背景与目的目前研究认为侧群细胞(side population cell,SP cell)富集了肿瘤干细胞,是肿瘤生长和发展的根源;并且SP细胞对放化疗高度耐受,成为肿瘤复发转移的重要因素。为此,我们探讨了肺癌SP细胞与非SP细胞(non-SP)miRNA分子表达谱差异...背景与目的目前研究认为侧群细胞(side population cell,SP cell)富集了肿瘤干细胞,是肿瘤生长和发展的根源;并且SP细胞对放化疗高度耐受,成为肿瘤复发转移的重要因素。为此,我们探讨了肺癌SP细胞与非SP细胞(non-SP)miRNA分子表达谱差异,旨在为进一步研究miRNA在肺癌干细胞中的作用机制打下基础。方法利用Hoechst33342染料法,通过流式细胞仪紫外激光分选功能分选出A549细胞中的SP细胞和non-SP细胞,分别采用Trizol一步法提取两者的总RNA,利用miRNA芯片检测系统进行miRNA表达谱差异分析。结果肺癌SP细胞和non-SP细胞miRNA表达谱存在明显差异。与non-SP细胞相比,在SP细胞中上调2倍以上的miRNA有9条,下调2倍以上的miRNA有25条。结论差异表达的miRNA可能参与肺癌干细胞的发生发展过程,为进一步揭示肺癌干细胞发生的分子机制提供了依据。展开更多
目的:筛选适用于结直肠癌组织样本的内源性参照基因。方法:以10例结直肠癌患者组织总RNA为研究材料,采用实时定量RT-PCR检测GAPDH、ACTINB、UBC、HRPT1和18S r RNA这5个候选内参基因的表达量,应用ge Norm和Norm Finder两种软件分析选择...目的:筛选适用于结直肠癌组织样本的内源性参照基因。方法:以10例结直肠癌患者组织总RNA为研究材料,采用实时定量RT-PCR检测GAPDH、ACTINB、UBC、HRPT1和18S r RNA这5个候选内参基因的表达量,应用ge Norm和Norm Finder两种软件分析选择最佳内参基因。结果:ge Norm软件发现GAPDH与ACTINB的M值相对最小,为最佳内参基因组合,18S r RNA的M值最大,稳定度最低;而Norm Finder软件分析认为GAPDH表达稳定性最佳,UBC次之。结论:适用于结直肠癌组织样本RT-PCR实验的内参基因为GAPDH,最佳组合为GAPDH与ACTINB,而18S r RNA及HRPT1不是合适的内参基因。展开更多
文摘背景与目的目前研究认为侧群细胞(side population cell,SP cell)富集了肿瘤干细胞,是肿瘤生长和发展的根源;并且SP细胞对放化疗高度耐受,成为肿瘤复发转移的重要因素。为此,我们探讨了肺癌SP细胞与非SP细胞(non-SP)miRNA分子表达谱差异,旨在为进一步研究miRNA在肺癌干细胞中的作用机制打下基础。方法利用Hoechst33342染料法,通过流式细胞仪紫外激光分选功能分选出A549细胞中的SP细胞和non-SP细胞,分别采用Trizol一步法提取两者的总RNA,利用miRNA芯片检测系统进行miRNA表达谱差异分析。结果肺癌SP细胞和non-SP细胞miRNA表达谱存在明显差异。与non-SP细胞相比,在SP细胞中上调2倍以上的miRNA有9条,下调2倍以上的miRNA有25条。结论差异表达的miRNA可能参与肺癌干细胞的发生发展过程,为进一步揭示肺癌干细胞发生的分子机制提供了依据。
文摘目的:筛选适用于结直肠癌组织样本的内源性参照基因。方法:以10例结直肠癌患者组织总RNA为研究材料,采用实时定量RT-PCR检测GAPDH、ACTINB、UBC、HRPT1和18S r RNA这5个候选内参基因的表达量,应用ge Norm和Norm Finder两种软件分析选择最佳内参基因。结果:ge Norm软件发现GAPDH与ACTINB的M值相对最小,为最佳内参基因组合,18S r RNA的M值最大,稳定度最低;而Norm Finder软件分析认为GAPDH表达稳定性最佳,UBC次之。结论:适用于结直肠癌组织样本RT-PCR实验的内参基因为GAPDH,最佳组合为GAPDH与ACTINB,而18S r RNA及HRPT1不是合适的内参基因。