分析南京市2016—2022年新报告≥18岁学生人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者传播特征,为学生开展艾滋病宣传干预提供依据。整合2016—2022年南京新报告HIV学生感染者和非学生HIV感染者pol区序列,使用BLAST工具搜索LANL HIV database中公开发...分析南京市2016—2022年新报告≥18岁学生人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者传播特征,为学生开展艾滋病宣传干预提供依据。整合2016—2022年南京新报告HIV学生感染者和非学生HIV感染者pol区序列,使用BLAST工具搜索LANL HIV database中公开发表的全球非南京报告感染者序列;使用HIV-TRACE工具在1.0%的成对基因距离阈值下分别构建基础分子传播网络和区域分子传播网络。成功获取南京≥18岁学生感染者序列332条,南京非学生感染者序列1904条,非南京报告感染者序列1698条。332例学生感染者中,感染途径以同性传播为主(96.39%),亚型以CRF01_AE(37.95%)、CRF07_BC(37.65%)和CRF105_0107(10.24%)为主。区域分子传播网络共有890条序列,其中南京学生感染者序列占21.80%,南京报告的非学生感染者序列占39.89%,非南京报告感染者序列占38.31%。CRF105_0107传播簇内感染者中南京报告的非学生感染者占66.95%(81/121),CRF07_BC传播簇非南京报告感染者占56.66%(200/353)。区域分子传播网络内与学生感染者相连接的边数共1644条,本地传播占64.72%,区域传播占35.28%,区域传播以广东省(19.83%)和江苏省其他市(4.50%)为主。综上,南京市≥18岁新报告学生HIV病例HIV-1亚型以CRF01_AE、CRF07_BC和CRF105_0107为主,传播特征以本地传播为主;存在学生与非学生间传播。展开更多
文摘分析南京市2016—2022年新报告≥18岁学生人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者传播特征,为学生开展艾滋病宣传干预提供依据。整合2016—2022年南京新报告HIV学生感染者和非学生HIV感染者pol区序列,使用BLAST工具搜索LANL HIV database中公开发表的全球非南京报告感染者序列;使用HIV-TRACE工具在1.0%的成对基因距离阈值下分别构建基础分子传播网络和区域分子传播网络。成功获取南京≥18岁学生感染者序列332条,南京非学生感染者序列1904条,非南京报告感染者序列1698条。332例学生感染者中,感染途径以同性传播为主(96.39%),亚型以CRF01_AE(37.95%)、CRF07_BC(37.65%)和CRF105_0107(10.24%)为主。区域分子传播网络共有890条序列,其中南京学生感染者序列占21.80%,南京报告的非学生感染者序列占39.89%,非南京报告感染者序列占38.31%。CRF105_0107传播簇内感染者中南京报告的非学生感染者占66.95%(81/121),CRF07_BC传播簇非南京报告感染者占56.66%(200/353)。区域分子传播网络内与学生感染者相连接的边数共1644条,本地传播占64.72%,区域传播占35.28%,区域传播以广东省(19.83%)和江苏省其他市(4.50%)为主。综上,南京市≥18岁新报告学生HIV病例HIV-1亚型以CRF01_AE、CRF07_BC和CRF105_0107为主,传播特征以本地传播为主;存在学生与非学生间传播。