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Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌肿瘤微环境预后机器学习模型及其在单细胞RNA测序中的应用
1
作者
许梦阳
李智伟
+1 位作者
黄平平
周百灵
《德州学院学报》
2024年第6期8-15,共8页
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌(CRC)现有治疗方法有限,肿瘤微环境(TME)在其恶性进展和免疫治疗中起关键作用。基于TCGA(the cancer genome attas)数据,采用NMF(non-negative matrix factorization)方法对TME相关基因进行免疫亚型分类,分析不同亚型的...
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌(CRC)现有治疗方法有限,肿瘤微环境(TME)在其恶性进展和免疫治疗中起关键作用。基于TCGA(the cancer genome attas)数据,采用NMF(non-negative matrix factorization)方法对TME相关基因进行免疫亚型分类,分析不同亚型的TME特征。通过WGCNA(weighted gene co-expression network analysis)方法识别特征基因模块,并整合10种机器学习算法及101种组合,选取最优模型作为CRC患者的TME预后模型。将该模型应用于scRNA-seq数据,揭示高低风险组在功能分析、细胞通信和免疫治疗方面的差异。结果显示,Ⅲ/Ⅳ期CRC样本分为4种免疫亚型,其中C4亚型预后和免疫浸润最差。基于关键基因构建的TME风险模型在训练集和外部验证集上表现良好,揭示高风险肠上皮细胞亚群在TME相关通路的活跃性及药物获益增加。本研究揭示了显著的肿瘤内异质性,并为治疗提供了参考。
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关键词
肿瘤微环境
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌
免疫亚型
预后
机器学习
单细胞转录组测序
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职称材料
腹腔镜右半结肠切除术回结肠端侧吻合和侧侧吻合对术后肠功能和生活质量影响对比研究
2
作者
李智伟
程伟
+5 位作者
戈伟
邵丽华
马晓龙
范圣先
陈刚
王浩
《中国实用外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期937-940,946,共5页
目的比较腹腔镜右半结肠切除术行回结肠端侧吻合和侧侧吻合对病人术后肠功能及生活质量的影响。方法采用回顾性队列研究方法,收集2022年6月至2023年6月南京鼓楼医院结直肠外科收治的右半结肠癌行腹腔镜右半结肠切除术病人的临床资料。...
目的比较腹腔镜右半结肠切除术行回结肠端侧吻合和侧侧吻合对病人术后肠功能及生活质量的影响。方法采用回顾性队列研究方法,收集2022年6月至2023年6月南京鼓楼医院结直肠外科收治的右半结肠癌行腹腔镜右半结肠切除术病人的临床资料。根据回结肠吻合方式的不同,分为端侧吻合组(31例)及侧侧吻合组(64例)。通过术后首次通气时间、术后首次通便时间、腹泻症状和持续时间评估病人术后肠功能,通过胃肠生活质量评分(GIQLI)评价病人术后生活质量,比较两组病人术后肠功能及生活质量的差异。结果两组病人年龄、性别、体重指数、术后病理分期、美国麻醉医师协会分级、术中出血量、清扫淋巴结数、术后并发症发生率和住院时间差异无统计学意义(P>0.05)。端侧吻合组术后首次通气时间[4.0(3.85,4.35)d vs.3.6(3.40,3.725)d]和首次通便时间[4.5(4.30,4.80)d vs.4.1(4.00,4.30)d]晚于侧侧吻合组,差异有统计学意义(P<0.001)。端侧吻合组术后每日腹泻次数[4(3,4)次/d vs.5(4,6)次/d]和术后腹泻持续天数[3.0(2.0,4.0)d vs.4.5(4.0,6.0)d]低于侧侧吻合组,差异有统计学意义(P<0.05)。端侧吻合组术后2周、1个月和3个月的GIQLI评分分别为69.0(65.50,73.50)分、99.0(93.00,100.00)分和110.0(106.50,117.50)分,侧侧吻合组分别为63.0(61.00,67.00)分、76.5(72.50,81.50)分和104.0(96.75,109.25)分,端侧吻合组各时间点GIQLI评分均高于侧侧吻合组,差异有统计学意义(P<0.001)。结论与侧侧吻合相比,端侧吻合可能更有助于改善右半结肠癌病人的术后肠功能和生活质量。
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关键词
腹腔镜右半结肠切除术
端侧吻合
侧侧吻合
肠功能
生活质量
原文传递
题名
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌肿瘤微环境预后机器学习模型及其在单细胞RNA测序中的应用
1
作者
许梦阳
李智伟
黄平平
周百灵
机构
德州
学院
生物物理研究院、山东省生物物理重点实验室
出处
《德州学院学报》
2024年第6期8-15,共8页
基金
山东省自然科学基金面上项目(ZR2023MC186)
