南京医科大学生物化学与分子生物学系

南京医科大学生物化学与分子生物学系是1981年国务院学位办批准的首批硕士学位授权点，2003年被国务院学位委员会批准为博士学位授权点。作为基础医学、生物学博士后科研流动站的主要学科，是江苏省人类功能基因组学重点实验室主要组成部分，为南京医科大学“十三五”校重点学科。

医学分子生物学教学中循序渐进引导学生适应自主学习

为培养医学生临床和科研能力,在医学分子生物学课程中通过循序渐进引导学生自主学习,以文献阅读讲解、PBL来补充课堂讲授,建立新的考核体系来督促教与学,使学生学习积极性提高、教学效果明显改善。

多媒体技术在研究生医学分子生物学教学中的应用

研究生分子生物学理论教学重在及时反映前沿动态,而教材相对滞后;实验教学受条件所限,研究生不易全面掌握各项实验技术.针对这些问题,我们在教学中利用多媒体技术,不断更新并增加教学内容,实现网络教学;利用其直观、生动特点,将教学内容化难为易;培养学生全面掌握实验技术,提高分析问题、解决问题的能力.

虚拟现实技术在分子生物学实验教学中的应用

分子生物学虚拟实验以多媒体编程技术和计算机网络技术为基础，应用大量实验图片、逼真动画和多种视频、音频素材构造了一个仿真的实验环境，采取人机交互方式实施实验，具有交互性、智能性、仿真性、开放性和形象性等特点。分子生物学虚拟实验室已用于课堂教学，在提高分子生物学实验教学效果、增强学生学习兴趣、培养学生创造力和想象力等方面取得了显著效果。

研究生分子生物学实验教学改革探索

为进一步提高研究生分子生物学教学效果,通过理论辅助实验,以科研设计串联实验操作,虚实结合、强化预习与复习,培养学生独立性、主动性,改进考核方法等措施,进行实验教学改革探索。

基于生物信息学分析多囊卵巢综合征中影响卵巢生长发育的关键差异基因

目的采用生物信息学方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中分析发掘有关多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome,PCOS)的重要基因并对其进行富集分析,为研究PCOS的发病机制提供新的靶点。方法首先从GEO数据库选取两个数据集(GSE171431和GSE59456),使用R语言进行差异分析并获取两个数据集共有的差异基因,然后进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia ofGenes and Genomes,KEGG)分析。根据差异倍数和卵巢功能相关(例如排卵、细胞凋亡、卵泡生长和黄体形成等)筛选出候选关键差异基因,构建了PCOS小鼠模型并用实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)法验证这些基因。最后运用比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)查找与基因相关的疾病。结果本研究从两个数据集中筛选出27个共有差异基因,根据差异倍数和卵巢功能确定4个下调基因为候选关键差异基因,分别为分泌卷曲相关蛋白4(secreted frizzled-related protein 4,Sfrp4)、信号素3D(Semaphorin-3D,Sema3d)、FK506结合蛋白5(FK506 binding protein 5,Fkbp5)和丝氨酸蛋白酶35(serine protease 35,Prss35),并在小鼠mRNA水平获得验证。此外,CTD数据库结果显示这些基因与生殖疾病关系密切。结论应用生物信息学技术筛选获得的与PCOS发生发展的4个差异基因,分别是Sfrp4,Sema3d,Fkbp5,Prss35,它们与细胞增殖分化、卵泡生长、排卵及代谢稳态有关。这些候选基因为深入探究PCOS的发病机制提供了相关的前期基础。

基础医学专业生物化学实验教学改革实践

生物化学是基础医学专业非常重要的一门必修课,同时作为一门实验性学科,有着与其他学科不同的实验规程和操作技巧。对基础医学专业的生物化学实验课程的教学内容、方法以及考核方式进行优化,以激发该专业学生的学习兴趣;从各方面发展学生动手操作的技能,并注重培养学生结合理论知识分析解决问题的能力以及严谨求实的科学态度,致力于把基础医学专业学生培养成为富有创新精神和实践能力的高级专门人才。

基于E-learning平台的医学生物化学教学探索

E-lectronic Learning(E-learning)是指在线学习或网络化学习,即在教育领域建立互联网平台,通过网络或者其他数字化媒介进行教与学的一种全新的教学方式。利用其独特的教学平台,E-learning现已经成为课堂教学的一个重要的支撑。生物化学是医学专业学生非常重要的一门必修课,为提高学生的学习兴趣,培养学生自主学习的能力,文章阐述了将E-learning融入生物化学教学的可行性和必要性,着重探讨了该课程E-learning平台的构建以及E-learning在生物化学教学中的优势和存在的问题。

PBL教学模式下结合多媒体的生物化学课程设计

生物化学是医学院校学生就学期间一门非常重要的基础科目,为适应现代医学教育发展,提高教学质量,培养学生综合素质,有必要在教学方法上进行改革。探讨了在医学生物化学的教学中,结合现有的多媒体教学法,将以问题为基础的PBL教学模式应用在生物化学学科的课程设计,为医学生物化学教学方法的改革提供一定的理论依据。

