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人微小病毒B19荧光定量聚合酶链式反应检测方法的建立
1
作者
许良云
张其刚
+1 位作者
范广来
赵建华
《实用临床医药杂志》
CAS
2021年第7期11-14,20,共5页
目的建立可同时检测各型人微小病毒B19(HPV B19)的荧光定量聚合酶链式反应(PCR)方法。方法运用在线工具MAFFT比对分析3种基因型的HPV B19代表病毒株NS1区域序列,针对保守区序列设计特异性的引物和探针。建立检测HPV B19实时荧光定量PCR...
目的建立可同时检测各型人微小病毒B19(HPV B19)的荧光定量聚合酶链式反应(PCR)方法。方法运用在线工具MAFFT比对分析3种基因型的HPV B19代表病毒株NS1区域序列,针对保守区序列设计特异性的引物和探针。建立检测HPV B19实时荧光定量PCR方法,并对该方法的敏感性和特异性进行评估。结果1×10^(7)~1×10^(2)拷贝/μL以及20拷贝/μL质粒DNA模板绘制的标准曲线,反应效率E为0.946,R^(2)值为0.9966;本方法的检测下限为10拷贝/μL,定量下限为20拷贝/μL。单纯疱疹病毒(HSV)2型、巨细胞病毒(CMV)、B族链球菌(GBS)、乙型肝炎病毒(HBV)、EB病毒(EBV)的阳性DNA病毒检测结果均为阴性,参考质粒及HPV B19阳性样本正常扩增。结论建立的荧光定量PCR检测方法具有较好的敏感性和特异性,可运用于HPV B19感染的筛查和诊断。
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关键词
人微小病毒B19
荧光定量聚合酶链式反应
标准曲线
序列
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职称材料
题名
人微小病毒B19荧光定量聚合酶链式反应检测方法的建立
1
作者
许良云
张其刚
范广来
赵建华
机构
南京医科大学第四临床医学院附属肿瘤医院
江苏省淮安市妇幼保健院基因检测技术应用示范中心
出处
《实用临床医药杂志》
CAS
2021年第7期11-14,20,共5页
文摘
目的建立可同时检测各型人微小病毒B19(HPV B19)的荧光定量聚合酶链式反应(PCR)方法。方法运用在线工具MAFFT比对分析3种基因型的HPV B19代表病毒株NS1区域序列,针对保守区序列设计特异性的引物和探针。建立检测HPV B19实时荧光定量PCR方法,并对该方法的敏感性和特异性进行评估。结果1×10^(7)~1×10^(2)拷贝/μL以及20拷贝/μL质粒DNA模板绘制的标准曲线,反应效率E为0.946,R^(2)值为0.9966;本方法的检测下限为10拷贝/μL,定量下限为20拷贝/μL。单纯疱疹病毒(HSV)2型、巨细胞病毒(CMV)、B族链球菌(GBS)、乙型肝炎病毒(HBV)、EB病毒(EBV)的阳性DNA病毒检测结果均为阴性,参考质粒及HPV B19阳性样本正常扩增。结论建立的荧光定量PCR检测方法具有较好的敏感性和特异性,可运用于HPV B19感染的筛查和诊断。
关键词
人微小病毒B19
荧光定量聚合酶链式反应
标准曲线
序列
Keywords
human parvovirus B19
fluorescent quantitative polymerase chain reaction
standard curve
sequence
分类号
R372 [医药卫生—病原生物学]
R373 [医药卫生—病原生物学]
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作者
出处
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1
人微小病毒B19荧光定量聚合酶链式反应检测方法的建立
许良云
张其刚
范广来
赵建华
《实用临床医药杂志》
CAS
2021
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