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hsa-miR-17-92 cluster及其同源体靶基因的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
史春梅
徐广峰
+5 位作者
陈玲
赵亚萍
倪毓辉
杨蕾
季晨博
郭锡熔
《中华实用儿科临床杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期496-500,共5页
目的对hsa-miR-17-92duster及其同源体进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程,为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法1.应用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92cluste...
目的对hsa-miR-17-92duster及其同源体进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程,为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法1.应用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92cluster及其同源体的所有研究,综述已有研究进展;2.应用miRBase获取hsa-miR-17-92cluster及其同源体的各成员序列,并分析其序列特征及保守性;3.应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)blast、NCBImapviewer、基因组生物信息学(UCSC)Browser工具分析hsa-miR-17-92 cluster及其同源体所在基因组的序列特征;4.应用TargetScan5.1,PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92cluster及其同源体靶基因,取三者预测结果的交集,进一步进行功能注释和Pathway富集分析。结果1.现有研究提示hsa-miR-17-92 cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤疾病、心脏及肺发育、免疫系统与血管形成等生物学过程中有重要作用;2.hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守,根据种子序列同源性可分为4类,且在多物种问非常保守;3.hsa.miR-17-92 cluster及其同源体预测靶基因的功能与细胞周期、细胞黏附、Wnt、TGF-β信号、p53、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路有较大的相关性,可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路。结论通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析,初步阐明了hsa-miR一17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征,并为hsa-miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索。
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关键词
hsa-miR-17-92
CLUSTER
生物信息学
脂肪细胞
肥胖
原文传递
题名
hsa-miR-17-92 cluster及其同源体靶基因的生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
史春梅
徐广峰
陈玲
赵亚萍
倪毓辉
杨蕾
季晨博
郭锡熔
机构
南京医科大学附属南京妇幼保健院儿童保健科、南京医科大学儿科研究所
解放军第八十二医
院
检验
科
出处
《中华实用儿科临床杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期496-500,共5页
基金
国家自然科学基金(81100618,81170797)
江苏省医学创新团队项目(LJ201108)
+2 种基金
江苏省自然科学基金(BK2011107)
南京市科技发展计划(201104013)
江苏省研究生培养创新工程(CXLX120559)
文摘
目的对hsa-miR-17-92duster及其同源体进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程,为深入研究其在脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法1.应用PubMed、Google等信息搜索工具查找hsa-miR-17-92cluster及其同源体的所有研究,综述已有研究进展;2.应用miRBase获取hsa-miR-17-92cluster及其同源体的各成员序列,并分析其序列特征及保守性;3.应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)blast、NCBImapviewer、基因组生物信息学(UCSC)Browser工具分析hsa-miR-17-92 cluster及其同源体所在基因组的序列特征;4.应用TargetScan5.1,PicTar及miRanda预测hsa-miR-17-92cluster及其同源体靶基因,取三者预测结果的交集,进一步进行功能注释和Pathway富集分析。结果1.现有研究提示hsa-miR-17-92 cluster及其同源体在脂肪细胞分化、肿瘤疾病、心脏及肺发育、免疫系统与血管形成等生物学过程中有重要作用;2.hsa-miR-17-92 cluster及其同源体进化上高度保守,根据种子序列同源性可分为4类,且在多物种问非常保守;3.hsa.miR-17-92 cluster及其同源体预测靶基因的功能与细胞周期、细胞黏附、Wnt、TGF-β信号、p53、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路有较大的相关性,可能参与了前列腺癌、胰腺癌、结肠癌等多种疾病通路。结论通过对hsa-miR-17-92 cluster及其同源体系统的生物信息学分析,初步阐明了hsa-miR一17-92 cluster及其同源体的基本生物学特征,并为hsa-miR-17-92 cluster后续研究提供了功能与机制的线索。
关键词
hsa-miR-17-92
CLUSTER
生物信息学
脂肪细胞
肥胖
Keywords
hsa-miR-17-92 cluster
Bioinformatics analysis
Human preadipocytes
Obesity
分类号
Q [生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
hsa-miR-17-92 cluster及其同源体靶基因的生物信息学分析
史春梅
徐广峰
陈玲
赵亚萍
倪毓辉
杨蕾
季晨博
郭锡熔
《中华实用儿科临床杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
1
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已选择
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参考文献
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