基础医学专业生物化学教学改革探索

生物化学是基础医学专业学生非常重要的一门必修课,对基础医学专业的生物化学理论以及实验课程的教学内容和教学方法进行重新布局和优化,以期激发基础医学专业学生的学习兴趣;提高学生结合理论知识分析并解决问题的能力,培养严谨求实的科学态度和开拓创新的科学思维;全面发展学生动手操作的技能,从而把基础医学专业学生培养成具有扎实的医学基础理论、富有创新精神和实践能力的高级专门人才。

生物化学实验教学改革初探

实验教学是生物化学教学中的重要组成部分,如何提高教学质量是生化教育工作者面临的重要课题。南京医科大学生物化学与分子生物学系在实验内容、教学方式以及考核方法等几方面进行了教学改革,为提高医学院校生化实验教学质量进行了初步探索。

生物化学实验教学中学生科研能力的培养探讨

在教学过程中，利用多种方式培养学生的科研能力已成为高教改革的一个重要目标。在生物化学实验教学中，教师应注重对学生科学态度、创造性思维、批判精神和团队意识的培养，使生物化学实验教学扩展和补充理论教学的同时，也能够提高学生的科研能力。

七年制医学生物化学教学体会

我校已连续五年招收了学硕连读的七年制学生,拟培养高层次的临床医学人才,生物化学是高等医学院校一门重要的医学基础课,其发展速度快,知识信息广,授课难度较大,也是学生普遍反应,难学好的一门课程[1].近几年随着生物化学和分子生物学学科的发展,教科书中又增加了遗传信息的传递和表达,基因表达的调控,基因诊断及基因治疗等分子生物学范畴方面的内容,使教与学两方面都增加了难度[2].加之目前还没有配套的七年制教学的理论和实验教材,所以如何提高七年制教学质量是一个值得商榷的问题,根据笔者五年的教学实践,对生物化学理论和实验教学谈几点体会.

生物化学实验教学中因专业施教的探讨

随着医学教学改革的深入与细化,如何针对不同专业的医学生调整生物化学实验的教学设计与教学方式,已成为目前改革中不得不思考的问题。对于临床专业的学生,教师应将教学与临床结合,加深学生对生物化学内容的学习与掌握,并了解如何运用这些知识。而对于基础专业的学生,则应重点培养他们的科研能力。

小鼠PNPLA7敲降重组腺病毒的构建及其生物学功能的初步研究

目的:构建小鼠PNPLA7基因的敲降重组腺病毒,检测PNPLA7敲降重组腺病毒对小鼠肝脏PNPLA7蛋白的敲降效率及对肝脏甘油三酯含量的影响。方法:将对照si NC以及敲降PNPLA7的siRNA设计为shRNA并插入到pshuttle-CMV-silence穿梭质粒中,挑选克隆并测序鉴定,测序成功后将质粒进行PmeⅠ线性化,转入含有腺病毒骨架p Adeasy的BJ5183感受态细胞中进行同源重组,重组成功后的质粒经PacⅠ线性化转染293A细胞进行腺病毒包装,得到Ad-sh NC对照腺病毒以及AdshPNPLA7敲降腺病毒。通过尾静脉注射腺病毒7 d后根据免疫印迹实验检测小鼠肝脏中PNPLA7敲降效率,同时利用Folch提脂方法提取并检测小鼠肝脏中甘油三酯含量。结果:成功获得对照腺病毒Ad-shNC以及敲降腺病毒Ad-shPNPLA7。通过尾静脉注射进行小鼠肝脏PNPLA7敲降,结果显示Ad-shPNPLA7腺病毒可成功降低PNPLA7的蛋白表达,敲降PNPLA7后引起肝脏甘油三酯含量上调。结论:小鼠PNPLA7的敲降腺病毒构建成功,敲降PNPLA7引起肝脏中甘油三酯含量升高。

苏州地区耐左氧氟沙星无乳链球菌临床分离株分子及质谱学特征分析

目的回顾分析苏州地区临床分离左氧氟沙星耐药无乳链球菌菌株分子及蛋白质谱学特征。方法收集2018年1月至2019年1月临床连续分离非重复耐左氧氟沙星无乳链球菌58株,用PCR法及Sanger基因测序方法检测gyrA、parC和parE基因突变、细菌血清型以及多位点序列分型;用ClinPro Tools 3.0软件对左氧氟沙星耐药菌株蛋白质谱特征峰进行筛选并验证。结果测序检出耐左氧氟沙星菌株以携带gyrA_Ser81Leu+parC_Ser79Tyr+parE_His225Tyr突变为主,占44.8%(26/58),以血清Ⅲ型和ST19型为主,并伴有血清Ⅰb型及ST23型流行;耐药菌株蛋白质谱峰分析显示6894、3445、5076、4544以及3721 m/z为主要特征峰。结论本地区耐左氧氟沙星无乳链球菌主要为gyrA_Ser81Leu+parC_Ser79Tyr+parE_His225Tyr突变,且以血清Ⅲ型及ST19型为主,具有以6894 m/z为代表的质谱特征峰。

