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一种基于注意力机制的电子病历中药物词向量转化方法
1
作者
王青华
邵劲松
+5 位作者
张远鹏
姜磊
白鹤鸣
黄勋
徐沪济
王理
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1129-1135,共7页
目的提出一种基于注意力机制的药物词向量生成模型Drug2vec,对药物信息做向量化表示,并与Word2vec和Med2vec模型比较向量转化效果。方法使用注意力机制捕获医疗实体对中心词的作用,提出Drug2vec模型,将非结构化电子病历中的医疗实体转...
目的提出一种基于注意力机制的药物词向量生成模型Drug2vec,对药物信息做向量化表示,并与Word2vec和Med2vec模型比较向量转化效果。方法使用注意力机制捕获医疗实体对中心词的作用,提出Drug2vec模型,将非结构化电子病历中的医疗实体转化为向量。使用包含14219例系统性红斑狼疮(SLE)患者和963个药物实体的数据集测试Drug2vec模型生成词向量的效果,并且与广泛应用的语言概念空间向量转化模型Word2vec和Med2vec进行对比。结果在SLE患者数据集中,Drug2vec模型产生的药物词向量准确度优于Word2vec和Med2vec模型。药物词向量相似度排序结果显示Drug2vec模型产生的向量结果符合临床医师的用药顺序。结论Drug2vec模型可以更精确地利用周围实体修正中心药物实体,从而产生更准确的药物向量。
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关键词
语言概念词向量
注意力机制
系统性红斑狼疮
电子健康病历
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职称材料
题名
一种基于注意力机制的电子病历中药物词向量转化方法
1
作者
王青华
邵劲松
张远鹏
姜磊
白鹤鸣
黄勋
徐沪济
王理
机构
南通
大学
医
学院
医学
信息
系
南通
大学
公共卫生
学院
公共卫生与预防医学
系
海军军医
大学
(第二军医
大学
)长征医院风湿免疫科
清华
大学
精准医学研究院
南通
大学
智能
信息
技术
中心
南通大学信息科学技术学院通讯工程系
出处
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1129-1135,共7页
基金
国家自然科学基金(81873915)
国家重点研发计划(2018YFC0116902)
南通市科技项目(CP12016003)。
文摘
目的提出一种基于注意力机制的药物词向量生成模型Drug2vec,对药物信息做向量化表示,并与Word2vec和Med2vec模型比较向量转化效果。方法使用注意力机制捕获医疗实体对中心词的作用,提出Drug2vec模型,将非结构化电子病历中的医疗实体转化为向量。使用包含14219例系统性红斑狼疮(SLE)患者和963个药物实体的数据集测试Drug2vec模型生成词向量的效果,并且与广泛应用的语言概念空间向量转化模型Word2vec和Med2vec进行对比。结果在SLE患者数据集中,Drug2vec模型产生的药物词向量准确度优于Word2vec和Med2vec模型。药物词向量相似度排序结果显示Drug2vec模型产生的向量结果符合临床医师的用药顺序。结论Drug2vec模型可以更精确地利用周围实体修正中心药物实体,从而产生更准确的药物向量。
关键词
语言概念词向量
注意力机制
系统性红斑狼疮
电子健康病历
Keywords
language concept word vector
attention mechanism
systemic lupus erythematosus
electronic health records
分类号
R197.323 [医药卫生—卫生事业管理]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种基于注意力机制的电子病历中药物词向量转化方法
王青华
邵劲松
张远鹏
姜磊
白鹤鸣
黄勋
徐沪济
王理
《第二军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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