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基于网络药理学和分子对接探讨番茄红素治疗慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征的作用机制
1
作者
朱晋德
李豫
商学军
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期792-799,共8页
目的:基于网络药理学和分子对接探讨番茄红素治疗慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征(CP/CPPS)的潜在作用机制。方法:利用TCMSP和PharmMapper数据库获取番茄红素的药物靶点基因,在OMIM、Disgenet、Genecards数据库中获取CP/CPPS的治疗靶...
目的:基于网络药理学和分子对接探讨番茄红素治疗慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征(CP/CPPS)的潜在作用机制。方法:利用TCMSP和PharmMapper数据库获取番茄红素的药物靶点基因,在OMIM、Disgenet、Genecards数据库中获取CP/CPPS的治疗靶点基因,利用Venny软件获得两者的共同靶点,应用STRING数据库构建番茄红素治疗CP/CPPS的蛋白互作网络(PPI),再利用Cytoscape软件筛选出核心靶点,运用R软件对共有靶点进行GO功能分析和KEGG通路分析;最后利用AutoDock Tools、Vina及Pymol软件对番茄红素与核心靶点进行分子对接。结果:共获得药物靶点187个,疾病靶点1557个,共同靶点46个。PPI网络分析得到番茄红素治疗CP/CPPS的核心靶点包括ALB、IGF1、EGFR、SRC、CASP3、ESR1等。GO功能分析结果显示共同靶点参与生殖道发育、外源性细胞凋亡信号通路、对活性氧的应答等生物过程。KEGG通路分析提示Ras、PI3K-Akt、Rap1、FoxO、MAPK等信号通路可能与番茄红素治疗CP/CPPS的机制有关。分子对接显示番茄红素与核心靶点均有良好的对接活性。结论:本研究利用网络药理学和分子对接的方法发现番茄红素治疗CP/CPPS的潜在靶点和药物通路,初步揭示其作用机制,为后续的研究提供新的思路。
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关键词
番茄红素
慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征
网络药理学
分子对接
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题名
基于网络药理学和分子对接探讨番茄红素治疗慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征的作用机制
1
作者
朱晋德
李豫
商学军
机构
南方医科大学第一临床医学院/东部战区总医院泌尿外科
出处
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期792-799,共8页
基金
江苏省社会发展面上项目(BE2017724)
2017年度军队计生专项研究任务计划(17JS013)。
文摘
目的:基于网络药理学和分子对接探讨番茄红素治疗慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征(CP/CPPS)的潜在作用机制。方法:利用TCMSP和PharmMapper数据库获取番茄红素的药物靶点基因,在OMIM、Disgenet、Genecards数据库中获取CP/CPPS的治疗靶点基因,利用Venny软件获得两者的共同靶点,应用STRING数据库构建番茄红素治疗CP/CPPS的蛋白互作网络(PPI),再利用Cytoscape软件筛选出核心靶点,运用R软件对共有靶点进行GO功能分析和KEGG通路分析;最后利用AutoDock Tools、Vina及Pymol软件对番茄红素与核心靶点进行分子对接。结果:共获得药物靶点187个,疾病靶点1557个,共同靶点46个。PPI网络分析得到番茄红素治疗CP/CPPS的核心靶点包括ALB、IGF1、EGFR、SRC、CASP3、ESR1等。GO功能分析结果显示共同靶点参与生殖道发育、外源性细胞凋亡信号通路、对活性氧的应答等生物过程。KEGG通路分析提示Ras、PI3K-Akt、Rap1、FoxO、MAPK等信号通路可能与番茄红素治疗CP/CPPS的机制有关。分子对接显示番茄红素与核心靶点均有良好的对接活性。结论:本研究利用网络药理学和分子对接的方法发现番茄红素治疗CP/CPPS的潜在靶点和药物通路,初步揭示其作用机制,为后续的研究提供新的思路。
关键词
番茄红素
慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征
网络药理学
分子对接
Keywords
lycopene
chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome
network pharmacology
molecular docking
分类号
R697.33 [医药卫生—泌尿科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探讨番茄红素治疗慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征的作用机制
朱晋德
李豫
商学军
《中华男科学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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