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题名烟曲霉的细胞外囊泡蛋白质及RNA分析
被引量:1
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作者
陈晨
贺彬婵
朱益敏
赵蓓蕾
陈菲
徐小勇
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机构
东部战区总医院呼吸与危重症医学科
南京中医药大学第二附属医院江苏省第二中医院呼吸与危重症医学科
南京中医院大学附属南京医院(南京市第二医院)结核四科
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出处
《中国真菌学杂志》
CSCD
2022年第1期8-11,26,共5页
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文摘
目的分析烟曲霉的细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)中的重要成分,以进一步明确曲霉致病机制。方法通过离心法分离烟曲霉的囊泡,用电镜观察形态。采用马尔文纳米颗粒跟踪分析仪分析溶液中EVs的大小分布。通过质谱仪对囊泡内处理后的肽段进行分析。二级质谱数据使用Maxquant(v1.5.2.8)进行检索。检测RNA分布,通过数据库分析烟曲霉EVs中miRNA可能参与的一些通路。结果电镜下烟曲霉的EVs可见明显的双层脂质结构。NTA发现烟曲霉分析的EVs大小主要集中在130 nm左右。EVs蛋白中不稳定蛋白为9种(15%),其余为稳定蛋白,而等电点(isoelectric point,PI)>7的为6种蛋白。EVs中大部分是胞浆蛋白,其余比较多的是细胞外分泌蛋白,但仍有25%的蛋白不能定位。通过跨膜蛋白预测(transmembrane prediction,TMPred)和糖基磷脂酰肌醇(glycosylphosphatidylinositol,GPI)预测,有5种蛋白存在于双层脂质膜上的蛋白。检测到RNA中rRNA和tRNA分别占59.7%和29.4%,而miRNA占0.25%,发现EVs-miRNA主要可能影响代谢通路。结论我们证实了烟曲霉也能分泌EVs,其中位直径为130 nm,含有较多种蛋白,以烟曲霉胞浆蛋白为主,RNA以rRNA和tRNA为主,而其中miRNA可能涉及多种信号通路。
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关键词
烟曲霉
细胞外囊泡
蛋白质组学
RNA组学
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Keywords
Aspergillus fumigatus
extracellular vesicles(EVs)
proteomics
RNomics
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分类号
R379.6
[医药卫生—病原生物学]
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