南通市婴幼儿腹泻患者空肠弯曲菌监测结果和耐药性分析

目的:了解南通地区婴幼儿腹泻患者空肠弯曲菌感染和耐药性状况。方法:采集2013-2016年南通地区5岁以下腹泻患儿的粪便样品1 257份,采用荧光定量PCR对粪便样品进行空肠弯曲菌检测,同时参照GB4789.9-2014对空肠弯曲菌进行分离鉴定,采用琼脂扩散法测定分离株的耐药性。结果 :1 257份腹泻患儿粪便中42份空肠弯曲菌核酸阳性,阳性率为3.34%。共分离鉴定出32株空肠弯曲菌,对临床常用的8大类19种抗生素均耐药,从4耐至11耐不等,其中11耐菌株最多,占31.25%。对阿莫西林、头孢拉定、头孢哌酮、头孢克罗、诺氟沙星、环丙沙星、左旋氧氟沙星、萘啶酸、复方新诺明耐药严重,耐药率达80%以上。结论:南通地区婴幼儿存在空肠弯曲菌病流行风险,空肠弯曲菌分离株存在严重的耐药现象。为更好地控制空肠弯曲菌的感染与流行,有必要建立空肠弯曲菌的长期监测系统,并加强抗生素使用的监管。

南通市人群甲型H1N1流感流行监测与分析

目的:了解南通市人群甲型H1N1流感流行规律,为疫情防控提供科学依据。方法:采用荧光定量RT-PCR对哨点医院采集的咽拭子进行甲型H1N1流感病毒的RNA检测,应用统计软件分析流行状况。结果:咽拭子2646份标本中,男性1377份,女性1269份。甲型H1N1标本阳性679份(25.66%)中,男性感染337例(24.47%);女性感染342例(26.95%);感染率性别间差异无统计学意义(P>0.05)。学生1582例感染病例435例(27.50%),其他职业1064例感染244例(22.93%),学生感染率显著高于其他人群(P<0.05)。15～岁250例中感染154例(61.60%),明显高于其他各年龄组(P<0.01)。2009年底疫情达到高峰,分别为11月检测306例,感染155例(50.65%),12月检测371例,感染212例(57.14%)。结论:2009年南通市甲型H1N1流感暴发相对较温和,目前已呈消退趋势,但是否会再次出现甲型流感的大范围暴发值得警惕。

南通市市售食品卫生微生物风险监测评价分析

目的:了解南通市市售食品卫生状况,进行风险评价与预警,为制定有效的监管措施提供依据。方法:采集市售食品11类3309份,根据食品安全国家标准《食品微生物学检验》提供的方法进行检测,并按国家标准进行结果判定。结果:3309份食品,平均合格率为95.13%。其中,调味品、酒和炒货的合格率最理想,均为100%;熟肉制品和豆制品的合格率较低,分别为80.53%和73.06%。结论:南通市市售食品总体卫生状况较好;熟肉制品、豆制品及非定型包装产品存在安全隐患,应加监管。

2021年南通市某养老机构胃肠炎暴发疫情中诺如病毒分子分型分析

目的:分析2021年南通市某养老机构一起胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的分子分型。方法:将收集到的标本采用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)方法检测诺如病毒核酸,阳性标本再进行反转录扩增衣壳区和聚合酶区,扩增产物经凝胶电泳分析后获得特征性条带,对反转录产物进行序列测定,确定基因型,使用MEGA 7.0软件对测序结果进行分析并构建系统发生树。结果:30份肛拭子标本共检出25份诺如病毒,且均为GⅡ,测序成功16株,诺如病毒在线分型工具结果显示为GⅡ.P16-GⅡ.4 Sydney2012和GⅡ.3-GⅡ.P12两种基因型,与MT501844.1(西班牙株)、MT127358.1 GⅡ(韩国株)、MW205667.1(北京株)、MH842259.1(浙江台州株)同源性较高。结论:引起此次胃肠炎事件暴发的是诺如病毒,主要型别为GⅡ.P16-GⅡ.4 Sydney2012和GⅡ.3-GⅡ.P12。

