和偏最小二乘判别分析进行标记物的筛选。结果,共检测出组成9类脂质的104种脂肪酸,其中酰基肉碱(AcCa)3个、甘油二酯(DG)4个、甘油三酯(TG)23个、心磷脂(CL)8个、磷脂酰胆碱(PC)21个、磷脂酰乙醇胺(PE)29个、磷脂酰甘油(PG)3个、磷脂酰肌醇(PI)6个、磷脂酰丝氨酸(PS)7个,通过进行T检验初步筛选(P<0.05)出33种脂质,其中TG有23个,AcCa有2个,DG有4个,PE有4个。进一步通过VIP值(VIP>1)和FC值(FC>2或FC<0.5)进行筛选,最终筛选出22个脂质,其中TG有21个,DG有1个。结果表明,脂质组学可以作为区分北京黑猪肌内脂肪含量高低的方法,构成肌内脂肪含量高低猪肉样品的脂质组差异物质主要集中在TG和DG上。

北京黑猪氟烷敏感基因的检测与分析

为实现氟烷应激敏感基因型的净化,本实验采用PCR-RFLP技术对北京某黑猪群体共660头个体进行氟烷敏感基因(Haln)基因型检测。结果表明,660头北京黑猪中无隐性纯合基因型个体,HalNHaln基因型个体45头(6.8%),HalNHalN基因型个体615头(93.2%),此群体Haln基因频率为0.034。