胶孢炭疽菌的种内遗传多样性研究

应用RAPD分析对广东不同果树上的胶孢炭疽菌的种内遗传多样性进行研究。结果表明:除部分芒果上的菌株外,20个来源于不同果树上的胶孢炭疽菌都以较高的相似系数聚为一个大群(群I)。说明尽管胶孢炭疽菌具有复合种的性质,但在一定的地理范围内,其遗传背景还是相近的,表现出种的典型特征。6个芒果菌株组成3个小群,且与群I的亲缘关系较远,其分类地位有待进一步明确。

弯孢类炭疽菌菌株的RAPD分析与分类研究

通过RAPD分析对38个不同寄主来源的弯孢类炭疽菌菌株的系统发育及分类进行研究。结果表明:许多引物的RAPD扩增带型在种内是相似或一致的,而种间差异较大。UPGMA聚类分析的结果表明:38个弯孢类炭疽菌菌株被聚为6个类群,群内菌株之间遗传相似性较高,而群间遗传相似性较低;群与群之间分界明显,表明种的分界相当明显。因此,RAPD分析所反映的种间亲缘关系,将有助于疑难种分类地位的确定和近似种的区分。RAPD分析的结果还揭示了一些近似种的分类关系,如按传统方法分别鉴定为Colletotrichumtruncatum、C.circinans和辣椒炭疽菌C.capsici的许多菌株聚类在同一群内,有很高的遗传相似性,实验结果支持它们为同一个种。实验中还发现5条辣椒炭疽菌的特有片断,分别由引物OPE-14、OPH-15(2条)、OPM-12和OPM-20扩增产生。这些特异带的发现对该菌的快速检测和鉴定具有重要意义。

应用RAPD技术快速鉴定蔬菜上的弯孢类炭疽菌

应用筛选的 14个随机引物 ,对分离自广州不同蔬菜上的 12个弯孢炭疽菌菌株进行 RAPD扩增。所有引物对分离自辣椒、香葱等蔬菜上的 11个菌株都产生非常相似甚至一致的扩增带型 ,仅来自姜上的菌株的带型显著不同 ;UPGMA聚类分析将 12个菌株聚为 2群 ,其中 11个菌株 (Cap1～Cap11)以很高的 Dice相似系数 (>82 % )组成一群 ,姜上的菌株 (Cap12 )为另一群。根据这些结果 ,将上述来自辣椒等蔬菜上的 11个菌株鉴定为同一个种——辣椒炭疽菌 (Colletotrichum capsici) ;而姜上的炭疽菌可能是另一个种。结果不支持将来自葱属植物的 3个菌株鉴定为葱炭疽菌 (C.circinans)。

弯孢类炭疽菌rDNA ITS区的RFLP分析及分类研究

应用核糖体 DNA ITS区的 RFLP分析对 3 8个不同寄主来源的弯孢类炭疽菌菌株的遗传多样性和系统发育进行研究。结果表明 :弯孢类炭疽菌的 ITS扩增区 ( ITS4 ～ITS5)约为 65 0 bp,无长度变异。 5种内切酶 ( Alu I、Bsu RI、H in6I、HpaII和 Taq I)的酶切图谱在种内是相似或一致的 ,而种间差异较大。ITS-RFLP共迁带 UPGMA聚类分析的结果表明 :3 8个弯孢类炭疽菌菌株被聚为 6个类群 ,群与群之间分界明显 ,表明种的分界相当明显。ITS-RFLP分析的结果还揭示了一些近似种的分类关系 ,如 ,按传统方法分别鉴定为 Colletotrichum truncatum、C.circinans和 C.capsici的许多菌株有相似或完全一致的内切酶酶切图谱 。

香蕉炭疽菌菌株亲缘关系的RAPD分析

应用筛选的8个Operon随机引物对供试菌株的DNA进行扩增，所产生的RAPD图谱揭示了香蕉炭疽菌具有丰富的种内遗传多样性。UPGMA聚类分析的结果表明：26个香蕉炭疽菌被分为两个与地理来源相关的RAPD聚类群，它们分别由广东菌株和海南菌株为主组成。在两个香蕉菌群的外侧，两个胶胞炭疽菌菌株聚为一个小的外群。这些结果表明香蕉炭疽菌存在有与地域相关的种下类群分化。