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全外显子组测序联合SnaPshot技术分析华南地区汉族人增生性糖尿病视网膜病变的遗传易感性
被引量:
3
1
作者
谢洁
蒋正轩
+4 位作者
张良
崔颖
王军
张爱平
孟倩丽
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期774-779,共6页
目的研究增生性糖尿病视网膜病变(PDR)的遗传易感性。方法采用横断面研究设计,纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例,其中100例糖尿病患...
目的研究增生性糖尿病视网膜病变(PDR)的遗传易感性。方法采用横断面研究设计,纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例,其中100例糖尿病患者和120例PDR患者。采用全外显子组测序技术对22例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者(糖尿病组)和23例PDR患者(PDR组)的外周血样本DNA进行单核苷酸多态性(SNP)、InDel等鉴定,筛选出其中具有显著差异的9个外显子区域位点,采用SnaPshot技术对78例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者和97例PDR患者进行9个位点的SNP分型,并分析其单倍型和连锁不平衡性。结果全外显子组测序检出75个位点SNP与PDR相关联(P<0.01),涉及53个基因,其中11个位点位于外显子区,7个突变属于非同义突变。SnaPshot SNP分型技术验证其中9个显著差异的位点,发现其等位基因及基因型频率在PDR组和糖尿病组中差异无统计学意义(P>0.05),但7种单倍型分布频率差异有统计学意义(P<0.01),其中Hap1和Hap4可能会降低PDR的患病风险[均比值比(OR)<1,P<0.05)],Hap2可能会增加PDR的患病风险(OR>1,P<0.05)。结论华南地区汉族2型糖尿病患者PDR的发生存在遗传易感性。
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关键词
增生性糖尿病视网膜病变
汉族
遗传易感性
外显子组测序
SNAPSHOT
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题名
全外显子组测序联合SnaPshot技术分析华南地区汉族人增生性糖尿病视网膜病变的遗传易感性
被引量:
3
1
作者
谢洁
蒋正轩
张良
崔颖
王军
张爱平
孟倩丽
机构
华南理工大学附属广东省人民医院眼科
广东省
人民医院
眼科
安徽医科
大学
第二
附属
医院
眼科
出处
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期774-779,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81371031);广东省自然科学基金项目(2017A030313609);广东省医学科学技术研究基金项目(A2018401)
文摘
目的研究增生性糖尿病视网膜病变(PDR)的遗传易感性。方法采用横断面研究设计,纳入2011年9月至2012年2月在东莞眼病研究中确诊的2型糖尿病患者和2017年7月至2018年3月在广东省人民医院眼科诊治的相关患者共220例,其中100例糖尿病患者和120例PDR患者。采用全外显子组测序技术对22例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者(糖尿病组)和23例PDR患者(PDR组)的外周血样本DNA进行单核苷酸多态性(SNP)、InDel等鉴定,筛选出其中具有显著差异的9个外显子区域位点,采用SnaPshot技术对78例不伴视网膜病变的2型糖尿病患者和97例PDR患者进行9个位点的SNP分型,并分析其单倍型和连锁不平衡性。结果全外显子组测序检出75个位点SNP与PDR相关联(P<0.01),涉及53个基因,其中11个位点位于外显子区,7个突变属于非同义突变。SnaPshot SNP分型技术验证其中9个显著差异的位点,发现其等位基因及基因型频率在PDR组和糖尿病组中差异无统计学意义(P>0.05),但7种单倍型分布频率差异有统计学意义(P<0.01),其中Hap1和Hap4可能会降低PDR的患病风险[均比值比(OR)<1,P<0.05)],Hap2可能会增加PDR的患病风险(OR>1,P<0.05)。结论华南地区汉族2型糖尿病患者PDR的发生存在遗传易感性。
关键词
增生性糖尿病视网膜病变
汉族
遗传易感性
外显子组测序
SNAPSHOT
Keywords
Proliferative diabetic retinopathy
Han nationality
Genetic susceptibility
Whole exome sequencing
SnaPshot
分类号
R587.2 [医药卫生—内分泌]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
全外显子组测序联合SnaPshot技术分析华南地区汉族人增生性糖尿病视网膜病变的遗传易感性
谢洁
蒋正轩
张良
崔颖
王军
张爱平
孟倩丽
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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