HIV-1/AIDS患者体内CD4+T淋巴细胞水平和艾滋病病毒载量的检测结果分析

目的:探讨人类免疫缺陷病毒,艾滋病病毒-1(Humanimmunodeficiencyvirustype-1,HIV-1)型艾滋病(AcquiredImmureDeficiencySyndrome,AIDS)患者体内CD4^(+)T淋巴细胞水平和艾滋病病毒载量的检测结果分析。方法:回顾性分析2021年1月-2022年12月于南通市疾病预防控制中心收治且确诊为阳性的1000例HIV-1/AIDS患者作为研究对象,对所有患者进行CD4^(+)T淋巴细胞测定。同时检测血浆中HIV-1RNA数量。结果:艾滋病患者男性占比高于女性,且文化程度越低占比越高,多见于35~50岁人群,占比约56.00%,主要传播途径为性传播,占比约72.00%。检验结果表明,随着治疗年份的增长,CD4^(+)T淋巴细胞计数<200的占比呈现逐渐下降的趋势(χ^(2)=8.943,P值=0.031),而CD4^(+)T淋巴细胞计数>350的占比则呈现逐渐上升的趋势(χ^(2)=10.902,P值=0.014)。检验结果表明,随着治疗年份的增长,病毒载量(拷贝/mL)<50的占比呈现逐渐上升的趋势(χ^(2)=17.974,P值<0.001),而病毒载量(拷贝/mL)>5000的占比则呈现逐渐下降的趋势(χ^(2)=17.362,P值<0.001)。结论:由治疗几年后CD4^(+)T细胞水平和艾滋病病毒载量的检测结果可知院内艾滋病的治疗效果显著,但仍应加强艾滋病患者的检测。

2017—2019年海安市市售月饼的微生物学检测分析

目的了解2017—2019年海安市市售月饼中微生物污染状况,分析造成污染的原因,为监管部门制定科学有效的监管措施提供依据。方法根据食品安全国家标准,对2017—2019年收集的212批次月饼进行菌落总数、大肠菌群、霉菌的结果检测,并对检测结果进行统计分析。结果2017—2019年海安市共检测月饼212批次,其中大肠菌群、霉菌指标均在国家标准所规定的安全范围内,菌落总数的合格率依次为91.7%、92.4%、93.2%,差异无统计学意义(χ~2=0.100,P>0.05),其中大型超市监督抽检的月饼菌落总数不合格率(1.3%)低于本地企业委托送检的不合格率(11.0%),差异有统计学意义(χ~2=6.593,P<0.05)。结论对于存在卫生安全隐患的月饼批次,相关部门应进行调查与分析,为月饼生产与管理者提供相应的卫生安全操作指导,确保月饼的卫生质量,减少食源性疾病的发生。

2012—2014年南通市感染性腹泻病毒学监测结果

目的了解病毒对南通市感染性腹泻的影响及其流行规律,为制定病毒性腹泻防治措施提供基础资料。方法采集哨点医院感染性腹泻患者的粪便标本,运用RT-PCR或PCR技术检测诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、札如病毒和腺病毒核酸,利用Excel 2007及SPSS 19.0对资料进行统计和流行病学分析。结果 987份感染性腹泻样品中病毒核酸阳性样品为96份,总阳性率为9.73%,诺如病毒2型的阳性率最高,为5.27%;其次为轮状病毒和星状病毒,分别为2.43%、1.14%;札如病毒、腺病毒和诺如病毒1型检测阳性率较低,分别为0.61%、0.41%和0.30%;混合感染的感染率为0.41%。病毒核酸阳性以诺如病毒2型和轮状病毒为主,分别占阳性总数的52.00%、24.00%。轮状病毒与诺如病毒感染出现的高峰皆为冬春季。结论病毒是南通市感染性腹泻的重要因素之一,诺如病毒和轮状病毒是该地区病毒性腹泻的主要病原,流行季节以冬春季为主。

