长链非编码RNA在食管鳞状细胞癌患者外周血中的表达

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在食管鳞状细胞癌(ESCC)患者外周血中的表达及意义。方法收集南京市第一医院2015年6月至2018年12月期间早期(Ⅰ~Ⅱ)ESCC患者(组别1)、中晚期(Ⅲ~Ⅳ)ESCC患者(组别2)、正常成人(对照组)血清标本各5例,采用TRIzol试剂提取总RNA,将转录得到的cRNA为模板反转录合成cDNA,纯化后荧光标记并与lncRNA芯片进行杂交。两两比较筛选出相对表达量比值在2倍以上且差异有统计学意义的lncRNA作为差异表达的lncRNA。应用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)验证lncTCONS00011689在ESCC样本中的表达情况,并分析其与ESCC患者临床病理特征及预后的关系,随访日期截止2019年12月31日。应用GraphPad Prism 5.0统计学软件分析,采用配对t检验和Log-rank生存分析。结果在组别1比对照组中上调的lncRNA有1 620条,下调的lncRNA有102条。在组别2比对照组中上调的lncRNA有17条,下调的lncRNA有129条。在组别2比组别1中上调的lncRNA有9条,下调的lncRNA有73条。生信数据分析显示这些差异表达基因的功能与细胞间相互作用、代谢、免疫应答、细胞黏附分子等功能均具有显著相关(r>0.99,P<0.05)。不同组别差异表达的lncRNA与差异表达的mRNA共表达分析显示表达结果中关联度最大的前1 000个关系对(r>0.99,P<0.05)。lncTCONS00011689在ESCC患者血浆中表达与正常人比较明显降低,其在ESCC患者血浆中的表达为5.12±0.31,在正常人血浆中的表达为4.03±0.26,差异有统计学意义(t=2.187,P<0.05)。lncTCONS00011689与ESCC临床TNM分期呈负相关(t=2.716,P<0.05),而与年龄、性别、分化程度以及淋巴结转移均无明显相关(P>0.05)。随访结果显示lncTCONS00011689表达低的ESCC患者总生存期相比于高表达的患者更短(F=0.048,P<0.05)。结论建立不同分期的ESCC患者外周血中差异lncRNA表达谱。lncTCONS00011689可作为食管鳞癌诊断、分期及预后监测的血浆分子标志物。