解淀粉芽胞杆菌SQR9亲缘识别与辨别相关基因的筛选

[目的]依据不同基因突变体的群集运动表型研究解淀粉芽胞杆菌SQR9中参与亲缘识别和辨别过程的关键基因。[方法]利用带有mariner转座元件的穿梭质粒pMarA,构建菌株SQR9的突变体文库,同时结合实验室已保存突变体,通过Swarming平板对峙表型进行筛选,找到与菌株SQR9和FZB42表型发生变化的突变株。针对Swarming表型变化转座子突变株,利用反筛标记pheS进行基因无痕敲除验证与表型验证。[结果]敲除菌株SQR9的sinR、fliD、flhO和degU基因后影响其亲缘识别野生型亲本菌株的能力。定点敲除菌株SQR9的flhO基因后发现,Swarming表型与Tn转座插入突变体一致,都与野生型菌株SQR9形成边界表型,可能参与亲缘识别过程。敲除spo 0A调控基因显著影响菌株SQR9的功能,其与解淀粉芽胞杆菌FZB42的对峙边界表型消失,可能参与非亲缘排斥。[结论]解淀粉芽胞杆菌SQR9中全局性调控基因(spo 0A、sinR和degU)、鞭毛蛋白合成相关基因(fliD和flhO)、芽孢萌发基因(gerAA和gerAB)、抗生素合成基因(srfAA)及其他基因(patB和yugK)可能参与菌株SQR9的亲缘识别与辨别系统。