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三种不同分子标记技术对灵芝单核体多态性的研究
被引量:
2
1
作者
徐凯
唐传红
+4 位作者
张劲松
杨焱
唐庆九
刘艳芳
赵明文
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第15期175-179,共5页
为了探讨灵芝Ganoderma.lucidum原生质体单核体间遗传多态性,为育种材料的筛选提供分子水平依据。运用ISSR、SRAP、RAPD3种分子标记技术对制得的34株灵芝单核体进行了遗传多样性分析和聚类分析。结果显示,三种分子标记技术共扩增出347...
为了探讨灵芝Ganoderma.lucidum原生质体单核体间遗传多态性,为育种材料的筛选提供分子水平依据。运用ISSR、SRAP、RAPD3种分子标记技术对制得的34株灵芝单核体进行了遗传多样性分析和聚类分析。结果显示,三种分子标记技术共扩增出347条条带,多态性条带为308条,多态比率为88.76%,其中ISSR-PCR扩增效果较好,多态性条带和多态比率最高;119-123与其余菌株相异系数最大,或已发生基因突变。根据综合分析结果,在相异系数为0.67时,可以把剩余33株菌株分为两大类群,Ⅱ类含5株菌株,分别为119-180、119-210、119-212、G0119和119-214,剩余的28株菌株为Ⅰ类。研究表明,ISSR、SRAP和RAPD分子标记可用于灵芝单核体多态性研究,这将为育种材料的筛选提供帮助,减少育种工作量和风险。
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关键词
灵芝
分子标记
遗传多态性
下载PDF
职称材料
灵芝基因组SSR位点分布与分析
被引量:
7
2
作者
徐凯
张劲松
+5 位作者
唐传红
杨焱
唐庆九
唐川
王天娇
赵明文
《上海农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期32-37,共6页
旨在通过对灵芝基因组SSR位点的统计分析,为担子菌基因组的特征描述、遗传分析及分子标记的筛选提供基础信息。基于数据库中灵芝基因组数据,通过SSR Hunter 1.3软件并结合人工查找的方式分析其SSR数量、组成和位点分布等情况。结果表明...
旨在通过对灵芝基因组SSR位点的统计分析,为担子菌基因组的特征描述、遗传分析及分子标记的筛选提供基础信息。基于数据库中灵芝基因组数据,通过SSR Hunter 1.3软件并结合人工查找的方式分析其SSR数量、组成和位点分布等情况。结果表明:灵芝基因组序列总长度为4.19×107bp,13条染色体共存在3 502个SSR位点,SSR碱基总长度为6.92×104bp,占基因组总数的0.17%,平均每隔11.96 kb存在1个SSR位点,三碱基和六碱基SSR所占比例最大,占基因组内SSR位点总数的74.62%,出现较多的基序为(G)n、(C)n、(GA)n、(CT)n、(GAC)n、(TCG)n、(TAATC)n和(GATGAG)n;三核苷酸、五核苷酸和六核苷酸SSR在染色体水平上分布较均匀,而单核苷酸、二核苷酸和四核苷酸SSR分布差异较大。灵芝基因组内SSR分布呈现一定的规律性,基于基因组数据发掘的SSR位点能够为SSR分子标记的开发提供信息,并有助于灵芝高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能的研究等。
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关键词
灵芝
SSR
分布
位点分析
下载PDF
职称材料
题名
三种不同分子标记技术对灵芝单核体多态性的研究
被引量:
2
1
作者
徐凯
唐传红
张劲松
杨焱
唐庆九
刘艳芳
赵明文
机构
南京农业大学生命科学学院/农业部农业微生物环境工程重点开放实验室
国家食用菌
工程
技术研究中心
/农业部
南方食用菌资源利用
重点
实验室
/上海市
农业
科学
院食用菌研究所
出处
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第15期175-179,共5页
基金
上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2011)第1-2号)资助
文摘
为了探讨灵芝Ganoderma.lucidum原生质体单核体间遗传多态性,为育种材料的筛选提供分子水平依据。运用ISSR、SRAP、RAPD3种分子标记技术对制得的34株灵芝单核体进行了遗传多样性分析和聚类分析。结果显示,三种分子标记技术共扩增出347条条带,多态性条带为308条,多态比率为88.76%,其中ISSR-PCR扩增效果较好,多态性条带和多态比率最高;119-123与其余菌株相异系数最大,或已发生基因突变。根据综合分析结果,在相异系数为0.67时,可以把剩余33株菌株分为两大类群,Ⅱ类含5株菌株,分别为119-180、119-210、119-212、G0119和119-214,剩余的28株菌株为Ⅰ类。研究表明,ISSR、SRAP和RAPD分子标记可用于灵芝单核体多态性研究,这将为育种材料的筛选提供帮助,减少育种工作量和风险。
关键词
灵芝
分子标记
遗传多态性
Keywords
Ganoderma lucidum
molecular markers
genetic diversity
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
灵芝基因组SSR位点分布与分析
被引量:
7
2
作者
徐凯
张劲松
唐传红
杨焱
唐庆九
唐川
王天娇
赵明文
机构
国家食用菌
工程
技术研究中心
/农业部
南方食用菌资源利用
重点
实验室
/国家食用菌加工技术研发分中心/上海市
农业
遗传育种
重点
实验室
/上海市
农业
科学
院食用菌研究所
南京农业大学生命科学学院/农业部农业微生物环境工程重点开放实验室
出处
《上海农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期32-37,共6页
基金
上海市科技兴农重点攻关项目"食用菌重要功能基因的发掘和新品种培育"[沪农科攻字(2011)第1-2号]
文摘
旨在通过对灵芝基因组SSR位点的统计分析,为担子菌基因组的特征描述、遗传分析及分子标记的筛选提供基础信息。基于数据库中灵芝基因组数据,通过SSR Hunter 1.3软件并结合人工查找的方式分析其SSR数量、组成和位点分布等情况。结果表明:灵芝基因组序列总长度为4.19×107bp,13条染色体共存在3 502个SSR位点,SSR碱基总长度为6.92×104bp,占基因组总数的0.17%,平均每隔11.96 kb存在1个SSR位点,三碱基和六碱基SSR所占比例最大,占基因组内SSR位点总数的74.62%,出现较多的基序为(G)n、(C)n、(GA)n、(CT)n、(GAC)n、(TCG)n、(TAATC)n和(GATGAG)n;三核苷酸、五核苷酸和六核苷酸SSR在染色体水平上分布较均匀,而单核苷酸、二核苷酸和四核苷酸SSR分布差异较大。灵芝基因组内SSR分布呈现一定的规律性,基于基因组数据发掘的SSR位点能够为SSR分子标记的开发提供信息,并有助于灵芝高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能的研究等。
关键词
灵芝
SSR
分布
位点分析
Keywords
Ganoderma lucidum
SSR
Distribution
Locus analysis
分类号
S567.31 [农业科学—中草药栽培]
S188 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三种不同分子标记技术对灵芝单核体多态性的研究
徐凯
唐传红
张劲松
杨焱
唐庆九
刘艳芳
赵明文
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
下载PDF
职称材料
2
灵芝基因组SSR位点分布与分析
徐凯
张劲松
唐传红
杨焱
唐庆九
唐川
王天娇
赵明文
《上海农业学报》
CSCD
北大核心
2014
7
下载PDF
职称材料
已选择
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