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碱基序列标记法结合焦磷酸测序测定不同来源基因表达量
被引量:
10
1
作者
张晓丹
武海萍
+1 位作者
陈之遥
周国华
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第8期1107-1112,共6页
建立了一种将序列标记反转录聚合酶链反应(PCR)与焦磷酸测序技术结合的相对基因表达量测定法(简称"SRPP")。先用来源特异性引物对不同来源的同一基因通过反转录标记上特异性标签,PCR后用焦磷酸测序法对扩增产物进行序列解码,...
建立了一种将序列标记反转录聚合酶链反应(PCR)与焦磷酸测序技术结合的相对基因表达量测定法(简称"SRPP")。先用来源特异性引物对不同来源的同一基因通过反转录标记上特异性标签,PCR后用焦磷酸测序法对扩增产物进行序列解码,使得测序结果中的序列代表基因的来源,峰高代表基因在不同来源中的相对表达量。用实时荧光定量PCR法对本方法的准确性进行了验证,结果表明,SRPP可以同时准确测定同一基因在3个不同来源中的表达量,并实际测定了Egr1基因在糖尿病、肥胖和正常小鼠肝中的表达量差异。
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关键词
序列标记反转录
聚合物链反应
焦磷酸测序
基因表达
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职称材料
题名
碱基序列标记法结合焦磷酸测序测定不同来源基因表达量
被引量:
10
1
作者
张晓丹
武海萍
陈之遥
周国华
机构
华东医药生物技术研究所
南京大学医学院
出处
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第8期1107-1112,共6页
基金
国家自然科学基金(No.30470454)
日本日立中央研究所资助
文摘
建立了一种将序列标记反转录聚合酶链反应(PCR)与焦磷酸测序技术结合的相对基因表达量测定法(简称"SRPP")。先用来源特异性引物对不同来源的同一基因通过反转录标记上特异性标签,PCR后用焦磷酸测序法对扩增产物进行序列解码,使得测序结果中的序列代表基因的来源,峰高代表基因在不同来源中的相对表达量。用实时荧光定量PCR法对本方法的准确性进行了验证,结果表明,SRPP可以同时准确测定同一基因在3个不同来源中的表达量,并实际测定了Egr1基因在糖尿病、肥胖和正常小鼠肝中的表达量差异。
关键词
序列标记反转录
聚合物链反应
焦磷酸测序
基因表达
Keywords
Sequence-tagged reverse transcription, polymerase chain reaction, pyrosequencing, gene expression
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
碱基序列标记法结合焦磷酸测序测定不同来源基因表达量
张晓丹
武海萍
陈之遥
周国华
《分析化学》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009
10
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职称材料
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