妊娠期糖尿病相关基因的生物信息学分析

目的基于芯片数据采用生物信息学方法,挖掘与妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)进展相关的信号通路和潜在差异表达基因。方法在GEO数据库中筛选GDM表达谱芯片数据,并通过生物信息学方法进行再次分析。结果在GEO数据库获得GSE87295、GSE51546芯片数据,将共同差异表达基因信号通路富集获得上皮-间充质转换通路、间充质-上皮转换通路和低氧诱导因子1α转录因子与GDM相关的3条显著相关的信号通路,及调控这些信号通路的13个差异表达基因。通过基于本体的医学信息检索平台(Coremine Medical)发现3个基因与GDM有文献共线相关。通过Gene Mania工具分析发现所有筛选的基因之间都有间接或直接的共表达关系。结论通过对芯片数据再次分析,筛选出3条信号通路及13个差异表达基因与GDM发生发展相关。