Toll样受体3抑制胰岛β细胞生长的分子机制研究

目的:探索Toll样受体3(Toll-like receptor 3,TLR3)在调节大鼠胰岛β细胞株INS-1细胞生长中的作用及其相关机制。方法:采用1%牛血清白蛋白(BSA)代替血清培养12 h使INS-1细胞同步化处于G0期。TLR3的特异性激动剂聚肌胞(polyinosinic-polycytidylic acid,PIC)激活TLR3,26S蛋白酶体抑制剂MG132抑制蛋白酶体活性。MTT法检测细胞活力,流式细胞术测定细胞周期,实时定量RT-PCR、免疫印迹(Western blot)法检测细胞周期相关蛋白Cyclin D1的表达。结果:和对照组相比,PIC呈剂量依赖性抑制INS-1细胞生长活力(P<0.05);PIC能显著阻滞INS-1细胞周期于G1期(P<0.05);PIC处理组Cy-clin D1的mRNA水平无明显变化(P>0.05),但其蛋白水平显著下调(P<0.05);给予蛋白酶体抑制剂MG132预处理能缓解此下调作用。结论:激活的TLR3可能通过蛋白酶体介导的Cyclin D1降解,导致胰岛β细胞G1期阻滞,从而抑制其增殖,参与机体胰岛β细胞整体功能障碍的调节。

氯氮平对斑马鱼心脏发育的影响及机制研究

目的:探索氯氮平(clozapine,CLP)对斑马鱼心脏发育的损伤效应及相关机制。方法:以12.5μmol/L氯氮平(L⁃CLP)及25.0μmol/L氯氮平(H⁃CLP)处理斑马鱼胚胎72 h,显微镜下检测心脏形态、心率、静脉窦⁃动脉球(sinus venosus⁃bulbus arteriosus,SV⁃BA)距离等指标;实时荧光定量聚合酶链反应(RT⁃PCR)检测心脏发育相关基因NKX2.5、Hand2及Cmlc2表达;此外,H⁃CLP组处理24 h后,利用内质网抑制剂4⁃苯基丁酸(4⁃phenylbutyric acid,4⁃PBA)或多巴胺D2受体抑制剂溴隐亭(bro⁃mocriptine,BRC)联合处理48 h后,统计心脏功能指标,检测内质网应激分子(Chop、Bip)及凋亡相关分子(Caspase3、Bax/Bcl2)的表达。结果:CLP剂量依赖性导致斑马鱼心脏结构及功能损伤,Chop、Bip和Caspase3、Bax/Bcl2的表达增加;4⁃PBA及BRC显著缓解CLP诱导的心脏损伤及Chop、Bip、Caspase3、Bax/Bcl2的高表达。结论:CLP导致斑马鱼心脏发育受损,可能与抑制多巴胺D2受体、激发内质网应激有关。

脂肪组织中自噬影响肥胖发病机制的研究进展

肥胖是由于脂肪细胞体积增大和数量增生而引起的脂肪组织异常或过度堆积导致的一种慢性代谢性疾病,由环境因素和遗传因素共同决定。近年来,自噬在调控脂肪细胞数量、脂肪生成和白色脂肪棕色化等过程中的作用引起了广泛关注。文章就脂肪组织中3种不同类型的自噬对脂肪生成、白色脂肪棕色化和脂肪代谢等过程的影响进行系统性总结回顾,旨在阐明自噬对脂肪组织功能及肥胖的影响,进而为肥胖的预防和治疗提供潜在靶点。

VPS13A在3T3-L1脂肪细胞分化过程中的表达及调控研究

目的:明确囊泡分选蛋白13A(vacuolar protein sorting 13 homolog A,VPS13A)在小鼠胚胎成纤维细胞(mouse embry-onic fibroblast cells,3T3-L1)分化过程中的表达水平;探索VPS13A对3T3-L1细胞的影响。方法:利用Western blot及Q-PCR法检测3T3-L1细胞在分化过程中VPS13A的表达,利用CRISPR/Cas9系统构建VPS13A稳定敲降细胞系,Western blot和油红染色检测VPS13A敲降后对3T3-L1细胞分化的影响。结果:VPS13A的表达在3T3-L1分化过程的早期降低,在分化的后期升高。敲降VPS13A后,3T3-L1细胞中脂滴增多,参与调控脂肪细胞分化基因的表达水平升高。结论:在3T3-L1细胞中VPS13A的表达水平在分化过程中被调控,敲降VPS13A可以促进3T3-L1细胞的分化成熟。