国家自然科学基金面上项目(62371091)
大学生创新创业训练计划(S202310448089)。
文摘
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌(CRC)现有治疗方法有限,肿瘤微环境(TME)在其恶性进展和免疫治疗中起关键作用。基于TCGA(the cancer genome attas)数据,采用NMF(non-negative matrix factorization)方法对TME相关基因进行免疫亚型分类,分析不同亚型的TME特征。通过WGCNA(weighted gene co-expression network analysis)方法识别特征基因模块,并整合10种机器学习算法及101种组合,选取最优模型作为CRC患者的TME预后模型。将该模型应用于scRNA-seq数据,揭示高低风险组在功能分析、细胞通信和免疫治疗方面的差异。结果显示,Ⅲ/Ⅳ期CRC样本分为4种免疫亚型,其中C4亚型预后和免疫浸润最差。基于关键基因构建的TME风险模型在训练集和外部验证集上表现良好,揭示高风险肠上皮细胞亚群在TME相关通路的活跃性及药物获益增加。本研究揭示了显著的肿瘤内异质性,并为治疗提供了参考。
关键词
肿瘤微环境
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌
免疫亚型
预后
机器学习
单细胞转录组测序
Keywords
tumor microenvironment
stageⅢ/Ⅳcolorectal cancer
immune subtype
prognosis
machine learning
scRNA-seq
分类号
R857.3 [医药卫生—航空、航天与航海医学]
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职称材料
题名
腹腔镜右半结肠切除术回结肠端侧吻合和侧侧吻合对术后肠功能和生活质量影响对比研究
2
作者
李智伟
程伟
戈伟
邵丽华
马晓龙
范圣先
陈刚
王浩
机构
南京中医药大学鼓楼临床医学院结直肠外科
南京
大学
医学院
附属
鼓楼
医院
结
直肠
外科
出处
《中国实用外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期937-940,946,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.81800452)
南京鼓楼医院临床研究专项资金资助项目(No.2023-LCYJ-PY-10)
南京大学中国医院改革发展研究院课题项目(No.NDYGN2023005)。
文摘
目的比较腹腔镜右半结肠切除术行回结肠端侧吻合和侧侧吻合对病人术后肠功能及生活质量的影响。方法采用回顾性队列研究方法,收集2022年6月至2023年6月南京鼓楼医院结直肠外科收治的右半结肠癌行腹腔镜右半结肠切除术病人的临床资料。根据回结肠吻合方式的不同,分为端侧吻合组(31例)及侧侧吻合组(64例)。通过术后首次通气时间、术后首次通便时间、腹泻症状和持续时间评估病人术后肠功能,通过胃肠生活质量评分(GIQLI)评价病人术后生活质量,比较两组病人术后肠功能及生活质量的差异。结果两组病人年龄、性别、体重指数、术后病理分期、美国麻醉医师协会分级、术中出血量、清扫淋巴结数、术后并发症发生率和住院时间差异无统计学意义(P>0.05)。端侧吻合组术后首次通气时间[4.0(3.85,4.35)d vs.3.6(3.40,3.725)d]和首次通便时间[4.5(4.30,4.80)d vs.4.1(4.00,4.30)d]晚于侧侧吻合组,差异有统计学意义(P<0.001)。端侧吻合组术后每日腹泻次数[4(3,4)次/d vs.5(4,6)次/d]和术后腹泻持续天数[3.0(2.0,4.0)d vs.4.5(4.0,6.0)d]低于侧侧吻合组,差异有统计学意义(P<0.05)。端侧吻合组术后2周、1个月和3个月的GIQLI评分分别为69.0(65.50,73.50)分、99.0(93.00,100.00)分和110.0(106.50,117.50)分,侧侧吻合组分别为63.0(61.00,67.00)分、76.5(72.50,81.50)分和104.0(96.75,109.25)分,端侧吻合组各时间点GIQLI评分均高于侧侧吻合组,差异有统计学意义(P<0.001)。结论与侧侧吻合相比,端侧吻合可能更有助于改善右半结肠癌病人的术后肠功能和生活质量。
关键词
腹腔镜右半结肠切除术
端侧吻合
侧侧吻合
肠功能
生活质量
Keywords
laparoscopic right hemicolectomy
end-side anastomosis
side-side anastomosis
intestinal function
quality of life
分类号
R6 [医药卫生—外科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌肿瘤微环境预后机器学习模型及其在单细胞RNA测序中的应用
许梦阳
李智伟
黄平平
周百灵
《德州学院学报》
2024
下载PDF
职称材料
2
腹腔镜右半结肠切除术回结肠端侧吻合和侧侧吻合对术后肠功能和生活质量影响对比研究
李智伟
程伟
戈伟
邵丽华
马晓龙
范圣先
陈刚
王浩
《中国实用外科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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