N-myc下游调控基因家族在肝细胞癌中的诊断及预后价值

目的基于生物信息挖掘技术,分析N-myc下游调控基因(NDRG)家族在肝细胞癌(HCC)患者组织中的表达情况及与病理特征和预后的相关性。方法利用ONCOMINE、GEPIA和Kaplan-Meier Plotter挖掘了HCC患者的NDRG表达和生存数据。共收集419例HCC组织的基因表达数据分析NDRG家族表达差异,将其分为肝癌组(n=369)和正常肝组织组(n=50)。生存分析共收集364例HCC组织的NDRG家族基因表达数据,分为低表达组[NDRG1(212例)、NDRG2(185例)、NDRG3(182例)、NDRG4(184例)]和高表达组[NDRG1(152例)、NDRG2(179例)、NDRG3(182例)、NDRG4(180例)]。计量资料两组间比较采用t检验,多组间比较采用单因素方差分析,进一步比较采用Dunnett-t检验;生存分析采用log-rank检验。结果HCC组织中NDRG1/3的表达水平高于正常肝组织,而NDRG2在癌组织中的表达水平低于正常肝组织(P值均<0.05)。不同病理分期NDRG1/2/3/4表达差异组间比较差异均有统计学意义(F值分别为3.67、2.97、5.51、3.56,P值均<0.05)。生存分析表明,NDRG1/3高转录组与低转录组相比,总生存期(OS)[NDRG1:风险比(HR)=1.75,95%可信区间(95%CI):1.24~2.47,P<0.05;NDRG3:HR=1.83,95%CI:1.28~2.60,P<0.05]和无进展生存期(PFS)(NDRG1:HR=1.39,95%CI:1.03~1.87,P<0.05;NDRG3:HR=1.71,95%CI:1.27~2.30,P<0.05)均显著缩短。NDRG2低转录组和高转录组相比,OS(HR=0.43,95%CI:0.30~0.62,P<0.05)和PFS(HR=0.59,95%CI:0.44~0.80,P<0.05)均显著缩短。NDRG4高低转录组间OS差异无统计学意义(HR=1.4,95%CI:0.99~1.98,P>0.05),高转录组和低转录组相比PFS显著延长(HR=0.53,95%CI:0.39~0.72,P<0.05)。结论NDRG1/3的高表达和NDRG2的低表达可能与HCC进展相关,提示HCC患者预后不良。