云南省楚雄市2015-2018年肾综合征出血热流行特征及宿主动物调查

目的调查云南省楚雄市肾综合征出血热(HFRS)流行特征、鼠类分布及其携带汉坦病毒(HV)的分子进化特征。方法收集HFRS病例资料,采用描述流行病学方法进行分析。用笼夜法捕鼠,计算鼠种构成比和鼠密度。鼠肺标本用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测HV核酸及L基因部分片段,并进行序列测定,使用ClastalX 1.83和MEGA 6.0等生物信息学软件进行HV同源性分析和构建系统进化树。结果2015-2018年楚雄市共报告HFRS病例186例,年平均发病率为7.74/10万。楚雄市14个乡镇均有HFRS病例报告,其中鹿城和东瓜镇发病数占发病总数的75.27%(140/186),为主要流行区。全年各月均有病例发生,男女性别比例为2.1∶1,以青壮年和农民居多。2015-2018年的5-10月在楚雄市居住区共捕获鼠类3种1053只,其中褐家鼠、黄胸鼠和斯氏家鼠的构成比依次为97.06%、1.80%和1.14%,鼠密度依次为2.57%、0.05%和0.03%,以鹿城和东瓜镇褐家鼠密度最高(3.09%)。2016年在楚雄市采获的50只褐家鼠肺脏组织标本经RT-PCR检测,HV核酸阳性2份(CX04-06和CX07-09),带病毒率为4.00%。L基因部分序列同源性分析表明,CX04-06和CX07-09病毒株与8株HV汉城型病毒(SEOV)的核苷酸同源性为72.34%~93.52%,其中,与云南省祥云县DLR2株和老挝L0199株同源性最高(92.39%~93.52%),但仍存在明显差异;与汉滩型病毒和普马拉病毒的核苷酸同源性分别仅为69.54%~71.76%和51.19%~54.44%。系统进化分析表明,CX04-06和CX07-09株与来自云南省祥云县和老挝等地的SEOV参考株具有较近的亲缘关系。结论楚雄市HFRS高发,褐家鼠为居民区室内优势鼠种并携带SEOV,流行株具有地域特征。楚雄市HFRS疫情上升与褐家鼠广泛分布及其种群密度增高密切相关。

云南省楚雄州恙虫病流行特征及其病原体东方体基因分型研究

目的调查云南省楚雄彝族自治州(楚雄州)恙虫病流行特征及其恙虫病东方体(Ot)的基因型。方法收集恙虫病病例资料并进行流行病学分析。采集恙虫病患者血液标本,用PCR法检测Ot核酸并测定Tsa56基因序列,用相关生物信息学软件进行同源性和系统进化分析。结果2015-2018年楚雄州共报告恙虫病病例2507例,年平均发病率为22.79/10万。该州所辖10个县(市)均有恙虫病病例报告,其中楚雄、大姚、永仁、南华和双柏县(市)发病数占全州发病总数的96.01%(2407/2507)。7-10月发病数占全年发病总数的88.35%(2215/2507)。病例男女性别比为1∶1.34,30~69岁年龄组发病居多(1966/2507,78.42%),职业分布以农民为主(2129/2507,84.92%)。经PCR检测,从6份恙虫病患者血液标本中检测到Ot核酸阳性4份(CX1601、CX1602、CX1603和CX1604),将获得的Tsa56基因进行测序,同源性和系统进化分析表明,CX1601和CX1604与Ot中的Kato型菌株具有较高的同源性和较近的亲缘关系,CX1602和CX1603则与Gilliam型菌株具有较高的同源性和较近的亲缘关系,而与其他型菌株同源性较低,亲缘关系较远。结论楚雄州恙虫病病原体属于Kato型或Gilliam型,近几年高发并有逐年上升趋势,应加强恙虫病宿主及媒介的监测和防控工作。