2014年-2015年南通市手足口病病原学监测结果分析

目的了解南通市手足口病的病原学特征及流行特点,为科学防控手足口病提供依据。方法对采集的咽拭子样品使用磁珠法提取核酸,再用实时荧光定量PCR对核酸进行检测、分型。结果 1 145份咽拭子标本中,肠道病毒核酸总阳性率为48.73%(558/1 145);2015年未分型肠道病毒阳性标本检出率为32.59%,高于2014年(21.89%),差异有统计学意义(χ2=9.55,P<0.01);2014年Cox A16型肠道病毒阳性率(16.37%)高于2015年(8.23%),差异有统计学意义(χ2=11.09,P<0.01);2014年EV71型肠道病毒阳性率(9.43%)高于2015年(8.92%),差异无统计学意义(χ2=0.01,P>0.05)。2014年、2015年未分型肠道病毒构成比分别为45.89%、65.52%,所占比例明显提高。结论引起南通市手足口病流行的主要肠道病原体为未分型肠道病毒;2014年与2015年相比,Cox A16型肠道病毒的阳性检出率有所下降;EV71型肠道病毒的阳性检出率有所提高。根据动态监测结果调整监测及防控策略对手足口病的防控具有重要意义。

南通市鸡源空肠弯曲菌监测结果及耐药性分析

目的了解南通市鸡源空肠弯曲菌流行及耐药性状况,为制定鸡空肠弯曲菌病防治措施提供基础数据。方法采用荧光定量PCR技术检测标本中的空肠弯曲菌,参照GB/T 4789.9—2008的方法进行空肠弯曲菌分离鉴定,运用琼脂扩散法检测分离株的耐药性。结果 415份粪便样品中,57份空肠弯曲菌阳性,总阳性率为13.73%。其中苗鸡粪便、成年鸡肛拭子、鸡场环境样本的阳性率分别为6.49%、21.24%、7.35%,成年鸡肛拭子空肠弯曲菌的阳性率显著高于苗鸡粪便和鸡场环境样品,差异有统计学意义(P<0.01)。46株空肠弯曲菌分离株对临床常用8大类19种抗生素耐药率在80%以上的有10种,分别为头孢拉定、头孢哌酮、头孢克罗、诺氟沙星、环丙沙星、左旋氧氟沙星、萘啶酸、复方新诺明、四环素、强力霉素。耐药菌株的耐药谱主要集中在10耐、11耐、12耐和14耐,达86.96%。结论南通市鸡源空肠弯曲菌检测阳性率较高,存在鸡源空肠弯曲菌病流行隐患;空肠弯曲菌分离株对多种抗生素产生了显著的耐药性,应引起社会各部门的高度重视。

2017—2020年南通市水痘暴发疫情流行病学特征分析

目的 了解2017—2020年南通市水痘暴发疫情的流行病学特征,为制定水痘防控措施提供技术支撑。方法 收集2017—2020年南通市水痘暴发疫情的流行病学资料,利用Excel 2019和SPSS 23.0对资料进行统计和分析。结果 2017—2020年南通市全市上报水痘暴发疫情69起,累及病例3 346例,平均罹患率1.92%,无重症和死亡病例。暴发疫情在时间上呈双峰分布;以城镇小学为主要暴发场所,其次为幼儿园和中学;男女病例比例介于1.03~1.19;年龄中位数(median age,M)=8岁,四分位数间距(interquartile range, IQR)6~10岁。1 381例病例明确接种或未接种过疫苗,其中771例符合突破病例标准,构成比为55.83%,全部接种1剂次疫苗,97.92%的突破病例接种至发病的时间超过5年。使用Python语言提取发病原因,以卫生习惯不良、首发病例未及时隔离等多见。结论 关注2017—2020年南通市水痘暴发疫情流行病学特征,加强高峰期学校的日常监测和疫情处置,建议尽早推进2剂次水痘疫苗免疫。

2016—2017年南通市外环境样本禽流感监测

目的了解南通市活禽养殖及销售环境中禽流感的携带情况及流行规律,为监控和防治人感染禽流感疫情提供基础资料。方法采集活禽养殖场及交易市场外环境标本,运用RT-PCR技术检测甲型流感病毒核酸并分型。结果 602份外环境样本中,检出甲型流感阳性样本89份,阳性率为14.8%;其中33份样本可同时检出2种型别,合并感染的样本中以H7N9和H9N2合并感染居多,共20份,占合并感染总数的60.6%。65份样品中检出H7N9,40份样品中检出H9N2,13份样品中检出H9N9,4份样品中检出H5N1。多种家禽混合样本中禽流感检出率较高,宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭样本以及清洗禽类的污水中检出率较高。结论 H7N9和H9N2为当前本地区禽流感主要型别,流行季节以冬春季为主,对禽类市场、家庭养殖户和养殖场的管控仍需加强。

