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利用CRISPR/Cas9系统构建稳定敲除anxa6基因的Caco-2细胞株
被引量:
2
1
作者
陈汉宗
梁颂
+6 位作者
黎新月
方宇婷
彭悦景
张宝
赵卫
华颖
万成松
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1217-1229,共13页
【目的】利用CRISPR/Cas9系统构建稳定敲除anxa6基因的Caco-2细胞株,为研究大肠杆菌O157:H7效应蛋白EspF与宿主膜联蛋白A6(ANXA6)相互作用及其致病机制奠定基础。【方法】根据CRISPR/Cas9靶向原理设计并合成3个特异性识别anxa6基因的向...
【目的】利用CRISPR/Cas9系统构建稳定敲除anxa6基因的Caco-2细胞株,为研究大肠杆菌O157:H7效应蛋白EspF与宿主膜联蛋白A6(ANXA6)相互作用及其致病机制奠定基础。【方法】根据CRISPR/Cas9靶向原理设计并合成3个特异性识别anxa6基因的向导RNA(single guide RNA,sgRNA),基于LentiCRISPRv2载体构建LentiCRISPRv2-sgRNA重组质粒,转入293T细胞中,制备sgRNA-Cas9慢病毒,将慢病毒感染Caco-2细胞,经嘌呤霉素筛选阳性细胞,有限稀释法分离培养单克隆细胞,提取单克隆细胞基因组DNA,并对敲除位点附近的DNA片段进行PCR扩增,测序并进行脱靶效应评估;免疫印记法检测ANXA6蛋白表达情况,细胞计数试剂盒8(cell counting kit 8,CCK8)试剂盒检测细胞增殖能力,免疫荧光法检测细胞紧密连接分布情况。【结果】Western blotting及序列测序表明anxa6基因敲除单克隆细胞构建成功;脱靶效应评估结果显示预测的10个脱靶位点均无脱靶现象;基因敲除对细胞增殖能力无明显影响;免疫荧光结果显示,Caco-2及Caco-2anxa6‒/‒细胞紧密连接蛋白ZO-1均沿细胞膜连续分布,结构完整,转染EspF质粒后出现分布不完整、缺口等现象。【结论】成功构建anxa6基因稳定敲除的Caco-2细胞株,初步探索ANXA6蛋白在紧密连接分布中的作用,为进一步研究大肠杆菌O157:H7通过EspF-ANXA6互作介导宿主肠屏障损伤分子机制提供技术支撑。
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关键词
CRISPR/Cas9系统
anxa6
EspF蛋白
CACO-2细胞
紧密连接
原文传递
题名
利用CRISPR/Cas9系统构建稳定敲除anxa6基因的Caco-2细胞株
被引量:
2
1
作者
陈汉宗
梁颂
黎新月
方宇婷
彭悦景
张宝
赵卫
华颖
万成松
机构
南方医科大学
公共
卫生
学院
生物安全
研究
中心
南方医科大学
南方
医院检验医学科
南方医科大学公共卫生学院、广东省热带病研究重点实验室bsl-
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1217-1229,共13页
基金
广东省自然科学基金(2018B030311063)
广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515011240)
国家自然科学基金(32100143)。
文摘
【目的】利用CRISPR/Cas9系统构建稳定敲除anxa6基因的Caco-2细胞株,为研究大肠杆菌O157:H7效应蛋白EspF与宿主膜联蛋白A6(ANXA6)相互作用及其致病机制奠定基础。【方法】根据CRISPR/Cas9靶向原理设计并合成3个特异性识别anxa6基因的向导RNA(single guide RNA,sgRNA),基于LentiCRISPRv2载体构建LentiCRISPRv2-sgRNA重组质粒,转入293T细胞中,制备sgRNA-Cas9慢病毒,将慢病毒感染Caco-2细胞,经嘌呤霉素筛选阳性细胞,有限稀释法分离培养单克隆细胞,提取单克隆细胞基因组DNA,并对敲除位点附近的DNA片段进行PCR扩增,测序并进行脱靶效应评估;免疫印记法检测ANXA6蛋白表达情况,细胞计数试剂盒8(cell counting kit 8,CCK8)试剂盒检测细胞增殖能力,免疫荧光法检测细胞紧密连接分布情况。【结果】Western blotting及序列测序表明anxa6基因敲除单克隆细胞构建成功;脱靶效应评估结果显示预测的10个脱靶位点均无脱靶现象;基因敲除对细胞增殖能力无明显影响;免疫荧光结果显示,Caco-2及Caco-2anxa6‒/‒细胞紧密连接蛋白ZO-1均沿细胞膜连续分布,结构完整,转染EspF质粒后出现分布不完整、缺口等现象。【结论】成功构建anxa6基因稳定敲除的Caco-2细胞株,初步探索ANXA6蛋白在紧密连接分布中的作用,为进一步研究大肠杆菌O157:H7通过EspF-ANXA6互作介导宿主肠屏障损伤分子机制提供技术支撑。
关键词
CRISPR/Cas9系统
anxa6
EspF蛋白
CACO-2细胞
紧密连接
Keywords
CRISPR/Cas9 system
anxa6
EspF proteins
Caco-2 cells
tight junction
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用CRISPR/Cas9系统构建稳定敲除anxa6基因的Caco-2细胞株
陈汉宗
梁颂
黎新月
方宇婷
彭悦景
张宝
赵卫
华颖
万成松
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
原文传递
已选择
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参考文献
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