应用cDNA微阵列基因芯片筛选胃低分化腺癌相关基因的研究

背景与目的:胃低分化腺癌癌变的分子机制至今不清楚,关键是未找到与胃低分化腺癌密切相关的基因。本研究拟建立胃低分化腺癌基因表达谱,筛选差异表达基因,进一步分析差异表达基因与胃癌发生、发展关系。方法:用含10000个已知基因的cDNA微阵列分析胃低分化腺癌和癌旁正常胃黏膜基因表达谱的变化,免疫组化研究差异表达基因与胃癌的关系。结果:二倍以上的差异表达基因212个,其中在胃低分化腺中表达上调169个,表达下调43个。S-P免疫组化结果显示:EMS1蛋白表达定位于胞质,呈黄色至棕黄色;EMS1蛋白在20例正常胃黏膜阳性表达率为20%(4/20),在146例胃癌中阳性表达率为89.72%(131/146);EMS1蛋白在胃癌中的表达高于正常胃黏膜(P<0.001)。结论:发现EMS1与胃癌有关,为进一步寻找胃癌相关基因提供了重要的研究线索。

肺癌候选抑瘤基因HLCDG1片段的验证及全长序列的克隆

目的:对肺癌候选抑瘤基因HLCDG1片段(已知序列)进行验证,并克隆其全长cDNA序列。方法:采用RT-PCR和末端快速扩增技术(RACE),对正常人肺组织中HLCDG1基因片段进行验证和克隆其全长cDNA序列,登录基因数据库进行比对分析。结果:从正常人肺组织中钓取到HLCDG1基因未知的3’端和5’端序列分别为1 304 bp和1 548 bp。HLCDG1基因与人酪蛋白激酶Ⅰα(CSNK1A1)基因2号转录变体相似性达99%,score=5 544,E=0。结论:HLCDG1基因为已知的CSNK1A1基因的2号转录变体,可能参与肺癌发生发展。

LCRG1基因5′端调控区域的克隆及活性测定

背景与目的:LCRG1基因的调控机制至今不清楚,本研究拟克隆LCRG1基因的转录起始区上游序列,寻找与其表达有关的调控序列。方法:利用生物信息学技术预测LCRG1基因5′端调控区域的启动子活性区域,采用PCR方法从人基因组DNA中扩增LCRG1基因5′端调控区域1.776kb(-1191bp～+585bp)片段,并将其构建到荧光素酶报告基因pGL3basic载体中。与内参照质粒PhRL-SV40共转染COS7细胞,通过双荧光素酶活性检验测定其启动子活性。结果:成功扩增LCRG1基因5′端调控区域1.776kb(-1191bp～+585bp)片段,测序正确;pGL3-1776启动子活性大约为阳性对照组pGL3-control的0.16倍,为阴性组pGL3basic的35倍。结论:成功克隆LCRG1基因5′端调控区域1.776kb(-1191bp～+585bp),该片段具有启动子活性。