南通市2018—2020年流感样病例监测结果及与坏境的相关性研究

目的 分析南通市2018—2020年流行性感冒(流感)流行特征及与气象因素的关系,为今后流感防控工作提供依据。方法 对南通市2018—2020年流感样病例(influenza like illness, ILI)进行数据分析,采集咽拭子标本,用实时荧光定量反转录PCR方法检测核酸进行流感病原分析,采用Spearman法进行秩相关分析ILI与气象因素和大气污染物的关系。结果 南通市2018—2020年哨点医院共报告ILI 67 351例,平均ILI就诊比(ILI%)为5.44%,2020年ILI%高达6.28%。ILI报告数和ILI%均呈明显的季节性特征,均在冬季出现高峰。报告的ILI以0~5岁组为主。2018—2020年共采集ILI样本6 746份,检出流感病毒核酸阳性805份,阳性率为11.93%,2020年流感病毒核酸阳性率为5.31%。2018年流感病毒优势毒株为甲型H1N1、乙型Yamagata, 2019年和2020年流感病毒优势毒株均为乙型Victoria。ILI发病率与平均气温和气压变化有一定相关性,即随气温、气压升高,发病率升高;与大气污染物变化也有一定相关性。结论 南通市2020年流感流行强度较2018年和2019年明显降低,ILI%和发病率随气温升高而降低,随气压或污染物浓度的升高而升高。

精神分裂症合并NAFLD患者血清甲状腺激素水平与精神症状的相关性

目的:探讨合并非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的精神分裂症(schizophrenia,SCH)患者甲状腺激素水平与精神症状的相关性。方法:随机筛选2019年1月—2022年4月在南通市第四人民医院精神科住院的SCH患者161例,依据肝脏超声检查结果分为NAFLD组77例和无NAFLD组(对照组)84例。记录两组研究对象的年龄、性别、住院次数、疾病分型等临床资料并检测血清甲状腺激素水平,以阳性与阴性症状量表精神症状量表(positive and negative syndrome scale,PANSS)评估患者精神症状。采用t检验、χ^(2)检验、U检验及Pearson相关性分析等比较两组指标的差异性。结果:NAFLD组总甲状腺素(total thytoxine,TT4)、游离甲状腺素(free thyroxine,FT4)水平显著低于对照组(t=-2.022、-2.106,P<0.05)。PANSS量表分值显示,NAFLD组阴性症状(N总分)显著高于对照组(t=2.118,P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,总体SCH患者TT4与阳性症状(P总分)、一般精神症状(G总分)及PANSS量表总分呈正相关(r=0.158、0.191、0.160,P<0.05),FT4与P总分呈正相关(r=0.159,P<0.05)。NAFLD组TT4与G总分呈正相关(r=0.245,P<0.05)。对照组促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone,TSH)与阴性症状(N总分)呈正相关(r=0.262,P<0.05)。结论:SCH患者体内血清甲状腺激素水平与精神症状相关,合并NAFLD的SCH患者TT4水平低于无NAFLD的SCH患者,且合并NAFLD的SCH患者体内血清TT4水平与一般精神症状有关,而无NAFLD合并的SCH患者TSH水平与阴性症状有关。

2015年南通市流感样病例监测结果

目的了解2015年南通市流行性感冒(流感)的流行规律,为预防和控制流感的流行提供科学依据。方法运用荧光定量PCR法检测流感样病例咽拭子流感病毒核酸,并对检测结果进行统计分析。结果 3 168份流感样病例咽拭子样本中,流感病毒核酸阳性标本282份,阳性率为8.90%;核酸分型以季节性甲型流感H3为主,占95.74%。全年均有病例发生,8月和1月为发病高峰。0~<4岁和≥60岁年龄组发病率较高,阳性率分别为11.59%和13.79%。结论南通市流感流行的季节性特征明显,夏季和冬季发病率较高;儿童、老年易感;应采取针对性的措施控制流感的流行。

