红螯螯虾酚氧化酶原及其特性研究(英文)

采用同源克隆策略和RACE技术,从红螯螯虾Cherax quadricarinatus血细胞中克隆得到酚氧化酶原基因的全长c DNA序列,共2951 bp,开放读码框为1995 bp,编码665个氨基酸。预测的分子量和等电点分别为75.7 k D和6.23。酚氧化酶原含有两个推测的tyrosinase copper-binding motifs(带有六个组氨酸残基)和一个thiol-ester-like motif,这些特征和其他甲壳动物的酚氧化酶原特征相同。红螯螯虾酚氧化酶原氨基酸序列与通讯螯虾Pacifastacus leniusculus、欧洲龙虾Homarus gammarus、美洲龙虾Homarus americanus和克氏原螯虾Procambarus clarkii酚氧化酶原的相似率分别为68%、63%、63%和59%。酚氧化酶原基因双酶切后连接入p ET-28a原核表达载体,转化到大肠杆菌BL21后重组表达酚氧化酶原蛋白。在重组蛋白纯化后,免疫新西兰大耳兔制备得到的酚氧化酶原多克隆抗体,其效价大于1︰12800。红螯螯虾血淋巴、肝和鳃组织中的酚氧化酶原m RNA表达和酚氧化酶活性较高,而神经、心、肠和肌肉中较低。中华绒螯蟹螺原体和嗜水气单胞菌免疫红螯螯虾后,血淋巴细胞、肝和鳃组织中的酚氧化酶原和酚氧化酶活性在免疫后的不同时间均出现了显著性的增加,此结果表明酚氧化酶原和酚氧化酶在红螯螯虾对抗细菌感染的过程中起到重要的免疫作用。此结果为进一步深入研究酚氧化酶原基因和酚氧化酶的功能及其调控机理奠定基础。

中华绒螯蟹与长江华溪蟹胚胎发育相关miRNA识别与比较分析

利用Illumina/Solexa高通量测序技术,开展了中华绒螯蟹和长江华溪蟹胚胎的小RNA深度测序.对测序结果进行生物信息学分析,分别筛选获得中华绒螯蟹的8 569 743条和长江华溪蟹的8 719 465条干净序列(Clean Unique Reads),长度分布在20 nt^22 nt区间内的分别占有30.47%(Ejs-OB:中华绒螯蟹胚胎测序文库)和30.38%(SY-OJC:长江华溪蟹胚胎测序文库).用SOAP程序将小RNA定位到基因组,结果 Ejs-OB中分析筛选出5 745 279个小RNA,其中13 472种小RNA与基因组的序列匹配;SY-OJC中分析筛选出4 397 509个小RNA,其中18 407种小RNA与基因组的序列匹配.分类注释的结果显示,中华绒螯蟹和长江华溪蟹分别有6 293 445(Ejs-OB)和5 596 614(SY-OJC)条miRNA候选序列,但未预测发现新miRNA.在表达水平的差异分析结果中发现miR-1183、miR-1357、miR-1591、miR-2382的表达水平上调且差异显著.在两文库中搜寻到一些共同miRNA*序列,其中miR-139*、miR-1419g*、miR-1798*、miR-202*、miR-2068*和miR-454*也是表达变异较大.这些结果表明,miRNA可能在调控与中华绒螯蟹和长江华溪蟹胚胎发育相关的基因表达中起重要作用.