热应激对波纹唇鱼免疫功能的影响

为了研究波纹唇鱼对热应激效应的基因表达差异,本研究运用高通量RNA-seq技术在热应激和常温条件下,对波纹唇鱼的基因进行了转录组测序. DEGs鉴定结果表明:1655个基因受热应激诱导后差异表达;GO富集分析显示:表达上调的基因包括MCM、DNA复制起始等与细胞组成和生物过程相关的基因;而表达下调的基因主要集中于ERK等与机体免疫应答相关的因子;实验结果表明:热应激会导致波纹唇鱼免疫应答相关基因的下调,也可能会导致其免疫应答功能的下降.波纹唇鱼在热应激条件下的免疫功能下降可能是导致其死亡的原因,这为波纹唇鱼资源保护和人工养殖技术提供了理论支持.

雌核发育棕点石斑鱼EST-SSR的开发验证

通过人工雌核发育棕点石斑鱼( Epinephelus fuscogutatus)的转录组序列,共获得了24 359 个微卫星位点,棕点石斑鱼转录组的微卫星重复基序具有不同的分布特征,其中以单碱基( 34. 05 %)、二碱基( 37. 58%)和三碱基( 22. 75 %)为主要的EST-SSR基序重复类型.根据微卫星引物设计原则,随机筛选了93 个EST-SSR位点来进行引物合成和多态性检测,最终开发了48 个具有多态性的微卫星标记,并在不同棕点石斑鱼群体中进行了初步的验证.结果显示:每个位点等位基因数( Na)为2 ~ 22,平均等位基因数为9;观测杂合度( Ho)为0. 111 ~ 1. 000,期望杂合度( He)为0. 636 ~ 0. 940;多态信息含量( PIC)为0. 538 ~ 0. 922 个,表明48 个EST-SSR位点均表现出高多态性( PIC > 0. 5).结果表明:基于雌核发育棕点石斑鱼转录组数据,开发微卫星标记是可行的.本研究所开发的具有多态性的微卫星标记可应用于棕点石斑鱼及其近缘种的遗传多样性分析和分子标记辅助育种研究.