基于网络药理学探讨金欣口服液治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的采用网络药理学方法探究金欣口服液治疗新型冠状病毒肺炎的可能性和潜在作用靶点。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选金欣口服液的物质组成分,以口服生物吸收度和成药相似性为限制条件筛选类药性成分及其作用靶点。以规范化的MeSH主题词搜索疾病相关的靶点基因,并对靶点进行蛋白交互作用分析。进一步利用DAVID数据库进行基因本体分析,以类药性成分→基因靶点→作用通路的交互网络分析金欣口服液治疗新型冠状病毒肺炎的可能效应成分和潜在作用靶点。结果金欣口服液中筛选得到129种类药性成分,以苯丙素和脂类成分为主。筛选到类药成分作用于病毒性肺炎相关的靶点基因75个,基因本体分析和交互网络分析结果显示其黄酮类成分和脂质类成分具有抗病毒免疫和抗炎作用。结论金欣口服液具有潜在的抗新型冠状病毒肺炎的作用。

自感染性腹泻样品中分离的副溶血性弧菌菌株特征分析

目的:了解南通市副溶血性弧菌的流行及耐药性状况,为制定食源性疾病防治措施提供基础资料。方法:采集2018—2022年南通市区3家哨点医院食源性腹泻患者的粪便样品,进行副溶血性弧菌分离鉴定、毒力基因检测、脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分子分型及药敏试验,并对感染性腹泻病例涉及的食品分类、食品加工及包装方式、进食场所分布情况进行分析。结果:2040份粪便样品中副溶性弧菌阳性样品有80份,阳性率为3.92%。副溶血性弧菌人群普遍易感,以>30~40岁组居多,季节分布特征为夏秋季出现感染高峰。不耐热溶血素(thermolabile hemolysin,TLH)、耐热直接溶血素(thermostable direct hemolysin,TDH)及耐热相关溶血素(TDH-related hemolysin,TRH)核酸定性检测结果显示,毒力基因型分布集中在TLH+TDH+TRH-型。依据带型完全相同的菌株为同一个PFGE型别,除3条带降解外,其余77株分为76个型别,总体条带相似度为38.3%。副溶血性弧菌对头孢唑啉的耐药率最高,达100%。食源性疾病监测与溯源系统显示主要可疑暴露食品为水产动物及其制品、混合食品和肉与肉制品,高发场所主要为家庭、街头食品及饭店(酒店)。结论:副溶血性弧菌仍是南通市食源性疾病的重要病原菌,流行季节以夏秋季为主。故针对本市食源性疾病暴发流行病学特征,应加强对餐饮服务业的食品安全风险监测,提高监测预警能力,降低食源性疾病事件的发生。

不同免疫缺损状态下HIV-1感染者病毒载量与CD4^(+)/CD8^(+)T淋巴细胞比值相关性

目的:分析不同免疫缺损状态下HIV-1感染者首次病毒载量与CD4^(+)/CD8^(+)T淋巴细胞比值的相关性。方法:新发现HIV-1感染者150例检测首次血浆HIV-1病毒载量、外周血CD4^(+)及CD8^(+)T淋巴细胞计数,计算CD4^(+)/CD8^(+)比值,分析病毒载量与外周血T淋巴细胞相关性。结果:新发现HIV-1感染者中CD4^(+)T淋巴细胞计数<200/mm^(3)38例(25.3%), 200~349/mm^(3) 68例(45.3%),350^(4)99/mm^(3) 34例(22.7%),≥500/mm^(3) 10例(6.7%)。病毒载量<10^(3)CPs/mL5例(3.3%),10^(3)~10^(4) CPs/mL 23例(15.3%),10^(4)~10^(5) CPs/mL 89例(59.4%),10^(5)~10~6 CPs/mL 25例(16.7%),10~6~10~7 CPs/mL8例(5.3%)。CD4^(+)/CD8^(+)比值与轻度免疫缺陷组(r=-0.449,P=0.008)、中度免疫缺陷组(r=-0.249,P=0.041)及重度免疫缺陷组(r=-0.488,P=0.002)病毒载量均呈负相关。CD4^(+)T淋巴细胞计数与轻度免疫缺陷组及中度免疫缺陷组病毒载量无相关性(P>0.05),与重度免疫缺陷组病毒载量呈负相关(r=-0.361, P=0.026)。结论:在艾滋病诊疗过程中联合检测病毒载量及外周血T淋巴细胞有助于指导临床用药和病情监测。

