乙型肝炎病毒标志物临床应用价值探讨

中国是乙型肝炎病毒（HBV）感染高发地区。截止2009年,中国HBV携带者有1.3亿、感染者约9300万、慢性乙型病毒性肝炎（以下简称乙肝）患者约2000万,肝癌发病数占全球的55%[1]。提高乙肝的诊断和治疗水平迫切需要实验室检测指标的合理化选择和应用。

GEO数据库分析环状RNA在乳腺癌组织中的表达

目的采用生物信息学方法探究环状RNA在乳腺癌侵袭转移中的作用。方法从GEO数据库中检索并下载乳腺癌组织的芯片数据,利用R软件对4对Luminal A型乳腺癌组织和4对三阴性乳腺癌组织进行差异分析,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件对差异表达的环状RNA和miRNAs之间的相互作用进行预测。通过TCGA数据库分析环状RNA的亲本基因在乳腺癌组织中的表达。结果通过差异分析,发现共有27个环状RNA异常表达,其中6个环状RNA上调,21个环状RNA下调;通过软件预测构建了环状RNA/miRNAs相互作用网络;通过基因表达分析,hsa_circ_0000965、hsa_circ_0000523、hsa_circ_0044234、hsa_circ_0058451和hsa_circ_0091994可能正向调控其亲本基因的表达。结论在三阴性乳腺癌组织中的异常表达环状RNA将可能成为乳腺癌转移治疗的新靶点。

FOXP3与乳腺癌病理特征和预后的相关性研究

目的探讨FOXP3在乳腺癌组织中的生物学特点,寻找新的肿瘤标志物。方法通过UALCAN、Kaplan-Meier plotter database、Tumor Immune Estimation Resource(TIMER)数据库分析FOXP3在乳腺癌组织中的表达情况;通过免疫组化分析FOXP3在乳腺癌组织中的特点及与免疫细胞标记因子之间的关系。结果FOXP3在乳腺癌组织中表达高于癌旁组织;且在luminal型、HER2阳性型和三阴性3种不同乳腺癌的分子分型中,FOXP3在肿瘤组织的表达均高于癌旁组织,差异均有统计学意义(P<0.05)。相较于癌旁组织,FOXP3在淋巴结转移及远处转移的乳腺癌组织中表达升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。相比于FOXP3低表达组,FOXP3高表达组的总生存率(OS)降低(HR:1.33,P=0.012),而不同乳腺癌亚型中,仅在HER2阳性型乳腺癌患者中FOXP3的高表达组OS降低,差异有统计学意义(P<0.05)。FOXP3与免疫浸润相关,且FOXP3+表达水平与CD3+,CD20+,CD68+有关。FOXP3+表达与淋巴结转移、远处转移、TNM分期有关,差异均有统计学意义(P<0.05),但与乳腺癌肿瘤大小无关,差异无统计学意义(P>0.05)。结论FOXP3在乳腺癌组织中的异常高表达,与肿瘤进展和不良预后有关。

基于GEO数据库分析circRNAs在胃癌组织中的表达

目的通过生物信息学分析环状RNA在胃癌中的作用,以期寻找新的肿瘤标志物。方法从GEO数据库中检索并下载胃癌组织的芯片数据,利用GEO2R在线分析工具在线分析并筛选出差异表达的环状RNA。通过数据对比,提取差异表达一致的环状RNA,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件预测其与miRNAs之间的相互作用。通过TCGA数据库分析亲本基因在胃癌组织中的表达。结果通过对数据库GSE78092、GSE89143和GSE83521进行合并分析,发现差异表达的环状RNA共有498个,上调的环状RNA有125个,下调的有373个;其中至少2个数据库都存在的环状RNA有31个,3个数据库共同包含的环状RNA有2个。通过TCGA数据库分析发现,RPL13、LPHN2和PGPEP1在胃腺癌组织和癌旁组织中的表达无明显差异;而PRKCI、LAPTM4A、PTK2和PDSS1在胃腺癌组织中的表达高于癌旁组织。结论在胃癌组织中异常表达的环状RNA将可能成为胃癌新的标志物。

双荧光素酶报告系统鉴定hsa-miR-4443对TIMP2基因的调控作用

目的通过构建组织基质金属蛋白酶抑制剂-2(tissue inhibitor of metalloproteinase-2,TIMP2)荧光素酶报告基因载体,观察hsa-miR-4443对TIMP2的靶向调控作用。方法生物信息学软件预测hsa-miR-4443与TIMP2 3′端非翻译区(3′untranslated region,3′UTR)的结合位点,设计合成包含hsa-miR-4443结合序列及突变序列的TIMP2基因片段,构建野生型和突变型双荧光素酶报告基因载体,分别与hsa-miR-4443模拟物和阴性对照序列共转染MDA-MB-231细胞,检测荧光素酶活性,观察hsa-miR-4443对TIMP2表达的影响。结果生物信息学分析显示在TIMP2 3′UTR有3个hsa-miR-4443的潜在结合位点,酶切和测序结果均提示3个结合位点的野生型和突变型荧光素酶报告载体构建成功。hsa-miR-4443可通过第1个结合位点抑制野生型TIMP2载体的荧光素酶的表达,而对突变型载体的荧光素酶表达无影响(P=0.002)。结论 hsa-miR-4443可以靶向调控TIMP2的表达。

江苏地区肿瘤患者临床分离菌耐药性分析

目的分析江苏地区肿瘤患者临床分离菌分布特点及耐药率。方法收集2021年“江苏省细菌耐药监测网”肿瘤患者临床分离菌耐药监测数据,结果判断参照CLSI 2021年版标准,用WHONET 5.6软件统计分析。结果收集肿瘤患者分离菌17541株,以革兰阴性菌(76.9%)为主,前5位菌属是大肠埃希菌(22.2%)、克雷伯菌属(19.8%)、铜绿假单胞菌(9.2%)、金黄色葡萄球菌(7.9%)和不动杆菌属(7.5%),标本来源前3位是呼吸道(38.4%)、尿液(24.2%)和血液(21.7%);大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为2.6%和8.6%、3.4%和10.2%;鲍曼不动杆菌对所有监测药物的耐药率均<22%;金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性葡萄球菌对甲氧西林耐药株检出率分别为36.2%和66.8%。结论江苏地区肿瘤患者分离菌以革兰阴性菌为主,血流感染率较高,主要分离菌对抗菌药物的耐药率比一般人群低。