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博来霉素诱导肺纤维化小鼠肺组织差异转录因子的筛选与功能分析
被引量:
3
1
作者
沈忱悠
李桂荣
+8 位作者
卫栋
聂晓伟
杨旭生
王伟
江成
盛雅婷
邹建
赵晶晶
陈静瑜
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2022年第8期798-805,共8页
目的 转录因子与特发性肺纤维化(IPF)的关系仍需进一步研究。文章通过筛选博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型肺组织中转录因子表达谱探讨转录因子在IPF发生中的潜在调控作用。方法 SPF级健康雄性C57BL/6小鼠14只,随机分为博来霉素组与对照...
目的 转录因子与特发性肺纤维化(IPF)的关系仍需进一步研究。文章通过筛选博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型肺组织中转录因子表达谱探讨转录因子在IPF发生中的潜在调控作用。方法 SPF级健康雄性C57BL/6小鼠14只,随机分为博来霉素组与对照组,每组7只。博来霉素组按5 mg/kg剂量给予鼻腔滴注博来霉素,对照组给予等剂量等渗盐水。3周后处死全部小鼠,采用Masson染色检测肺部胶原沉积情况。提取肺组织总RNA,使用小鼠转录因子PCR Array筛选差异表达的转录因子,并对表达上调与下调的因子分别进行靶基因预测和功能分析。结果 Masson染色结果显示博来霉素组胶原含量堆积,对照组则无明显异常。PCR Array结果显示,与对照组相比,博来霉素组小鼠肺组织中共检测到1个上调转录因子与5个下调转录因子。差异转录因子共与43个(上调27个,下调16个)靶基因存在调控关系。GO注释与KEGG分析结果显示,上调转录因子主要与调控细胞凋亡进程、细胞质、蛋白结合等功能有关,并在MAPK、PI3K-AKT、FoxO等信号通路中富集;下调转录因子主要与以DNA为模板的转录调控、细胞核、DNA结合等功能有关,并在HIF-1、p53等通路中富集。结论 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中存在EGR1、AR等转录因子的差异表达,后者或可为IPF的临床治疗提供潜在靶点。
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关键词
肺纤维化模型
转录因子
靶基因
生物信息学
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职称材料
题名
博来霉素诱导肺纤维化小鼠肺组织差异转录因子的筛选与功能分析
被引量:
3
1
作者
沈忱悠
李桂荣
卫栋
聂晓伟
杨旭生
王伟
江成
盛雅婷
邹建
赵晶晶
陈静瑜
机构
南京医科大学附属无锡市人民医院器官移植实验室
南京医科大学
附属
无锡市
人民医院
移植
中心
南京医科大学
附属
无锡市
人民医院
检验科
南京医科大学
附属
无锡市
人民医院
临床研究中心
深圳市
人民医院
呼吸疾病研究所
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2022年第8期798-805,共8页
基金
国家自然科学基金(82070059)。
文摘
目的 转录因子与特发性肺纤维化(IPF)的关系仍需进一步研究。文章通过筛选博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型肺组织中转录因子表达谱探讨转录因子在IPF发生中的潜在调控作用。方法 SPF级健康雄性C57BL/6小鼠14只,随机分为博来霉素组与对照组,每组7只。博来霉素组按5 mg/kg剂量给予鼻腔滴注博来霉素,对照组给予等剂量等渗盐水。3周后处死全部小鼠,采用Masson染色检测肺部胶原沉积情况。提取肺组织总RNA,使用小鼠转录因子PCR Array筛选差异表达的转录因子,并对表达上调与下调的因子分别进行靶基因预测和功能分析。结果 Masson染色结果显示博来霉素组胶原含量堆积,对照组则无明显异常。PCR Array结果显示,与对照组相比,博来霉素组小鼠肺组织中共检测到1个上调转录因子与5个下调转录因子。差异转录因子共与43个(上调27个,下调16个)靶基因存在调控关系。GO注释与KEGG分析结果显示,上调转录因子主要与调控细胞凋亡进程、细胞质、蛋白结合等功能有关,并在MAPK、PI3K-AKT、FoxO等信号通路中富集;下调转录因子主要与以DNA为模板的转录调控、细胞核、DNA结合等功能有关,并在HIF-1、p53等通路中富集。结论 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中存在EGR1、AR等转录因子的差异表达,后者或可为IPF的临床治疗提供潜在靶点。
关键词
肺纤维化模型
转录因子
靶基因
生物信息学
Keywords
mouse model of pulmonary fibrosis
transcription factors
target genes
bioinformatics
分类号
R563 [医药卫生—呼吸系统]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
博来霉素诱导肺纤维化小鼠肺组织差异转录因子的筛选与功能分析
沈忱悠
李桂荣
卫栋
聂晓伟
杨旭生
王伟
江成
盛雅婷
邹建
赵晶晶
陈静瑜
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2022
3
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引证文献
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