江苏南通地区2023年水痘-带状疱疹病毒序列分析

目的 通过对2023年江苏南通地区水痘疫情中的水痘-带状疱疹病毒(VZV)阳性样本进行基因分型和全基因组序列分析,揭示南通地区VZV的分子流行特征,为水痘疫情防控提供科学依据。方法 收集来自11起突发公共卫生事件的61份咽喉拭子及疱疹液样本,使用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)进行VZV检测。挑选qPCR阳性且Ct值≤30的样本进行ORF22、ORF38、ORF62基因片段扩增和测序,进行基因分型及野毒株、疫苗株鉴定。对Ct值≤25的样本进行全基因组测序,构建系统发生树,并与国产疫苗株Baike的9种核衣壳糖蛋白进行比较分析。结果 样本中VZV阳性率为73.78%(45/61),基因分型结果显示,单核苷酸多态性位点(37902、38019、38055、38081、38177、69424)的核苷酸分别为G、G、C、C、A、G,与Clade 2参考株一致,所有样本均为野毒株。全基因组测序和系统发生树分析进一步确认了这一结果。核衣壳糖蛋白序列比较显示,本地株与疫苗株Baike之间高度保守,其中gK、gN、gL的核苷酸同一性为100%,gH、gM、gE的核苷酸同一性分别为99.88%、99.85%、99.95%,gC、gB、gI的核苷酸同一性范围在99.41%~99.92%。结论 南通地区2023年水痘疫情中的VZV主要属于Clade 2,并且主要为野毒株。现行水痘疫苗具有良好的安全性和有效性,但需关注核衣壳糖蛋白gC、gB、gI的轻微变异。研究结果为VZV的分子流行特征提供了新数据,并为水痘疫情防控措施的制定提供了科学依据。

南通地区腺病毒41型遗传变异及进化特征分析

F亚属的人类腺病毒(Human adenovirus,HAdV)与急性胃肠炎相关,是儿童急性胃肠炎住院的常见病因。本研究收集了712份<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本,检出HAdV-F阳性52例,阳性检出率为7.30%。对Ct值<30的样本进行文库构建及测序,经Blast比对,得到的21条全基因组序列均为HAdV-41。与HAdV-41原型株相比较,Long fiber和Short fiber的核苷酸一致性低于全基因组核苷酸一致性。对HAdV-41全基因组的遗传进化分析显示,其分子进化速率为7.882×10^(-5)替换/位点/年(95%HPD,3.885×10^(-5)~1.234×10^(-4))。本课题研究对南通地区流行的HAdV-41进行了流行病学特征及基因进化特征分析,为南通地区HAdV-41所致疾病防控及病原溯源奠定了基础。

腹泻患者空肠弯曲菌三种检测方法比较

目的了解多重PCR、荧光定量PCR及培养分离法检测腹泻患者空肠弯曲菌的差别及增菌过程对检测结果的影响。方法比较多重PCR、荧光定量PCR及培养分离法对192例腹泻患者粪便标本中空肠弯曲菌的检测率与增菌前后的变化。结果荧光定量PCR的检出率最高(增菌前后分别为5.21%、4.17%),多重PCR次之(增菌前后分别为4.69%、3.65%),培养分离法最低(增菌前后分别为1.04%、3.13%)。结论荧光定量PCR、多重PCR比较适合于空肠弯曲菌的监测检测,多重PCR更适合基层单位应用,培养分离方法适合临床治疗患者使用。增菌对不同方法的检出率有一定的影响,应根据不同的检测目的加以选用。